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生物反应器代谢物分析的五大传感器

Top 5 Sensors for Metabolite Profiling in Bioreactors

David Bell |

在生物反应器中监测葡萄糖、乳酸和铵等代谢物对于高效培育肉类生产至关重要。实时传感器确保对营养水平的精确控制,提高产量并减少浪费。以下是为此目的量身定制的五大传感器技术:

  • 拉曼光谱: 同时跟踪多种代谢物,具有高精度,提供非接触式监测。
  • 二维荧光光谱: 通过测量内在荧光团检测代谢变化,实现营养和废物跟踪。
  • 近红外(NIR)光谱: 实时分析营养物质和生物质,理想用于维持最佳细胞生长条件。
  • 电化学生物传感器: 提供快速、针对性的特定代谢物检测,如葡萄糖和乳酸。
  • 离子选择性场效应晶体管 (ISFETs): 测量 pH 和离子,直接监测细胞活动和营养成分。

每个传感器都有适合特定生产需求的优势,从非接触选项到直接介质交互。结合这些技术可以实现预测精度并简化生产过程。

1. 拉曼光谱

测量的关键代谢物

拉曼光谱能够同时测量 葡萄糖, 乳酸, 和 甘油。这允许同时跟踪能源来源、代谢副产物和原料。每种化合物都会产生独特的光谱特征,即使在包含氨基酸和有机酸的复杂混合物中也能实现精确识别。

准确性指标

在葡萄糖监测方面,在线拉曼光谱法在0.1–40 g/L的典型范围内实现了0.2009 g/L的预测标准误差(SEP)。对于乳酸,SEP在0.0–5.0 g/L的范围内为0.1166 g/L[7]. 2024年7月,Biophotonics Diagnostics GmbH的研究人员使用Wasatch Photonics 785 nm拉曼光谱仪监测了一项E. coli生物过程。他们报告了主要产品的RMSEP为0.41 g/L,甘油原料为1.45 g/L,基于49个小时样本 [6]. 这些结果强调了拉曼光谱在动态生物反应器环境中的精确性和可靠性。

非侵入性能力

拉曼光谱提供多种部署选项。通过生物反应器视口可以非侵入性地进行测量,保持无菌环境,或者通过可高压灭菌的浸入探头进行测量,这些探头特别适合于密集培养的肉类培养物。其对水的天然不敏感性使其非常适合水性生物工艺,而其他方法通常会受到干扰。现代系统通过快速光谱平均提供近乎即时的反馈,确保即使在苛刻条件下也能有效监测。

培养肉类生物反应器的主要优势

实时反馈能力使拉曼光谱成为扩大培养肉生产的变革者。与离线HPLC, 不同,它提供连续数据而没有污染风险。对于具有高细胞浓度的光学密集介质,建议使用配备蓝宝石球透镜的浸入探头。这些镜头的工作距离约为100 µm,有助于减少光散射,确保在复杂环境中获得准确的读数。

2. 2D-荧光光谱法

测量的关键代谢物

2D-荧光光谱法产生EEMs(激发-发射矩阵),揭示各种代谢物的独特荧光特征。该方法直接检测内源性荧光团,如NADH, 色氨酸, 核黄素, 和吡哆醇. 通过应用化学计量模型,它估算葡萄糖, 乳酸, , 和谷氨酰胺的浓度 - 这些对于跟踪培养肉生物反应器中的细胞生长和代谢至关重要。每种化合物都有独特的光谱峰值,允许在保持无菌条件的同时实时监测营养物质的使用和废物的积累。

准确性指标

2022年6月,拉夫堡大学的研究人员在使用CHO细胞的2升生物反应器中展示了二维荧光光谱的能力。在Karen Coopman博士的指导下,他们在120小时内实现了谷氨酰胺的RMSEP值为0.29 mM,铵的RMSEP值为0.72 mM。这使得实时介质调整成为可能,乳酸水平降低了25%,产量增加了18%。该技术的典型RMSE_CV值为葡萄糖0.15–0.35 mM,乳酸0.12–0.28 mM,铵0.08–0.22 mM。交叉验证结果显示多代谢物偏最小二乘(PLS)模型的R²值超过0.95 [1] .

非侵入性能力

这种技术的非侵入性是生物反应器实时监测的一个主要优势。它使用插入生物反应器端口的光纤探针,确保保持无菌条件。这些探针可以在135°C下灭菌,并在GMP环境中重复使用。该系统每5-10分钟捕获完整光谱,响应时间不到一分钟。这使其成为优化培养肉生产过程的一个优秀工具[3] .

