שוק ה-B2B הראשון בעולם לבשר מתורבת: קרא את ההודעה

בקרת איכות ליציבות גנטית בקווי תאים

Quality Control for Genetic Stability in Cell Lines

David Bell |

יציבות גנטית היא קריטית לייצור בשר מתורבת. בלעדיה, קווי תאים עשויים לעבור מוטציה, מה שמוביל לאיכות לא עקבית, סיכוני בטיחות וכשלים בייצור. הגדלה מאלפי תאים לטריליוני תאים מגבירה את הסיכונים הללו, מה שהופך מערכות בקרת איכות חזקות להכרחיות. רגולטורים כמו ה-FDA וה- EMA דורשים הוכחה ליציבות לפני אישור מוצרים, שכן אפילו שינויים גנטיים קטנים יכולים לגרום לתוצאות אלרגניות או מזיקות.

אתגרים מרכזיים כוללים סחף גנטי, הצטברות מוטציות והפעלת אונקוגנים. בעיות אלו נובעות ממעבר תאים ממושך, לחצים סלקטיביים ומתח סביבתי במהלך הייצור. שיטות בדיקה מתקדמות, כגון קריוטיפינג, מערכי SNP וריצוף מהדור הבא (NGS), מסייעות בזיהוי וטיפול בסיכונים אלו. אסטרטגיות מניעה כמו בנקאות תאים מובנית והנדסה גנטית ממוקדת מגנות עוד יותר מפני חוסר יציבות.

יצרנים חייבים לשלב בקרת איכות בכל שלב של הייצור - מהקפאת תאים ועד לביוראקטורים בקנה מידה גדול. כלים כמו פרופיל STR, בדיקות זיהום ובדיקות פונקציונליות מבטיחים עקביות ובטיחות. פלטפורמות כמו Cellbase מחברות יצרנים עם משאבים לעמידה בסטנדרטים מחמירים של התעשייה. יציבות גנטית היא לא רק דרישה רגולטורית; היא הבסיס לייצור בשר מתורבת אמין וניתן להרחבה.

האצת פיתוח קווי תאים מ-DNA לבנק תאים ראשי - AGC Biologics

אתגרים נפוצים בשמירה על יציבות גנטית

הבטחת יציבות גנטית לאורך כל מחזור הייצור של בשר מתורבת היא לא משימה פשוטה. היקף הייצור העצום מציע שפע של הזדמנויות לשינויים גנטיים להתפתח ולהתפשט. הכרה באתגרים אלו היא המפתח להטמעת מערכות בקרת איכות יעילות.

סחף גנטי והצטברות מוטציות

מעבר תאים ממושך הוא מקור עיקרי לאי יציבות גנומית בייצור בשר מתורבת. קווי תאים בני אלמוות, מטבעם, נוטים לשינויים גנומיים, מה שיכול להוביל למוטציות ספונטניות במהלך תרבות ארוכת טווח [6][5]. כאשר תאים עוברים הכפלות אוכלוסייה מרובות, מצטברות שגיאות בשכפול ה-DNA, מה שמוביל לאוכלוסיות תאים מגוונות וייתכן לאובדן תפקוד. כריסטופר פריי ולוהונג הי מ-BioPharm International מדגישים נושא זה:

לעיתים קרובות נצפה כי קווי תאים CHO שמקורם קלונלי מתפצלים והופכים לאוכלוסייה הטרוגנית במהלך תקופות ארוכות של תת-תרבות [6].

בסביבות תעשייתיות, כ-20% מקווי תאי הייצור מראים הטרוגניות גנטית משמעותית לאורך דורות עוקבים [6]. מוטציות אלו יכולות להתרחש מוקדם, במהלך שכפול DNA לאחר טרנספקציה, או עקב שגיאות כאשר גנים זרים משולבים בגנום המארח [5].

