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生物反应器清洗验证的分析工具

Analytical Tools for Bioreactor Cleaning Validation

David Bell |

清洁验证在培养肉生产中至关重要,以防止污染并确保产品安全。 以下是您需要了解的内容:

  • 监管标准: 清洁过程必须去除99%的微生物,然后进行消毒或灭菌以达到99.999%的减少。
  • 残留挑战: 生物反应器会积累蛋白质、脂肪和细胞碎片,需要精确的清洁方法。一次性系统增加了碳氢化合物和硅氧烷等风险。
  • 残留检测的关键工具:
    • HPLC: 检测特定残留物,但对痕量污染物的灵敏度有限。
    • LC-MS/MS: 高度灵敏,可检测ng/mL水平,非常适合痕量分析。
    • TOC分析: 快速测量所有有机残留物(ppb灵敏度),但缺乏特异性。
  • 微生物检测: 传统的无菌测试速度较慢(5-7天)。像ATP生物发光和实时PCR这样的快速方法提供更快的结果,改善了批次释放时间表。
  • 数字监控: 像紫外光谱和人工智能驱动的分析工具这样的实时工具优化清洁周期,减少停机时间,提高效率。

验证清洁过程的新型分析方法

残留检测工具

在培养肉生产中,清洁生物反应器是一个细致的过程。必须完全去除蛋白质、脂肪、细胞碎片和生长介质成分等残留物,以避免交叉污染。HPLC、LC-MS/MS和TOC分析等工具在确保彻底的残留检测中发挥作用,提供定量和定性见解。

高效液相色谱 (HPLC)

HPLC 是一种广泛用于测量生物反应器中残留物的方法。当与紫外线 (UV) 检测配对时,它有助于分离和识别液体样品中的成分。这使其特别适用于量化稳定的残留物,如特定的生长培养基成分或清洁剂。然而,它也有局限性。例如,HPLC-UV 可能对检测痕量残留物不够敏感,尤其是在涉及高效能肽的应用中,这些肽容易吸附损失或具有较差的紫外线敏感性 [3].

通常,HPLC-UV 的检测限在 µg/mL 范围内,这可能不足以监测微量污染。然而,其在检测和验证某些残留物去除方面的可靠性,使其成为确保培养肉类过程产品安全的首选方法 [3].

质谱技术

LC-MS/MS 通过其更高的灵敏度和特异性将残留物检测提升到一个新的水平。该方法可以分析广泛的肽,在一次运行中检测到低至 1–1,000 ng/mL 的数量。通过使用多反应监测碎片,它精确确认残留物的身份。正如 Waters Corporation:

所指出的:

虽然高效液相色谱 (HPLC) 与紫外 (UV) 检测结合是 ARL 测定中最常用的分析工具,但对能够实现更灵敏和选择性检测的分析方法的需求正在增长 [3].

LC-MS/MS 特别适用于识别单次使用生物反应器组件中的微量残留物、降解蛋白质和可提取物。分析人员通常依赖高性能表面小瓶来减少非特异性结合并提高回收率。其在极低水平(ng/mL)检测残留物的能力使其在确认从生物反应器表面去除高效成分方面不可或缺。[3].

总有机碳(TOC)分析

TOC分析通过将残留物氧化成CO₂并监测电导率的变化来测量残留物中的总有机碳。此方法是非特异性的,意味着它检测所有有机残留物——无论是蛋白质、细胞、清洁剂还是培养基成分。其灵敏度令人印象深刻,检测限低至6.30 ppb,定量限约为21 ppb。[4][5].

古巴哈瓦那基因工程与生物技术中心的一项研究证明了TOC分析的有效性。研究人员实现了残留水平降低三个数量级,最终TOC值低至22 ppb。他们还建立了TOC读数与微生物负荷之间的联系:例如,27 ppb的TOC与大约10⁶ E. coli 细胞相关,而16 ppb则相当于大约10³酵母细胞 [4] .

TOC分析仪特别适合用于就地清洗系统,在这些系统中,它们可以用作在线或在线工具,以加快设备周转时间 [5]. 欧洲委员会的附录15支持在特定残留测试不可行时使用非特定方法,如TOC,声明:

生物制品在暴露于极端pH值和/或热时已知会降解和变性...[支持]非特定方法,如总有机碳(TOC)和电导率,当测试特定产品残留不可行时 [5].

