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細胞株認証のベストプラクティス

Best Practices for Cell Line Authentication

David Bell |

細胞株の認証は、特に培養肉において、研究および生産に使用される細胞株の同一性と純度を保証します。このプロセスは、汚染、誤認識、遺伝的ドリフトを防ぎ、無効な結果、資源の浪費、または安全性のリスクを引き起こす可能性があります。以下は知っておくべきことです:

  • 主要な方法: STRプロファイリング(ヒト細胞用)、SNPプロファイリング(動物細胞用)、およびマイコプラズマ検査は広く使用されている技術です。
  • テストのタイミング: 新しい細胞株を受け取ったらすぐに、長期間の培養中、主要なマイルストーンの前、または異常な行動が観察された場合に認証します。
  • 規制基準: ANSI/ATCCおよびICLACガイドラインに従い、80%の遺伝子型一致と3〜6ヶ月ごとの定期的なテストを確保します。
  • 文書化: 規制要件を満たすために、細胞株の起源、継代履歴、およびテスト結果の詳細な記録を維持します。
  • 調達: ATCCのような認証済みのサプライヤーやCellbaseのようなプラットフォームを利用して、認証された材料にアクセスし、コンプライアンスを確保します。

定期的なテストと適切な文書化は、信頼性を維持し、規制要求を満たし、培養肉生産における高額なミスを避けるために不可欠です。

細胞株認証の主な方法

ショートタンデムリピート(STR)プロファイリング

STRプロファイリングは、人間の細胞株を検証するための主要な方法です。特定のDNA領域を分析し、繰り返し配列を持つこの技術は、参照データベースと比較できるユニークな遺伝的指紋を作成します。認証には通常、少なくとも80%の一致が必要です。STRプロファイリングの費用はサンプルあたり£100から£300で、結果は通常1〜2週間で提供されます[2]。ただし、使用されるデータベースとマーカーはヒト細胞に特化しているため、この方法は非ヒト細胞株には信頼性が低い可能性があります。それらの場合、SNPプロファイリングのような他の技術がより適していることが多いです。

一塩基多型(SNP)プロファイリング

動物由来の細胞株が一般的な培養肉産業では、SNPプロファイリングが正確な代替手段を提供します。この方法は、ゲノム全体の一塩基の違いを調べ、密接に関連する種や株間でも区別できる非常に詳細な識別を可能にします。SNPプロファイリングは、通常1サンプルあたり£200から£500の費用がかかり、STRプロファイリングと比較して処理にやや時間がかかる場合がありますが、その精度の高さから非ヒト細胞株の認証に理想的です[2]

マイコプラズマおよび種の検証試験

培養肉の生産において、細胞株の純度を維持することは非常に重要です。マイコプラズマ汚染は、視覚的検査ではしばしば検出されず、細胞の挙動に深刻な影響を与え、研究結果を損なう可能性があります。PCRベースまたは酵素的検査法により、数日以内にマイコプラズマを検出することができ、サンプルあたりの費用は£50から£150です。細胞培養の信頼性を確保するために、定期的なマイコプラズマスクリーニングが不可欠です[2].

種の確認も同様に重要であり、特に複数の動物細胞株を扱う場合には重要です。これはしばしば、種内で保存されているが、種間で十分に異なるため正確な識別が可能なミトコンドリア遺伝子を標的とするシトクロムcオキシダーゼサブユニットI(COI)シーケンシングによって達成されます。培養肉の生産において、このステップは異種間汚染を防ぐために重要です。

これらの検査方法を組み合わせることで、細胞株の完全性を保護するのに役立ちます。プロセスを簡素化するために、 Cellbase のようなプラットフォームは、研究者と信頼できるサプライヤーを結びつけ、業界標準を満たす認証済みの材料とテストサービスを提供します。

文書化と記録保持の実践

必要な文書

細胞株が施設に入った瞬間から、その出所の詳細な記録を保持することが重要です。これには、サプライヤーの詳細、元のソース、およびATCC参照番号などのカタログ番号を記録することが含まれます。これらの記録は、規制遵守を確保するための追跡可能なチェーンを作成します[6]

細胞株のライフサイクル全体を通じて、バッチ番号と継代履歴を正確に記録することが不可欠です。これには、継代の日付、関与した人員、および細胞に観察された変化を記録することが含まれます。このような文書は、パッセージ数が増えるにつれて、遺伝的ドリフトや汚染のリスクが高まるため、ますます重要になります。[5][6].