לחצים סלקטיביים מוסיפים שכבה נוספת של מורכבות. סוכנים כמו אנטיביוטיקה וסמנים מטבוליים (e.g. , MTX) המשמשים לייצוב קווי תאים יכולים למעשה להגדיל את שיעורי המוטציה [6][5]. במקרים מסוימים, ככל שריכוז הסוכנים הללו גבוה יותר, כך שיעור המוטציה גבוה יותר [6]. לחצים סביבתיים - כמו מחסור בחומרים מזינים, תנאי תרבות תת-אופטימליים במהלך הגדלה, ולחץ פיזי מהתרחבות - יכולים לערער עוד יותר את שלמות הגנטיקה [6][5].

html

שואי וואנג, מנהל פיתוח קווי תאים ב-WuXi Biologics, מציין:

רמות המוטציה עשויות להשתנות במהלך מעבר תאים בגלל הפלסטיות הגנומית של תאי שחלה של אוגר סיני (CHO) [5].

שינויים אפיגנטיים גם הם משחקים תפקיד. גנים מושתלים יכולים להיאבד חלקית או לחלוטין או להיות מושתקים במהלך תהליך התרבות, מה שמשפיע על היציבות לטווח ארוך. המוטציות המצטברות הללו לא רק פוגעות בתפקוד התאים אלא גם מגבירות את הסיכון להפעלת אונקוגנים.

סיכוני הפעלת אונקוגנים

הפעלת אונקוגנים מייצגת דאגת בטיחות קריטית עבור יצרני בשר מתורבת, שכן היא יכולה לפגוע באצוות ייצור שלמות. חוסר יציבות גנטית יכול להוביל להפעלת אונקוגנים באמצעות מנגנונים כמו היפרמתילציה, שיכולה לגרום לפרופילים דמויי גידול [3][1]. ההתרחבות המהירה הנדרשת בייצור מגדילה עוד יותר את הסבירות לצבירת המוטציות המזיקות הללו [5][6].

זהו אתגר מוכר היטב. על פי הקונסורציום הבינלאומי לחדשנות & איכות בפיתוח תרופות (IQ), 67% מהנשאלים מאמינים שמוטציות גנטיות מהוות איום גדול יותר מאשר שילוב שגוי של חומצות אמינו במהלך הייצור [5] . מקרה ממאי 2024 ממחיש את חומרת הבעיה הזו: WuXi Biologics גילו ש-43% מהשיבוטים מתוכנית פיתוח קווי תאים נשאו את אותה מוטציה גנטית נקודתית. הסיבה השורשית? רמת וריאנט של 2.1%–2.2% ב-DNA הפלסמידי ששימש במהלך הטרנספקציה, שלא התגלתה על ידי ריצוף סנגר המסורתי. כדי להתמודד עם זה, החברה שילבה ריצוף מהדור הבא (NGS) בתהליכי בקרת האיכות שלה כדי לזהות וריאנטים כאלה מוקדם [5].

זיהוי מוקדם של חריגות גנטיות הוא קריטי, שכן שינויים אונקוגניים יכולים לפגוע באצוות שלמות. קריוטיפינג סטנדרטי מסוג G-band יכול לזהות תת-אוכלוסיות חריגות עם פסיפסיות של 14% בלבד בעשרים מטפזות תאים [1]. טכניקות מתקדמות יותר כמו NGS יכולות לזהות מוטציות גנטיות בתאים קלונליים עם רגישות של 0.5% [5].

ניתוח מתילציה של DNA הוא כלי נוסף בעל ערך להערכת הפוטנציאל הגידולי:

מכיוון שרמות מתילציה של DNA והיפרמתילציה של גנים מסוימים מתרחשות בתחילת ובמהלך התקדמות הסרטן, ניתוח פרופילי מתילציה של DNA עשוי לספק מידע משלים על הפוטנציאל הגידולי של תאים [3].