培养肉生物反应器的主要优势

2D-荧光光谱法提供了卓越的灵敏度,可以同时跟踪多种代谢物。其速度和精度解决了培养肉生产过程中监测生物过程的常见挑战。例如,在2023年9月,Ncardia将BioView 2D-荧光光谱法应用于5升生物反应器中,用于iPSC-心肌细胞的生产。该系统预测活细胞密度的误差范围为12%,乳酸测量的R²达到0.97。由Robert Passier博士领导的项目在七天运行中实现了30%更快的优化过程。该技术支持用于补料分批优化的过程分析技术(PAT),使肌肉细胞培养的产量提高了20-30%。[4]. 此外,像Cellbase这样的平台将培养肉行业的专业人士与2D荧光传感器和生物反应器探头的供应商连接起来,确保获得能够实现精确过程控制的工具。

3. 近红外(NIR)光谱

测量的关键代谢物

近红外(NIR)光谱在实时跟踪葡萄糖、谷氨酰胺、乳酸和氨等关键代谢物方面起着至关重要的作用——这些是培养肉成功生长的关键元素。它还通过分析基线光谱数据和光散射来帮助预测pH值和活细胞密度。使用FT-NIR(傅里叶变换近红外),这种方法可以进行精确的化学分析,即使是含量非常少的化合物。监测氨水平尤为重要,因为过量的氨会破坏蛋白质糖基化并损害细胞健康[9].

准确性指标

早在2008年3月,位于犹他州洛根的赛默飞世尔科技的研究人员展示了Thermo Scientific Antaris FT-NIR分析仪的功能。他们使用它来监测一个10升搅拌罐生物反应器,其中含有HEK293细胞. 在11天的时间内每小时收集光谱数据,从而能够预测六个关键成分,其相关系数范围为0.926到0.995。例如,葡萄糖测量的RMSECV(交叉验证的均方根误差)为0.14 g/L,而乳酸测量达到0.11 g/L。活细胞密度显示出强相关性(R = 0.989) 在 0.0 到 9.0 × 10⁶ 个细胞/mL 的范围内。此外,pH 值在 6.7 到 7.3 的范围内监测,RMSECV 为 0.02 [9]. 这些指标突显了该方法在非侵入性和准确监测方面的可靠性。

非侵入性能力

NIR 光谱的在线监测设置,包括循环回路和光学流动池,显著降低了污染风险。此设置允许对营养物质供给和废物管理进行即时调整,帮助避免由于有毒副产物积累导致的反应性能差或细胞死亡等问题 [9].

培养肉生物反应器的主要优势

NIR 光谱实时提供生物过程性能的全面概览。通过覆盖宽光谱范围(4,000 cm⁻¹到10,000 cm⁻¹),它同时分析营养物质、废物和细胞的物理特性。这使其成为过程分析技术(PAT)的重要组成部分,因为它通过持续的数据反馈确保精确的环境条件得以维持。像 Cellbase这样的平台将培养肉专家与NIR光谱和生物反应器监测系统的供应商连接起来,提供详细的多组分分析所需的基本工具——这是监测培养肉生物过程不可或缺的功能[9] .

4. 电化学生物传感器

关键代谢物测量

电化学生物传感器是培养肉生物反应器中实时监测的宝贵工具。这些设备跟踪葡萄糖和乳酸等关键代谢物,这些代谢物对生产过程至关重要。他们通过使用专门的生物识别剂,如葡萄糖氧化酶、抗体或分子印迹聚合物(MIPs),来实现这一目标,这些剂专门与目标代谢物结合。一些先进的系统甚至可以检测微量的必需氨基酸和维生素,提供营养水平的详细图景。

准确性指标

这些生物传感器的性能通过灵敏度(以μA/mM表示)、线性相关系数(R²)和检测限(LOD)等指标进行评估。例如,2013年的一项研究介绍了一种结合乳酸氧化酶和多壁碳纳米管的表皮纹身传感器。在10名健康志愿者骑行测试中,该传感器对1–20 mmol/L范围内的乳酸水平表现出线性响应,并且在运动强度变化时没有明显的响应延迟[12]. 另一个关键指标,选择性系数,衡量传感器在存在干扰物质时保持准确性的能力——这是生物反应器介质复杂环境中的一个重要因素。这些传感器也具有高度适应性,使其适用于各种应用。

侵入性或非侵入性能力

电化学生物传感器可以在侵入性和非侵入性设置中运行。例如,由加州理工学院魏高团队于2022年8月开发的“NutriTrek”贴片,使用激光雕刻的石墨烯电极并增强了MIPs。临床试验表明,该贴片可以在运动期间和进食后实时跟踪氨基酸水平,其汗液浓度与血清水平密切匹配[10][11]. 在生物反应器环境中,这些传感器可以直接集成到培养基中或放置在循环回路中,以减少污染风险,同时确保连续监测。这种双重功能使它们在不同应用中具有高度的多功能性。