認証プロファイル、テスト日、およびバッチリンクも、監査準備のために安全に保管する必要があります。認証結果が80%の遺伝子型一致しきい値を確認した場合、この情報は明確に文書化され、関連するバッチに関連付けられなければなりません。[2].

汚染テストの結果は、明確な合格または不合格の指標とともに記録されるべきです。これらの記録は、規制当局の検査や生産異常に対処する際に重要な役割を果たすことがよくあります。

よく見落とされるステップは、新しい取得物をICLAC Register of Misidentified Cell Linesと照合することです。 各検証は、問題のあるまたは誤認識された細胞株を回避するためのデューデリジェンスを示すために文書化されるべきです [2][3].

トレーサビリティとコンプライアンスの維持

詳細な文書化だけでは不十分です - 強固なトレーサビリティシステムがコンプライアンスを維持するために不可欠です。ユニーク識別子システムを導入することで、すべての記録が相互に接続されたままになります。各細胞株バッチに特定のコードを割り当てることで、すべての後続データをリンクし、生産プロセス全体を通じてシームレスなトレーサビリティのチェーンを維持できます [6][3].

デジタルソリューション、例えば実験室情報管理システム (LIMS)は、人為的なエラーを最小限に抑え、混乱を防ぎます。これらのシステムは、バージョン管理と監査証跡を備えた安全で集中化されたストレージを提供します。自動タイムスタンプは、すべての変更が記録され、規制当局の期待に応えます[6][3].

細胞株を移送する際には、送信側と受信側の両方が移送を反映するように記録を更新する必要があります。これには、すべての認証、出所、およびテスト履歴が含まれ、トレーサビリティが維持されます[3][6].

定期監査は、潜在的なギャップを早期に特定するのに役立つもう一つの重要な実践です。これらの監査は、スタッフのトレーニングやプロセスの改善の機会も提供し、全体的な品質管理システムを強化します[3][6].

一貫性を確保するために、施設は文書化のための標準作業手順書(SOP)を確立する必要があります。これらのガイドラインは、ラベリングの慣例からデータ入力プロトコル、矛盾を解決するためのエスカレーションプロセスまで、すべてを網羅する必要があります[2].

調達とコンプライアンスを効率化するために、 Cellbase は完全な出所記録を備えた認証済みの細胞株を提供し、取得時から規制要件を満たしています。

最後に、コンプライアンス文書は、ANSI/ATCCやICLACなどの認識された基準に沿い、英国のデータ保持規制を遵守する必要があります。継続的な真正性を確認するために、年次STRまたはDNAジェノタイピング分析をスケジュールし、文書化してください[3][4][5].

テストの頻度とタイミング

認証を行うタイミング

細胞株の認証は、研究と生産の重要な段階で不可欠です。新しい細胞株を取得する際に認証することは最も重要な瞬間の一つです。取得直後にテストを行うことで、正しい材料から始めていることを確認し、後々の潜在的な問題を防ぐことができます。このステップは、よく構築された認証ルーチンの基礎を築きます。

また、長期間の培養期間中に認証することも重要です。マイクロサテライト安定(MSS)細胞培養の場合、10〜20パッセージごとに再認証が推奨され、MSI細胞培養の場合は5〜10パッセージごとに行うべきです。これは、細胞株の大規模な拡張が行われる培養肉の生産において特に重要です。