האתגר האמיתי טמון ביישום מערכות ניטור חזקות המסוגלות לזהות שינויים אלה לפני שהם פוגעים בבטיחות.עבור יצרני בשר מתורבת, שמירה על יציבות גנטית במהלך התפשטות תאים מהירה דורשת אמצעי בקרת איכות מתקדמים. פלטפורמות מתמחות כמו Cellbase נכנסות יותר ויותר למלא צורך זה, כפי שמפורט בסעיף הבא.

שיטות בדיקת בקרת איכות

Quality Control Testing Methods for Genetic Stability in Cultivated Meat Cell Lines

שיטות בדיקת בקרת איכות ליציבות גנטית בקווי תאי בשר מתורבת

זיהוי חוסר יציבות גנטית לפני שהיא משפיעה על הייצור דורש אסטרטגיית בדיקה רב-שכבתית. יצרני בשר מתורבת מסתמכים על שיטות שמזהות הכל משינויים כרומוזומליים גדולים ועד מוטציות בבסיס יחיד. בחירת הטכניקות תלויה בסיכונים הקיימים בכל שלב ייצור. כלים גנומיים אלו פועלים כנקודת הבדיקה הראשונה, ואחריהם הערכות פונקציונליות וניתוחי זיהום מפורטים.

ניתוח גנומי וטרנסקריפטומי

קריוטיפינג בפסגות G הוא כלי מרכזי לזיהוי בעיות כרומוזומליות משמעותיות כמו חריגות מספריות ושינויים מבניים גדולים, כגון טרנסלוקציות. בעוד שהוא יכול לזהות רמות מוזאיקה של כ-14%, הרזולוציה שלו מוגבלת לשינויים של 5–10 מגה-בייס, כלומר שינויים קטנים יותר עשויים להישאר בלתי מזוהים [1] .

היברידיזציה גנומית השוואתית במערך (aCGH) מציעה רזולוציה גבוהה יותר, ומזהה שינויים במספר העותקים עד 1 קילובייס. באופן דומה, מערכי פולימורפיזם של נוקלאוטיד בודד (SNP) מספקים אפשרות חסכונית לסריקה שגרתית, ומזהים שינויים במספר העותקים, אנאופלואידיה מוזאיקה ודיסומיה חד-הורית. מחקרי אימות הראו שמערכי SNP הם בעלי שחזור גבוה, עם מדידות תדירות אלל B (BAF) המגיעות ל-r² מרשים של 0.997 [8] [1].

רוסיו אגילר-קסדה מהבנק הרקמות של מערכת הבריאות הציבורית של אנדלוסיה מדגישה את הערך של שילוב שיטות:

קריוטיפינג נשאר בדיקה רב-תכליתית, במיוחד כאשר הוא משולב עם בדיקות ברזולוציה גבוהה [1].

פרופילינג של חזרות קצרות בטנדם (STR) הוא התקן הגלובלי לאימות זהות קווי תאים ומניעת זיהום צולב [1] [9]. בינתיים, ניתוח מתילציה של DNA משמש כסמן ביולוגי לזהות תאית, מצב התמיינות והזדקנות תאית [1] . לגילוי מוטציות ברמת זוג בסיסים, ריצוף גנום מלא או אקסום הוא אפשרות, אם כי הוא מגיע עם עלויות גבוהות יותר בהשוואה לשיטות מבוססות מערך [1] .

התוצאות הטובות ביותר מגיעות משילוב של גישות אלו. התחילו עם קריוטיפינג לקבלת סקירה רחבה, ולאחר מכן השתמשו בכלים ברזולוציה גבוהה כמו aCGH או מערכי SNP כדי ללכוד מוטציות עדינות יותר. הערכה מחדש באופן קבוע - אידיאלית כל 10 מעברים - היא קריטית, שכן תרבות ממושכת יכולה להוביל לשינויים גנטיים [10]. תובנות גנומיות אלו מתווספות לאחר מכן עם מבחנים פונקציונליים כדי להבטיח התנהגות תאית עקבית לאורך כל הייצור.