培养肉生物反应器的主要优势

电化学生物传感器在培养肉生产中的一个突出好处是它们能够非侵入性地监测氨基酸和维生素。此功能有助于优化昂贵培养基成分的使用,同时避免采样带来的污染。一项研究强调了这一潜力:

"电化学传感器在POCT系统中具有很强的集成潜力,因为它们提供高灵敏度、准确性、特异性、低检测限,可以小型化,具有成本效益,并且用户易于操作。" - 生物设计与制造 [12]

此外,具有原位再生能力的先进传感器通过防止传感器污染来保持其性能 [10][11]. 像 Cellbase 这样的平台将培养肉生产商与这些生物传感器的供应商连接起来,确保获得可靠的技术以精确、实时监测代谢物。

5. 离子选择场效应晶体管 (ISFETs)

测量的关键代谢物

ISFETs 通过使用阈值电压调制将离子浓度的变化转化为电信号。它们在测量 pH(H⁺ 离子)、葡萄糖和关键电解质如钾(K⁺)、钠(Na⁺)和钙(Ca²⁺)方面特别有效。除此之外,它们通过检测由溶解的CO₂引起的pH变化来监测细胞呼吸,这是细胞活动的直接结果。此外,ISFETs可以测量蛋白质(抗原/抗体)和酶驱动的反应产物,使其在跟踪培养肉生物反应器中的生长因子或特定代谢过程方面非常有价值。这种实时、精确的监测完全符合培养肉生产的需求。

准确性指标

ISFETs以其卓越的灵敏度和低检测限而闻名,这使得对生物过程的严格控制成为可能。例如,它们可以检测低至10⁻⁸ M的葡萄糖浓度和具有类似精度的钾离子。在生物分子方面,它们可以识别低至10⁻¹⁴ g/mL的蛋白质浓度和低至10⁻¹⁵ M的DNA。其快速响应时间和高灵敏度使其非常适合生物反应器内不断变化的条件。然而,它们确实存在一些限制,包括信号漂移、对温度变化的敏感性和有限的动态范围。[13]

侵入性或非侵入性能力

ISFETs被设计为在线操作,直接接触介质,从而实现无污染风险的连续监测。由于其小型化和与CMOS技术的兼容性,它们可以通过检测细胞与传感器栅极之间纳米间隙的pH变化,实时跟踪细胞呼吸和代谢活动。例如,王的研究团队开发了一种使用双栅ISFET和In₂O₃纳米带的便携式诊断设备,在仅20分钟内实现了对心肌肌钙蛋白I的1到1,000 pg/mL的检测范围。[13]

培养肉生物反应器的主要优势

ISFETs 在培养肉生产中具有显著优势,因为它们可以与 CMOS 技术集成。这允许极端的小型化、高通量传感器阵列和无缝的数字信号处理。如同在《材料化学B杂志》:

“ISFETs 通过仅需一个参考电极进行目标检测,而不是传统的三电极系统,提供了一种简化的仪器设计方法。”[13]

它们的全固态设计确保了耐用性,即使在涉及酸和碱的恶劣化学环境中也是如此。此外,将ISFET集成到CMOS阵列中能够同时监测多个参数,这对于管理培养肉生物反应器中复杂的营养成分至关重要。这些特性使ISFET成为该领域中准确、实时代谢物追踪的必备工具。 Cellbase将培养肉生产商与ISFET供应商连接起来,确保获得这些稳健、可扩展的传感器以优化生产。

生物反应器的生物传感器:葡萄糖、pH值、乳酸、氧气

传感器比较表

Comparison of Top 5 Metabolite Sensors for Cultivated Meat Bioreactors

培养肉生物反应器的前五大代谢物传感器比较

选择合适的传感器用于培养肉生产取决于目标代谢物、侵入性程度和特定的工艺参数。下面是一个总结关键传感器技术的表格,重点介绍其在该领域的性能特征和优势。

传感器类型 关键代谢物/参数 准确性 & 可靠性 操作模式 培养肉的好处
拉曼光谱 葡萄糖、乳酸、谷氨酰胺、铵、氨基酸、蛋白质 高;需要MVDA模型以提高精度 非侵入式(在线) 监测细胞分化和蛋白质完整性
二维荧光光谱 氧化还原状态,细胞功能 对代谢变化的高灵敏度 非侵入式(在线) 跟踪代谢健康和细胞压力
近红外光谱 总生物量,常规代谢物高于生物质;代谢物开发中 非侵入式(在线) 无需取样的实时生物质预测
电化学生物传感器 葡萄糖、乳酸、谷氨酸、氨 高;快速分析特定目标 侵入式(原位探针) 支持自动化供料循环
ISFETs(场效应管生物传感器) pH值、离子、蛋白质、活/死细胞形式 高灵敏度;新兴技术 侵入式(电子芯片) 区分活细胞和非活细胞