虽然TOC分析无法区分残留物类型 - 如生长培养基、细胞碎片或清洁剂 - 但这种广泛的检测有助于验证降解蛋白质的去除。对于大规模细胞培养,TOC与细胞计数之间的相关性提供了一种实用的方法来确认从生物反应器壁上去除生物质 [4].

这些工具共同提供了一个强大的残留物检测框架,确保生物反应器达到培养肉生产所需的严格清洁标准。这一基础对于后续的无菌和微生物检测至关重要。

无菌检测和微生物检测

在残留物检测之后,确保无菌是绝对关键的。传统的无菌测试通常需要5-7天时间,微生物菌落才能生长到可检测水平(约10⁷个细胞) [8]. 这个漫长的过程可能会延迟设备周转和培养肉生产中的批次释放。然而,快速微生物检测方法 (RMM)可以显著缩短等待时间,在数小时内检测到污染,而不是几天。让我们仔细看看这些方法。

生物反应器清洁验证的一个主要障碍是用标准技术培养某些生物体的困难。例如,在2023年9月, AstraZeneca使用放大ATP生物发光技术快速识别出像西宫皮球菌, 这样的慢生长生物体,而标准的胰蛋白胨大豆琼脂无法检测到。这突显了快速方法如何优于传统培养技术。正如AstraZeneca的首席科学家Miriam Guest所解释的:

"...使我们能够快速响应,确保能够及时执行缓解措施。"
– Miriam Guest, 首席科学家,阿斯利康 [6]

自动化系统通过消除手动读取中的人为错误进一步提高了准确性。它们还直接与实验室信息管理系统(LIMS)集成,减少了转录错误并加快了文档处理速度——这对于管理多个批次的培养肉设施来说是一个巨大的优势 [8].

快速微生物检测方法

为了克服传统培养方法的局限性,出现了几种快速检测技术。以下是它们的工作原理:

  • ATP 生物发光法: 这种方法通过检测活细胞中的三磷酸腺苷(ATP),在几分钟到几小时内提供结果。虽然不具体,但它适用于快速卫生检查,并且可以识别琼脂平板可能遗漏的微生物。[6][7].
  • 核酸检测方法: 实时PCR和LAMP(环介导等温扩增)等技术提供高灵敏度和特异性。实时PCR可以在富集后1–3.5小时内检测到少至10⁴ cfu/mL的微生物。[7]. LAMP在恒定温度(59–65°C)下操作,富集后60–75分钟内提供结果,检测范围为10²到10⁴ cfu/mL。用于RNA检测的反转录LAMP(rtLAMP)具有更高的灵敏度,无需富集即可检测到少至每拭子4 cfu。[7].
  • 光学检测: 这些检测依赖于含有染料的肉汤培养基,根据微生物的代谢活动改变颜色或发出荧光。像BioLumixSoleris这样的平台可以检测到少至8个酵母细胞或50–100个细菌——远低于肉眼菌落检查的阈值 [8]. 检测时间范围为单个细菌8–18小时,霉菌细胞35–48小时 [7].
  • 阻抗微生物学: 这种方法通过监测细菌代谢引起的培养基电变化来区分活细胞和死细胞,提供14–24小时的结果[7].

选择快速方法时,一个关键因素是考虑过程是否具有破坏性。基于荧光的方法通常是非破坏性的,允许菌落可追溯性,而ATP生物发光和细胞裂解方法通常会破坏样本[8]. 对于生物反应器清洁验证,在残留清洁剂或消毒剂可能干扰的情况下,使用中和剂预先润湿棉签可以帮助避免假阴性 [7].