בדיקות פונקציונליות ובטיחות

פרופיל גנומי לבד אינו מספיק. מבחנים פונקציונליים מאשרים שהתאים שומרים על המאפיינים המיועדים שלהם במהלך ההתרחבות. מדדים כמו שיעורי גידול ופרודוקטיביות יכולים לסמן סימנים מוקדמים של סחף גנטי או זיהום [9].

ריצוף בתפוקה גבוהה (HTS) הוא רגיש מאוד לזיהוי וריאנטים גנטיים, בעוד שPCR דיגיטלי (dPCR) מאמת בדיוק את יציבות הטרנסגן ללא צורך בסטנדרטים של ייחוס [11] . כריסטופר פריי ולוהונג הוא מ-BioPharm International מדגישים את חשיבותו של שלב זה:

קו תאי הייצור הוא הבסיס לכל תהליך ביולוגי, ולכן, אפיון גנטי מתאים של קו תאי הייצור הוא קריטי להצלחת פיתוח התהליך [6].

יציבות אפיגנטית היא גם קריטית. אימונופרסיפיטציה של DNA ממותל (MeDIP) מסייעת בזיהוי השתקת גנים הנגרמת על ידי מתילציה של DNA, סיבה נפוצה לירידה בפרודוקטיביות [7]. כלים כמו Loop Out Detection Assay (LODA) משתמשים ב-RT-PCR כדי לזהות שינויים ב-DNA, כמו כאשר גן מעניין נמחק בעוד הסמן הנבחר נשאר [7].

הבדיקות צריכות להתאים לשלב הייצור: בדיקות בשלב מוקדם מתמקדות בשיבוט ואימות פלסמידים, בדיקות בשלב ביניים מעריכות סיכונים בתנאים מסחריים, ובדיקות בשלב מאוחר מעריכות תאים בגבול חיי המדף שלהם בתנאי מעבדה [6]. תחילת ניסויים עם תאים טריים, בעלי מספר מעברים נמוך, מבנק תאים ראשי מפחיתה את הסיכון לסטייה גנטית [9].

בדיקות סטריליות וזיהום

בדיקות זיהום חיוניות כדי להימנע מגורמים שעלולים לערער את היציבות הגנטית. מיקופלסמה מדאיגה במיוחד, שכן היא משנה את חילוף החומרים והתנהגות התאים מבלי לגרום לשינויים נראים בתרבית [1]. מחקרים מגלים זיהום מיקופלסמה ב-19% מדגימות בנק תאים, כאשר חלק מהאוספים המיוחדים מראים שיעורים גבוהים עד 31% [1].

בדיקות סדירות למיקופלסמה באמצעות טכניקות הגברה של חומצות גרעין (NAT) או PCR בזמן אמת יכולות לספק תוצאות חצי-כמותיות תוך 2–3 שעות [1]. צביעה פלואורסצנטית Hoechst 33258 היא שיטה נוספת, החושפת דפוסי פלואורסצנציה חוץ-תאיים אופייניים [9].

פרופיל STR קובע טביעת אצבע DNA עבור קווי תאים, ומשמש כבסיס לגילוי זיהום צולב [9]. בנוסף, גנוטיפ SNP באמצעות התפלגויות תדירות אלל B (BAF) יכול לזהות זיהום מקווי תאים אחרים, ולגלות תערובות תאים זרים בשיעורים של 20–25% [8].

תצפית מיקרוסקופית היא כלי אזהרה מוקדם פשוט אך יעיל, שכן מורפולוגיה תאית לא תקינה לעיתים קרובות מסמנת בעיות בתרבית [9]. יישום מערכת ניהול איכות, כגון ISO 9001:2015, יחד עם שיטות עבודה טובות במבחנה (GIVIMP), מסייע לשמור על תנאי תרבית סטנדרטיים וניתנים לשחזור, ומפחית את הסיכון לאי יציבות גנומית [10].

