Pasar B2B Daging Budidaya Pertama di Dunia: Baca Pengumuman

Dinamika Aliran dalam Bioreaktor Berbasis Scaffold

Flow Dynamics in Scaffold-Based Bioreactors

David Bell |

Cara cairan bergerak dalam bioreaktor berbasis scaffold adalah pengubah permainan untuk produksi daging budidaya. Aliran yang tepat memastikan sel mendapatkan nutrisi dan oksigen yang cukup sambil menghilangkan limbah, terutama untuk struktur jaringan yang tebal. Inilah mengapa hal ini penting:

  • Batas difusi: Nutrisi hanya menembus 100–200 μm melalui difusi, meninggalkan sel bagian dalam kelaparan.
  • Bioreaktor perfusi: Sistem ini secara aktif mendorong medium kultur melalui scaffold, meningkatkan pengiriman nutrisi dan penghilangan limbah.
  • Perdagangan stres geser: Aliran yang terkontrol merangsang pertumbuhan, tetapi gesekan berlebih dapat merusak sel.

Faktor kunci termasuk tingkat perfusi, desain scaffold (ukuran pori, porositas), dan model komputasi untuk memprediksi perilaku aliran. Bioreaktor dan alat canggih, seperti yang tersedia melalui Cellbase, berperan penting dalam meningkatkan produksi daging budidaya dengan kualitas yang konsisten.

Baca lebih lanjut untuk wawasan tentang kontrol aliran, desain scaffold, dan bagaimana alat komputasi membentuk bidang ini.

Modeling Bioreaktor Perfusi Menggunakan ANSYS Fluent - Bagian 1

ANSYS Fluent

Penjelasan Tingkat Perfusi dan Tegangan Geser

Optimal Shear Stress Ranges and Flow Parameters for Scaffold-Based Bioreactors

Rentang Tegangan Geser Optimal dan Parameter Aliran untuk Bioreaktor Berbasis Scaffold

Bagaimana Tingkat Perfusi Mempengaruhi Pertumbuhan Sel

Tingkat perfusi sangat penting untuk mengontrol bagaimana nutrisi disampaikan dan limbah dihilangkan melalui aliran medium. Jika aliran terlalu rendah, sel kekurangan nutrisi esensial. Di sisi lain, aliran yang berlebihan dapat merusak sel secara fisik. Kuncinya adalah menemukan keseimbangan yang tepat untuk memaksimalkan pertukaran nutrisi tanpa menyebabkan kerusakan.

Studi menunjukkan bahwa kultur perfusi dapat menghasilkan proliferasi sel lebih dari dua kali lipat dibandingkan dengan kultur statis selama dua minggu [4]. Dalam beberapa kasus, perbedaannya bahkan lebih mencolok. Misalnya, dalam scaffold berbentuk bola, volume sel meningkat empat kali lipat dibandingkan dengan scaffold berbentuk kubus setelah tiga minggu perfusi [7]. Ini bukan hanya tentang meningkatkan laju aliran - ini tentang menciptakan kondisi mekanis yang tepat untuk pertumbuhan.

"Pencampuran dan tekanan geser fluida yang diinduksi oleh perfusi akan meningkatkan perkembangan dengan merangsang sel secara mekanis, memungkinkan mereka berdiferensiasi menjadi jenis sel yang diinginkan." – SN Applied Sciences [4]

Tekanan geser juga memainkan peran penting. Tingkat rendah (~0.05 mPa) mendorong pertumbuhan sel, sementara tingkat yang lebih tinggi (15 mPa–1.5 Pa) mendorong diferensiasi dan mengaktifkan gen spesifik jaringan [2][8]. Ini berarti strategi perfusi perlu beradaptasi saat sel bergerak dari pertumbuhan awal ke pembentukan jaringan fungsional. Bagian berikutnya membahas cara mengelola tegangan geser secara efektif untuk melindungi kelangsungan hidup sel.