非侵入式光学传感器,如拉曼光谱和近红外光谱,特别适合于保持无菌状态,因为它们不需要与培养基进行物理接触。这对于培养肉细胞的脆弱性质至关重要。另一方面,像电化学生物传感器和ISFET这样的侵入式传感器提供直接的介质交互,提供精确的实时数据。然而,这些需要严格的消毒协议以确保准确性和卫生。

David Ede,Sartorius的工艺技术经理,强调了拉曼光谱的适应性:

“拉曼光谱已被改编用于测量多种不同分析物的浓度,包括谷氨酰胺、铵、氨基酸,甚至蛋白质。”[14]

这种适应性使拉曼光谱成为使用单一传感器进行详细代谢物分析的突出选择。

Cellbase 作为桥梁,连接培养肉生产商与为该专业行业设计的可信传感器供应商。

结论

正如前面讨论的详细传感器配置文件所强调的那样,精确的代谢物监测是培养肉生产的变革者。 拉曼光谱、二维荧光光谱、近红外光谱、电化学生物传感器和ISFETs等技术解决了特定的生物加工难题。配备传感器的生物反应器显著优于手动系统,实现了85–90%的培养基利用效率,而手动系统仅为60%,同时将生产周期缩短了25%,并将批次变异性减少了20–30%[15] [5] . 这些进步直接解决了优化生物加工过程中面临的挑战。

要充分实现这些优势,关键在于将传感器能力与特定的生产需求相匹配。例如,拉曼和近红外光谱非常适合用于大型生物反应器(超过100升),在这些场合中无菌和非接触式监测至关重要。另一方面,电化学生物传感器更适合需要快速代谢物检测的便携式在线应用。专家发现,结合多种传感器,例如拉曼与ISFET,可以实现95%的预测准确性,弥合研究与商业规模生产之间的差距[2][4] . 这种量身定制的方法允许进行有效的工艺调整,并实现更一致的生产结果。

采用正确的传感器策略涉及针对关键代谢物、保持严格的灭菌标准、确保快速响应时间,并将传感器无缝集成到现有生物反应器中。实时代谢物分析支持自动化供料系统和及时废物清除,使细胞密度达到10⁸个细胞/mL,并提高产量15–25% [8][2].

对于寻找拉曼探针、近红外系统、生物传感器或生物反应器集成ISFET的可靠供应商的培养肉生产商,Cellbase提供了一个专门的B2B市场。通过提供精心策划的列表和透明的采购,平台简化了采购决策,并确保与培养肉生产的特殊要求兼容。

常见问题解答

哪种传感器最适合我的目标代谢物(葡萄糖、乳酸、铵、谷氨酰胺)?

在培养肉生物反应器中监测葡萄糖、乳酸、铵和谷氨酰胺,传感器的选择主要取决于您的工艺要求。对于葡萄糖和乳酸,酶传感器光谱方法是有效的。同时,离子选择电极光学传感器适合用于跟踪铵和谷氨酰胺。请确保评估您的具体应用和生物反应器设置,以确定最合适的选项。

我需要非侵入式传感器,还是可以使用在线探头而不影响无菌性?

在使用生物反应器生产培养肉时, 在线探头非侵入式传感器之间的选择取决于无菌要求和具体的生产目标。

  • 在线探头 (e.g. ,RTDs和pH电极)是经过适当灭菌和维护的可靠工具。它们提供直接测量,但需要小心处理以确保无菌性。
  • 非侵入式传感器 , 如光谱传感器,通过避免与培养物直接接触提供了一种替代方案。这种方法有助于保持无菌状态并降低污染风险。

最终,正确的选择取决于您的生物反应器的设计和您的工艺所需的监测类型。

如何结合多个传感器以提高生物反应器的预测准确性?

结合各种传感器通过提供对关键参数的全面评估来提高预测精度。使用像pH电极, 溶解氧传感器, 拉曼分析仪, 和电容传感器等工具一起使用,可以详细了解生物反应器的条件。自动化系统可以使用人工智能或高级分析来分析这些实时数据,确保对pH值、氧气可用性和细胞健康等关键因素的精确管理——这些因素对于扩大培养肉生产至关重要。

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Author David Bell

About the Author

David Bell is the founder of Cultigen Group (parent of Cellbase) and contributing author on all the latest news. With over 25 years in business, founding & exiting several technology startups, he started Cultigen Group in anticipation of the coming regulatory approvals needed for this industry to blossom.

David has been a vegan since 2012 and so finds the space fascinating and fitting to be involved in... "It's exciting to envisage a future in which anyone can eat meat, whilst maintaining the morals around animal cruelty which first shifted my focus all those years ago"