もし細胞の異常な挙動に気付いた場合、細胞株の同一性を確認するために即座に認証が必要です。 同様に、主要なプロジェクトのマイルストーン、例えば生産の拡大、研究フェーズの移行、またはセルバンクの確立などは、認証を引き起こすべきです。

さらに、規制および出版要件はしばしば認証を要求します。多くのジャーナルや資金提供機関は、原稿を受け入れたり助成金申請を承認する前に、認証の証明を要求するようになっています。

テストスケジュールガイドライン

認証のトリガーが特定されたら、明確なテストスケジュールを守ることが、細胞株の完全性を維持するために不可欠です。国際細胞株認証委員会(ICLAC)およびANSI/ATCCのガイドラインでは、通常使用される細胞株に対して年に少なくとも2回のテストを推奨しています[5]。しかし、培養肉の生産では、リスクが高いため、より頻繁なテストが必要になるかもしれません。

培養肉企業にとって、テストスケジュールは生産サイクルと規制の要求に合わせるべきです。四半期ごとのテストは、高価値の研究に対するより良い監視を提供し、毎月のテストは、汚染が重大な財務損失につながる可能性がある商業生産ラインにより適しているかもしれません。

以下のフレームワークは、さまざまなシナリオに対する推奨テスト間隔を示しています:

シナリオ 推奨テスト間隔 目的
新しい細胞株の取得 受領時に直ちに アイデンティティの確認
定期的な培養維持 3~6ヶ月ごと ドリフトの検出
高継代培養(>20継代) しきい値を超えた直後 ドリフトの合併症を防ぐ
主要なプロジェクトのマイルストーン前 各マイルストーンの前 有効性の確認
新しい表現型の観察 できるだけ早く 一貫性の確認
銀行業務や流通の前に 各イベントの前に 真正性を保証
出版前または助成金申請前 提出期限前 コンプライアンスを満たす
培養肉施設には、リスクベースのスケジュールがより適したアプローチを提供できます。頻繁な取り扱いや高レベルの操作にさらされる細胞株は、より頻繁なテストが必要になるかもしれませんが、厳格なプロトコルの下で確立された株は、標準的な半年ごとのスケジュールに従うことができます。

文書要件もタイミングの決定に影響を与えます。例えば、英国の規制当局は、DD/MM/YYYY形式での認証記録と明確な監査証跡を要求しています[2][6]。テストスケジュールを規制報告期間と一致させることで、必要なすべての文書が最新であることを保証します。

スケジュールを簡素化し、コンプライアンスを維持するために、 Cellbase のようなプラットフォームは、培養肉産業に特化した認証済みの細胞株とテストサービスを提供しています。彼らの専門知識は、企業が生産ニーズと規制義務に基づいて適切なテスト頻度を決定するのを助けます。

最後に、季節的要因がタイミングに影響を与えることがあります。研究活動が変動する施設では、静かな時期に認証をスケジュールすることで、実験や生産ワークフローへの影響を最小限に抑えることができます。

規制コンプライアンスと調達ガイドライン

規制要件の概要

このセクションでは、特に英国における培養肉の生産における細胞株認証を規制する枠組みについて詳しく説明します。ここでは、MHRAFSAの両方が重要な役割を果たしています。MHRAは、生物材料のトレーサビリティ、安全性、および品質を確保し、食品生産に使用されるすべての細胞株が認証され、信頼できる供給者から調達されることを要求しています。 欧州市場への進出を目指す企業にとって、欧州食品安全機関(EFSA)はさらなる監視層を追加し、細胞株の同一性、安定性、安全性の証明を要求します[6].

前述の通り、正確な認証と綿密な文書化が重要です。ANSI/ATCC ASN-0002-2011基準や国際細胞株認証委員会(ICLAC)からの推奨事項などの規制ガイドラインは、コンプライアンスの基準を高く設定しています。これらの基準はかつてはベストプラクティスとされていましたが、現在では培養肉生産において必須となりつつあります[2][4][6].