ליצרני בשר מתורבת הזקוקים לגישה לציוד ומכשור בדיקה מיוחדים, פלטפורמות כמו Cellbase מציעות שוק המחבר בין אנשי מקצוע בתעשייה לספקים מאומתים של מכשירים אנליטיים, ריאגנטים ושירותי בדיקה.

אסטרטגיות מניעה לאי יציבות גנטית

זיהוי אי יציבות גנטית הוא דבר אחד; מניעתה היא אתגר אחר לגמרי.כדי לשמור על יציבות גנטית, יצרני בשר מתורבת זקוקים למערכות מתוכננות היטב שמונעות מהתאים לסטות לפני שמתעוררות בעיות. שתי אסטרטגיות מפתח מובילות כאן: בנקאות תאים מובנית ו-הנדסה גנטית ממוקדת. ביחד, גישות אלו מתמודדות ישירות עם הסיכונים של סטייה גנטית והפעלת אונקוגנים.

בנקאות תאים ושימור בהקפאה

הצטברות מוטציות היא דאגה אמיתית, ולכן מערכת בנקאות תאים אמינה היא הכרחית. הסטנדרט התעשייתי כולל מערכת דו-שכבתית: בנק תאים ראשי (MCB) ו-בנק תאים לעבודה (WCB). הגדרה זו מבטיחה נקודת התחלה עקבית לייצור. הגבלת מספר המעברים היא קריטית, שכן כל מעבר מגדיל את הסיכוי למוטציות. על ידי אחסון תאים בחנקן נוזלי, הפעילות הביולוגית נעצרת למעשה, מה שמפחית את הסיכון לשינויים גנטיים במהלך האחסון.

במקום לעקוב אחר הזמן, גיל התאים נמדד על ידי כפילות אוכלוסייה. לדוגמה, ביוריאקטור ייצור טיפוסי בנפח 5,000 ליטר כולל כ-30 כפילויות אוכלוסייה[6]. כדי לשמור על עקביות גנטית, הייצור המסחרי מגביל את המספר הזה ל-45 עד 60 כפילויות[6].

שיטות סינון כמו RT-PCR ו-qPCR תא בודד יכולות לזהות בעיות מוקדם, כמו שחבור mRNA לא רגיל או שונות בטרנסגן. קווי תאים המראים שונות רחבה במספרי עותקים צריכים להיזרק כדי למנוע בעיות עתידיות.

בקרת איכות היא בלתי ניתנת למשא ומתן. באופן מדאיג, מחקרים מצאו כי עד 31% מקווי התאים בכמה בנקים היו מזוהמים במיקופלסמה [3] . כדי למנוע זאת, פרופיל STR משמש לאימות האותנטיות של קווי התאים לאורך תהליך הבנקאות.כפי שהודגש על ידי מחקר וראיות של FSA:

מכיוון שהתאים המאוחסנים הם חומר הגלם למוצר הסופי, ייתכן שיידרשו סטנדרטים גבוהים על ידי הרגולטורים בעתיד כדי להבטיח מוצר בשר בטוח ואיכותי[2].

הנדסה גנטית ליציבות

הנדסה גנטית מספקת שכבת הגנה נוספת על ידי שיפור ישיר של יציבות קו התאים. טכניקות כמו אינטגרציה ממוקדת (TI), במיוחד החלפת קלטת בתיווך רקומבינאז (RMCE), מאפשרות החדרה מדויקת של גנים לתוך מיקומים גנומיים ספציפיים. גישה זו נמנעת מהבלתי צפוי של אינטגרציה אקראית, שבה השפעות מיקום ואי יציבות מספר עותקים יכולים לגרום לנזק. למרות ש-RMCE בתאי CHO יש שיעורי יעילות מתחת ל-0.1%[12], הקלונים המתקבלים הם יותר צפויים ויציבים.

