用于细胞分化的合成基因回路
如果您可以扩展细胞但无法在正确的时间将其切换到正确的命运,您的过程将在分化时停滞。 这是核心要点:合成基因电路为您提供 细胞内的承诺、时间、记忆和谱系混合控制,而单靠培养基变化往往会留下 异质性, 部分承诺的群体。 如果我在构建培养肉分化工作流程,我会立即从这篇文章中提取四个要点: 从原生网络开始,而不是构建体。 使用 snRNA-seq, 轨迹分析、GRN推断和miRNA分析来找出细胞停滞、漂移或分支到错误命运的地方。 将电路类型与过程问题相匹配。一个拨动开关适合锁定, 前馈或带通设计适合时间控制, 逻辑门适合多信号门控,而 miSFITs适合分级输出。 从第一天起就设计低泄漏、低噪音和安全性。 正交部件、负自调节、iFFLs、cm 转基因和可诱导的杀伤或生长抑制模块是构建的一部分,而不是事后的想法。 在规模相关条件下尽早验证。 在二维中工作的电路可能会因为诱导剂梯度、氧气限制和剪切而在 三维、微载体或搅拌悬浮液中发生变化。 文章还提出了一个对工艺团队重要的实际观点:单系控制和比例控制是不同的工作. 一个Tet-On MyoD盒可能会推动肌源性进入,但整体切割产品需要控制 肌肉、脂肪和ECM比例, ,这通常意味着反馈、旁分泌信号和更严格的克隆筛选。一些数据支持了这一信息: 标准的肌源性分化可能会停滞在融合指数大约为50-60% 在iPSCs中,工程化GRNs将目标谱系分化从52%提高到81% 在改造的MSCs中,合成电路将心脏分化驱动到76% 一些猪的Tet-On-PAX7系在40次传代后仍保持高肌源性潜力 大约20%的人类多能干细胞可能携带与癌症相关的突变,这就是为什么可诱导的安全模块很重要...