英国の規制当局は、企業に対して細胞株の起源、継代履歴、試験結果の詳細な記録を保持し、規制検査のための完全な追跡可能性を確保することを要求しています。コンプライアンス違反は、製品のリコール、罰金、市場認可の拒否、さらには評判の損失など、深刻な結果を招く可能性があります。場合によっては、規制当局が認証されていない細胞株の破棄を命じたり、研究の再実施を要求したりすることがあります。これにより、製品開発や商業化のタイムラインに重大な遅れが生じる可能性があります [2][6].

認証済み材料の調達

これらの規制要求を満たすためには、信頼できるサプライヤーから認証済みの材料を調達することから始める必要があります。培養肉製品の遺伝的同一性、安全性、一貫性は、初期の細胞株の品質にかかっています。認証されていないまたは汚染された細胞株を使用すると、製品の品質が損なわれるだけでなく、安全性のリスクが生じ、研究結果が無効になります [2][6][7]

サプライヤーを選ぶ際、企業は最近のSTRまたはSNPプロファイル、汚染テスト結果、認識された基準への準拠を含む徹底した認証文書を提供するサプライヤーを優先すべきです。ATCC(American Type Culture Collection)やDSMZのような著名なリポジトリは、認証された細胞株の基準を設定しています。例えば、ATCCはすべての細胞株に対して厳格な認証と品質チェックを行い、研究者が完全な追跡可能性のためにカタログ番号と継代番号を引用できるようにしています[6]

特化したプラットフォーム、例えば Cellbaseは、培養肉産業に特化しています。これらのプラットフォームは、検証済みのサプライヤーと認証済みの材料のキュレーションリストを提供し、独自の規制要件をナビゲートするための業界特有の専門知識を提供します。コンプライアントな調達プロセスには、一般的に以下のステップが含まれます:

  • 必要な細胞株と試薬の特定。
  • 検証済みプラットフォームまたは認定リポジトリを通じたサプライヤーの選定。
  • 詳細な認証文書のレビューと取得。
  • 材料受領時の社内検証試験の実施。
  • すべての材料と結果の包括的な記録の維持。
  • 規制基準に沿った定期的な再認証のスケジュール。

しかし、調達とコンプライアンスにおける課題は一般的です。サプライヤーの文書の不一致、標準化された認証方法の欠如、バッチ間のトレーサビリティの維持の難しさなどの問題がプロセスを複雑にする可能性があります。これらは、専門のプラットフォームを使用し、堅牢な内部記録保持システムを実施し、スタッフに対するコンプライアンスプロトコルの定期的なトレーニングを提供することで軽減できます。[2][6].

ICLACの誤認識細胞株登録は、企業が新しい細胞株を取得する前に参照すべき貴重で無料のリソースです。このツールは、コンプライアンスを危険にさらす可能性のある問題のある細胞株を研究者が回避するのに役立ちます。専門家はまた、細胞株の認証に関する書面による方針を作成し、供給者の資格基準とテストスケジュールを詳述することを推奨しています。規制の更新について情報を得続け、業界のリソースを活用することは、コンプライアンスを維持し、培養肉製品の完全性を確保するために不可欠です。[1][4][6].

ヒト細胞株認証のための完全なワークフロー

結論

細胞株認証は、培養肉生産の成功を確保する上で重要な役割を果たします。研究によると、研究で使用される細胞株の15〜20%が誤認識または汚染されています。2017年の研究では、誤認識された細胞株を使用して32,000以上の記事が発表されていることが明らかになり、この問題が科学的正確性と商業的成果に与える深刻な影響を浮き彫りにしています[3].