数字和过程分析工具

引入过程分析技术 (PAT)和数字监测平台正在改变培养肉生产中的清洁验证。传统上,离线测试意味着设备必须闲置数小时甚至数天以等待实验室结果 [9]. 现在,在线和实时工具在整个清洁周期中提供实时数据,消除了这些延迟。

在线紫外光谱为例。这项技术使用传感器实时监测清洁剂和蛋白质残留。正如来自STERIS的John Schallom所解释的:

UV的在线监测能力使得整个清洗周期的实时连续监测成为可能,并适用于质量设计、过程分析技术、过程数字化以及制药4.0制造设施的可持续发展目标。 [5]

通过使用UV光谱和UPLC等工具,在清洗过程中可以精确测量残留水平。这使得“清洗至清洁”的方法成为可能,即一旦残留水平达到目标阈值就停止清洗,而不是依赖于为最坏情况设计的固定清洗时间。结果是?设备停机时间大幅减少[9]. 这些连续监测系统也为预测性清洗协议铺平了道路,提高了效率并减少了浪费。

AI驱动的预测分析

AI在优化清洁协议中发挥着关键作用。通过数字孪生, AI模拟TACT(温度、动作、化学、时间)变量,通过减少重复实验的需求来简化流程。机器学习分析这些变量的相互作用,以识别最有效和可重复的清洁条件[11]. 这种方法不仅节省了时间和资源,还支持使培养肉在成本上更具竞争力的努力[10].

实时监控平台

实时监控平台结合多个传感器,在整个清洁周期中持续验证清洁度。例如,2014年5月,Waters Corporation展示了PATROL UPLC过程分析系统。该系统使用60秒等度法监测1升反应容器中的洗涤溶剂,实现了注射间160秒的循环时间,检测限为24 ng/mL。这种近乎即时的分析消除了手动擦拭的需要,并加强了“清洁直到清洁”的方法论[9].

对于培养肉设施,这些平台提供了更大的优势。总有机碳(TOC)分析可以检测到低至27 ppb水平的多达1,000,000个大肠杆菌细胞[4], 提供了一种评估微生物清洁度的灵敏方法。此外, 表面等离子体共振(SPR)技术提供了1–10 ng/mL之间的检测灵敏度[2], 使其在验证高效生物制品的清洁方面具有不可替代的价值。通过整合这些实时工具,培养肉生产商可以确保高效的清洁验证,以符合严格的监管要求。

对于希望采用这些尖端解决方案的公司,Cellbase提供了广泛的可信传感器技术和关键仪器,专为培养肉生产的需求量身定制。

工具比较

Comparison of Analytical Tools for Bioreactor Cleaning Validation in Cultivated Meat Production

培养肉生产中生物反应器清洁验证的分析工具比较

选择合适的分析工具进行生物反应器清洁验证需要权衡敏感性、特异性、成本以及其在培养肉生产过程中的适用性等因素。以下是不同工具如何为这一严格的验证工作做出贡献的详细分析。

TOC分析以其速度和检测所有有机残留物的能力而脱颖而出,尽管它不能区分特定的分子。它提供快速且灵敏的总有机负荷验证,这使其在冲洗水分析中特别有价值,因为确认完全去除有机物是关键。然而,由于它测量的是总碳,因此无法识别存在的有机物质的具体类型。

HPLC在特异性方面表现出色,因为它在一次运行中将目标残留物与清洁剂和其他成分分离。其灵敏度取决于分子的化学性质和所用检测器的类型(e.g . ,UV或荧光)。缺点?HPLC耗时,每个样品需要长达40分钟,更不用说分析前所需的大量准备工作[12]. 虽然不适合常规监测,但在偏差期间识别污染物方面非常有效。

质谱法提供无与伦比的特异性和灵敏度,能够检测极低水平(ppb)的分子。这使其非常适合验证强效生长因子或蛋白质的去除。然而,它通常需要一个内部标准来确保在残留物接受限度附近的准确性。质谱法的高成本和复杂性使其不太适合常规使用,但在调查偏差或验证最坏情况时是不可或缺的。