גם לבחירת מערכת הביטוי יש חשיבות. לדוגמה, מערכת סינתטאז גלוטמין (GS) בדרך כלל מניבה כ-חמישה עותקים של גן לכל תא, בעוד שמערכת רדוקטאז דיהידרופולאט (DHFR) יכולה להגדיל את מספר העותקים עד ל-1,000[6]. למרות שמספר עותקים גבוה יותר עשוי להישמע מפתה, הם מגבירים את הסבירות לשינויים ב-DNA, מה שהופך את המערכות המבוססות על GS לבחירה חכמה יותר ליציבות לטווח ארוך.

כדי למזער סיכונים נוספים, מוטגנזה ספציפית לאתר ו-סינון NGS לפני טרנספקציה הם קריטיים. מכיוון שלריצוף סנגר יש גבול זיהוי גבוה יותר, NGS יכול לזהות מוטציות בפלסמיד מתחת ל-0.5%, ומשפר את הצלחת סינון השיבוטים ליותר מ-90%[5].

שואי וואנג ועמיתיו מ-WuXi Biologics מדגישים את חשיבות הערנות הזו:

מכיוון שאופטימיזציה של תהליכים אינה יכולה לתקן מוטציות ברמת הגן, יש לעקוב בקפדנות אחר רמות המוטציה בשיבוטים יציבים[5].

ליצרנים הזקוקים לכלים מיוחדים - בין אם לשימור בהקפאה, הנדסה גנטית או אפיון קווי תאים - Cellbase מציעה שוק המחבר בין אנשי מקצוע לספקים מהימנים. זה מבטיח גישה לציוד ולמומחיות הנכונים לשמירה על יציבות גנטית בייצור בשר מתורבת.

שילוב בקרת איכות בייצור

שילוב בקרת איכות בכל שלב בייצור הוא קריטי. ללא מערכת מובנית, אפילו קווי תאים מתוחזקים היטב יכולים לחוות שינויים במהלך ההתרחבות וההגדלה. בקרת איכות לא צריכה להיות מחשבה שנייה - היא חייבת להיות חלק מרכזי בייצור. זה מתחיל בשלב ההתרחבות, שבו מערכות ניהול קפדניות וסביבות מבוקרות משחקות תפקיד מרכזי.

בקרת איכות במהלך התרחבות והגדלה

כפי שנדון קודם לכן, בדיקות גנומיות ובדיקות זיהום הן חיוניות, במיוחד במהלך ההתרחבות. המעבר מנפחים קטנים לאלפי ליטרים מציג סיכונים חדשים, כאשר כל מעבר תאים מגדיל את הסיכוי למוטציות. מערכת ניהול איכות (QMS) עוזרת לנהל את הסיכונים הללו ביעילות. לדוגמה, בין השנים 2017 ל-2022, ג'וזפ מ. קנאלס וצוותו באוניברסיטת ברצלונה יישמו את ISO 9001:2015 QMS כדי לתקנן תרביות תאי גזע פלוריפוטנטיים אנושיים. הניתוח הרטרוספקטיבי שלהם של נתוני G-banding ו-aCGH חשף ירידה משמעותית באברציות כרומוזומליות בהשוואה לתנאים לפני ההתאמה[10][13]. תעלות הדגישו את החשיבות של ניטור מתמשך:

האי-יציבות הגנטית שמפגינים hPSCs בתרבית הופכת את ההערכה המחודשת התכופה של שלמות הגנום לדרישה חיונית כאשר מתכננים להשתמש בהם לניסויים [10].