このガイドで議論されたベストプラクティスに従うことで、企業は規制上の障害、資源の浪費、製品品質の低下のリスクを大幅に減少させることができます[5]。これらのプロトコルは、綿密な文書化と組み合わせることで、コンプライアンスと製品の完全性を維持するのに役立ちます。

プラットフォームの台頭は、培養肉の生産が標準的な実験室用品以上のものを必要としていることを認識し、業界の変化を示しています。これらのプラットフォームは、認証された材料、検証されたサプライヤーネットワーク、そしてカスタマイズされた専門知識を提供し、R&Dチームと生産マネージャーが技術的リスクを軽減し、コンプライアンスを簡素化するのを助けます。

規制基準も進化しており、ANSI/ATCCとISSCRからそれぞれ2022年と2023年に更新されたガイドラインが発表されています[3][7]。今、堅牢な認証プロトコルをワークフローに統合する企業は、将来の規制要求に対応するための準備が整います。定期的なSTRテスト、包括的な記録保持、信頼できるプラットフォームからの調達は、培養肉生産の科学的および商業的な整合性を保護するために不可欠なステップです。

この急速に発展する分野では、細胞株の認証は単なる技術的要件ではなく、生産プロセスのあらゆる段階を支える品質保証の基盤です。

よくある質問

なぜ細胞株の認証が培養肉の生産にとって重要なのですか?

細胞株の認証を確保することは、培養肉の生産における重要なステップです。それは最終製品の信頼性、安全性、全体的な品質を保証します。細胞株の同一性と純度を確認することで、研究の妨げとなる交差汚染、誤認識、遺伝的ドリフトなどの問題を回避し、規制基準を満たすことができます。

定期的なテスト、綿密な記録保持、確立された業界基準の遵守などのベストプラクティスに従うことで、生産プロセスへの信頼を維持します。このレベルの精度は、培養肉において特に重要です。生産を拡大し、消費者の期待に応えるためには、一貫した品質が不可欠です。

研究および生産において、誤認識されたまたは汚染された細胞株を使用することにはどのようなリスクがありますか?

誤認識されたまたは汚染された細胞株を使用すると、研究および生産において深刻な問題を引き起こす可能性があります。科学者にとって、これは研究の信頼性を損なう不確実な結果を意味し、時間、資金、リソースの無駄につながります。培養肉の生産においては、そのようなエラーが不均一な製品を生み出し、規制基準を満たせず、安全性の懸念を引き起こす可能性があります。

汚染は一つの細胞培養にとどまらず、実験室のワークフロー全体に広がり、遅延や後退を引き起こす可能性があります。これらのリスクを回避するためには、定期的な細胞株の認証を行い、徹底した文書管理を維持することが重要です。これらのステップは、作業の整合性を保護し、信頼性のある結果を保証するのに役立ちます。

細胞株はどのくらいの頻度で認証されるべきですか?

細胞株はそのアイデンティティ、純度、信頼性を確認するために定期的にチェックする必要があります。これは研究の質を保証するだけでなく、規制要件を満たすのにも役立ちます。専門家は、新しい細胞株を取得したとき、重要な実験を始める前、そして長期間使用する際の間隔で認証を行うことを提案しています。ほとんどの場合、これは3~6ヶ月ごと、または10~15パッセージ後にテストすることを意味します。細胞の使用頻度に応じて異なります。

認証結果の詳細な記録を保持することも同様に重要です。このドキュメントは、規制遵守をサポートし、研究の整合性を維持します。STRプロファイリングのような一般的な方法は、細胞株の同一性を確認するのに役立ち、マイコプラズマ検査は汚染リスクに対処します。これらの実践を一貫して行うことで、信頼性が高く再現性のある結果を保証し、業界の期待に沿った作業を維持します。

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Author David Bell

About the Author

David Bell is the founder of Cultigen Group (parent of Cellbase) and contributing author on all the latest news. With over 25 years in business, founding & exiting several technology startups, he started Cultigen Group in anticipation of the coming regulatory approvals needed for this industry to blossom.

David has been a vegan since 2012 and so finds the space fascinating and fitting to be involved in... "It's exciting to envisage a future in which anyone can eat meat, whilst maintaining the morals around animal cruelty which first shifted my focus all those years ago"