比较表

下表总结了用于残留物检测和微生物监测的各种工具的优缺点。每种工具在维护验证的清洁协议中发挥着独特的作用。

工具 特异性 灵敏度 主要优势 主要限制 对培养肉的适用性
TOC分析 低(非特异性) 高(ppb级别) 快速;检测所有有机残留物;易于验证 无法识别特定分子 高;理想用于冲洗样品和总有机负荷验证[4][15]
HPLC 高(特异性) 可变(取决于检测器) 将目标与清洁剂分离;高度准确 耗时(每个样品最多40分钟);需要发色团中等;最佳用于偏差期间特定污染物识别[12][15]
质谱分析 非常高(特定) 非常高(ppb水平) 极高的灵敏度;excellent质量选择性 高成本;需要内部标准 中等;保留用于高效能残留物和复杂特征化
快速微生物检测 可变 比传统无菌测试提供更快的反馈 高初始成本 高;对于降低批次失败率至关重要(目前为11–20%)[14]
数字/PAT工具 不适用(监控)高(过程) 实时、无损监测;减少人工劳动 受干扰影响(e.g. , 荧光猝灭) 高;支持可扩展、一致的生产[13][15]

这种比较强调了结合速度、特异性和实时监控的平衡方法的必要性。对于预算比制药制造商更紧张的培养肉设施,TOC 分析通常成为常规验证的最实用选择。与 HPLC 或质谱相比,它需要的开发方法要少得多[12].

结论

结合残留检测与实时监控对于培养肉生产中的生物反应器清洁验证至关重要。通过利用 TOC 分析、HPLC 和质谱等分析方法,生产商可以同时解决常规检查和详细偏差调查。每个工具都带来了独特的优势,确保了一个强大而全面的验证过程。

行业向自动化系统和实时监控的转变是一个游戏规则的改变者。这些进步最大限度地减少了停机时间和批次失败,简化了操作。正如费迪南德·格罗滕恰当地指出的:

自动化提高了过程的效率、稳定性和可重复性,并允许一致的数据记录,从而导致产品质量始终如一,并能够扩大过程产量 [1].

选择合适的工具需要考虑残留物接受限度、灵敏度和采样兼容性 [12]. 对于具有严格每日允许暴露限值的高效力蛋白质,表面等离子体共振技术提供了卓越的灵敏度,检测低至1–5 ng/mL - 远远超过SDS-PAGE所展示的90–95%的降解水平 [2].

采购可靠的生物制药级分析设备并非易事。像Cellbase这样的平台通过将生产商与经过验证的供应商连接起来,简化了专门适用于培养肉生产的过程。这不仅保持了验证时间表的正常进行,还确保了符合监管机构要求的严格文档和质量标准。

成功的关键在于平衡速度、精确性和可扩展性的验证策略。快速的常规监测必须与在需要时进行深入调查的能力相辅相成。结合高效的设备采购,这种方法确保了一致的、合规的流程,以满足可扩展的培养肉生产的需求。

常见问题

我如何在清洁验证中选择 TOC、HPLC 和 LC-MS/MS?

在选择 TOC, HPLC, 和 LC-MS/MS, 时,关键在于您需要检测什么以及方法的精确度要求。

  • TOC(总有机碳): 这种方法测量整体有机残留物,如清洁剂,但不能确定具体化合物。它是一种广泛的方法,适用于一般残留监测。
  • HPLC(高效液相色谱): 这是一种更具针对性的方法,非常适合识别和量化样品中的已知杂质。
  • LC-MS/MS (液相色谱-串联质谱): 如果您需要极高的灵敏度或分析复杂样品,这是首选方法。它在检测微量残留物方面表现出色。

正确的选择取决于您的工艺要求和您所处理的残留物的性质。

生物反应器的残留物接受限值是多少?

生物反应器的残留物接受限值是根据基于健康的暴露水平设定的,例如可接受的残留量或允许的每日暴露(PDE)值。这些限值对于确保患者安全和符合监管标准至关重要,并符合既定的指导方针。

在消毒剂可能干扰的情况下,最佳的快速微生物方法是什么?

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Author David Bell

About the Author

David Bell is the founder of Cultigen Group (parent of Cellbase) and contributing author on all the latest news. With over 25 years in business, founding & exiting several technology startups, he started Cultigen Group in anticipation of the coming regulatory approvals needed for this industry to blossom.

David has been a vegan since 2012 and so finds the space fascinating and fitting to be involved in... "It's exciting to envisage a future in which anyone can eat meat, whilst maintaining the morals around animal cruelty which first shifted my focus all those years ago"