סינון גנומי שגרתי הוא הכרחי. טכניקות כמו קריוטיפינג G-banding ו-aCGH מזהות שינויים מבניים, בעוד ריצוף מהדור הבא (NGS) מזהה מוטציות ברמות מתחת ל-0.5%[5]. ניתוח עקומת גידול יכול גם להתריע על בעיות מוקדם, כמו זיהום או סחף גנטי[9]. ניטור סביבתי מוסיף שכבת ביטחון נוספת, עם פרקטיקות כמו בדיקת צלחות התיישבות ובדיקות מסנני HEPA חצי-שנתיות המבטיחות שהסביבה הייצורית נשארת יציבה וללא לחץ עבור קווי תאים[4].

עקביות במדיה ובחומרים היא חשובה באותה מידה. שימוש במדיה מוגדרת ללא סרום כמו mTeSR1, יחד עם חומרים עם תעודת ניתוח, מסייע להפחית את השונות בין אצווה לאצווה ומגביל את הסיכון לזיהום ויראלי[10][4]. בדיקות מורפולוגיה רגילות - תצפיות מיקרוסקופיות פשוטות בצפיפויות תרבות שונות - יכולות לתפוס סימנים מוקדמים של התמיינות או לחץ[9]. לצורך רכישת ציוד או חומרים מיוחדים, פלטפורמות כמו Cellbase מחברות בין חברות בשר מתורבת עם ספקים מהימנים של מדיה לגידול, ביוריאקטורים וכלים אנליטיים המיועדים לצרכי התעשייה.

בדיקות פונקציונליות לעקביות המוצר

בעוד שהמעקב הגנומי מגן על התהליך, בדיקות פונקציונליות מבטיחות שהתאים פועלים כמתוכנן.יציבות גנטית לבדה אינה מספיקה; תאים חייבים גם לשמור על יכולתם לתפקד כראוי לאורך אצוות הייצור. בבשר מתורבת, זה אומר לאשר שתאי גזע, כמו תאי לוויין של שריר, עדיין יכולים להתמיין לרקמת שריר או שומן בוגרת לאחר התרחבות[2]. בדיקות התמיינות חיוניות לאימות זה.

בדיקות מטבוליות כמו MTT, LDH ו-Resazurin מספקות תובנות על בריאות וחיוניות התאים [4][9]. אלו, בשילוב עם פרופיל קצר של חזרות טנדם (STR), עוזרים לאשר שקווי התאים נשארים אותנטיים וחופשיים מזיהום צולב לאורך תהליך הייצור[1][9].

ניתוח תעתיק הוא שלב קריטי נוסף.שיאוי צ'ן וסאם ז'אנג ממליצים:

מומלץ להשתמש בריצוף cDNA ולא בריצוף DNA גנומי לגילוי מוטציות כדי להעריך סיכונים ברמת השעתוק[5].

שיטה זו מציעה תמונה מדויקת יותר של המוצר הסופי, שכן היא משקפת כיצד הגנים מתבטאים ולא רק את מיקומם הגנומי. על ידי שילוב סריקה גנומית עם מבחנים פונקציונליים, יצרנים יכולים להבטיח שכל אצווה עומדת בסטנדרטים מחמירים של בטיחות, איכות וביצועים בכל שלב של הייצור.

סיכום

שמירה על יציבות גנטית היא קריטית לייצור בשר מתורבת בצורה בטוחה ועקבית. פרנסיסקו ג'יי. מולינה-רואיז ועמיתיו ממעבדת תאי גזע ורפואה רגנרטיבית מדגישים את הסיכונים:

שינויים גנטיים ב-hPSCs עלולים לסכן לא רק את בטיחות המוצרים המבוססים על תאי hPSC... אך גם להוביל לנטייה להבדלה הטרוגנית של חומר המוצא, פרופילי ביטוי גנים משתנים וחוסר יעילות של המוצר הסופי של התאים [10].

הסיכונים הם משמעותיים - מעל 531 קווי תאים שזוהו באופן שגוי תועדו על ידי הוועדה הבינלאומית לאימות קווי תאים [1].

התמודדות עם בעיות אלו דורשת מסגרת בקרת איכות חזקה. זה כולל שילוב של שיטות כמו פרופיל STR, קריוטיפינג G-banding, aCGH ו-NGS מתקדם [5], לצד מערכות כמו ISO 9001:2015 כדי לתקנן תהליכים ולמזער חריגות כרומוזומליות [13] .

גורמים כלכליים גם מניעים את הצורך באמצעים אלו.סחף גנטי יכול לגרום לתאים מוטנטים לקבל יתרון גדילה, מה שעלול לקלקל אצוות ייצור שלמות [10][11]. עם ההתמקדות הגוברת בתאי גזע פלוריפוטנטיים אנושיים, הביקוש לקווי תאים יציבים מעולם לא היה גדול יותר. כפי שמסביר פרופסור דיוויד ל. קפלן מ-אוניברסיטת טאפטס:

קווי תאים בני אלמוות נחשבים בדרך כלל לדרישה ליצירת כמויות עצומות של רקמה אכילה מתהליך ביולוגי יציב וחזק [14].

עבור יצרני בשר מתורבת, בקרת איכות חייבת להיות משולבת בכל שלב - מסינון פלסמידים ועד לניטור ייצור בקנה מידה גדול. על ידי שילוב בדיקות יסודיות עם אסטרטגיות מניעה, יצרנים יכולים להבטיח תוצאות עקביות ואמינות. Cellbase משמש כקישור חיוני, המחבר בין יצרנים לספקים מהימנים של כלים אנליטיים, מדיות גידול וביוראקטורים. בסופו של דבר, השגת אישור רגולטורי וכדאיות מסחרית תלויה בשמירה על יציבות גנטית בכל אצווה.

שאלות נפוצות

באיזו תדירות יש לבצע בדיקות יציבות גנטית במהלך הגדלת קנה המידה?

בדיקות יציבות גנטית הן שלב קריטי במהלך הגדלת קנה המידה ויש לבצע אותן באופן קבוע. תדירות הבדיקות תלויה בעיקר בקו התאים הספציפי ובתהליך המדובר. כדי להפחית את הסיכוי למוטציות ולשמור על תכונות הגזע של התאים, מומלץ לקבוע גבול מעבר המבוסס על ניתוח גנטי.

אילו בדיקות מזהות בצורה הטובה ביותר מוטציות קטנות ושינויים כרומוזומליים גדולים?

בדיקות כגון ניתוח מערך SNP והגנוטיפינג של SNP ברחבי הגנום הן יעילות לזיהוי מוטציות קטנות, שינויים במספר העותקים ואנופלואידיה. שיטות אלו מועילות במיוחד לזיהוי שינויים כרומוזומליים גדולים בקווי תאים.

מהי הדרך הפשוטה ביותר למנוע סחף גנטי בין אצוות ייצור?

כדי למזער סחף גנטי, חשוב לבצע ניתוחים גנטיים ותפקודיים סדירים של קווי תאים ולהגביל את מספר המעברים שהם עוברים. יש ליישם פרקטיקות כמו הקמת בנקי תאים ראשיים ובדיקת יציבות גנטית באופן שגרתי, כפי שמומלץ בפרוטוקולי בקרת איכות. אמצעים אלו הם המפתח לשמירה על עקביות ולהבטחת תוצאות אמינות בין אצוות ייצור שונות.

פוסטים קשורים בבלוג

Author David Bell

About the Author

David Bell is the founder of Cultigen Group (parent of Cellbase) and contributing author on all the latest news. With over 25 years in business, founding & exiting several technology startups, he started Cultigen Group in anticipation of the coming regulatory approvals needed for this industry to blossom.

David has been a vegan since 2012 and so finds the space fascinating and fitting to be involved in... "It's exciting to envisage a future in which anyone can eat meat, whilst maintaining the morals around animal cruelty which first shifted my focus all those years ago"