Mengendalikan Tegangan Geser untuk Mempertahankan Kelangsungan Hidup Sel

Tegangan geser dinding (WSS) adalah pedang bermata dua. Untuk rekayasa jaringan tulang, rentang ideal adalah antara 10–30 mPa, yang mendukung mineralisasi. Namun, melebihi 60 mPa dapat merusak kelangsungan hidup sel [5]. Seiring meningkatnya kepadatan sel, porositas scaffold menurun, yang dapat membatasi jalur aliran dan menyebabkan lonjakan lokal dalam tegangan geser jika laju aliran tetap konstan.

Salah satu cara untuk mengatasi ini adalah dengan secara bertahap mengurangi kecepatan aliran seiring meningkatnya kepadatan jaringan.Sebagai contoh, kondisi aliran konstan mengurangi persentase sel yang terpapar WSS optimal dari 50% menjadi 18,6% selama 21 hari. Sebaliknya, menurunkan laju aliran seiring waktu menjaga kondisi optimal untuk lebih dari 40% sel [5]. Selama fase penanaman, kalibrasi yang tepat sangat penting; laju aliran 120 µl/menit adalah ideal, sementara laju yang lebih tinggi seperti 600 µl/menit dapat menciptakan pusaran, mencegah penempelan scaffold yang tepat [3].

Geometri scaffold juga memiliki dampak besar. Cara aliran berinteraksi dengan struktur scaffold perlu selaras dengan arsitekturnya untuk menjaga kesehatan sel dan mendukung pertumbuhan jaringan. Sebagai contoh, di bawah kondisi aliran yang sama, elemen scaffold berbentuk bola menghasilkan WSS rata-rata 20 mPa, dibandingkan dengan 11 mPa pada elemen berbentuk kubus [7]. Ini menyoroti bagaimana desain scaffold yang tepat, dikombinasikan dengan kontrol aliran yang hati-hati, sangat penting untuk mengoptimalkan hasil.

Desain Bioreaktor untuk Pengendalian Aliran

Porositas Rangka dan Desain Saluran Aliran

Struktur rangka memainkan peran penting dalam mengelola aliran fluida dan distribusi sel. Faktor kunci seperti ukuran pori, persentase porositas, dan pengaturan pori secara langsung mempengaruhi bagaimana fluida bergerak dan gaya geser yang bekerja pada sel [1] . Pada dasarnya, ukuran dan tata letak pori menentukan kecepatan aliran dan bagaimana tegangan geser didistribusikan di seluruh rangka.

"Di bawah kondisi perfusi yang diterapkan, deposisi sel terutama ditentukan oleh tegangan geser dinding lokal, yang, pada gilirannya, sangat dipengaruhi oleh arsitektur jaringan pori dari rangka." – Biomaterials Journal [1]

Desain rangka biasanya bersifat isotropik atau gradien.Kerangka isotropik memiliki ukuran pori yang seragam - sekitar 412 μm dengan porositas 62% - menghasilkan laju geser yang stabil berkisar antara 15 hingga 24 s⁻¹. Sebaliknya, kerangka gradien memiliki ukuran pori yang bervariasi (250–500 μm) dan tingkat porositas (35%–85%), menciptakan rentang geser yang lebih luas dari 12–38 s⁻¹ [1]. Desain gradien ini mendorong sel untuk berkumpul di zona tertentu, sementara kerangka isotropik memastikan distribusi yang merata di seluruh struktur.

Saat sel tumbuh dan mengisi ruang kosong kerangka, mereka mengurangi porositasnya, mengubah dinamika fluida. Kerangka yang lebih padat membutuhkan tekanan yang lebih tinggi untuk mempertahankan aliran, yang berisiko menghasilkan tekanan geser yang berlebihan. Untuk pertumbuhan jaringan yang efektif, radius pori sekitar 100 μm sangat penting [2][6]. Namun, ukuran pori yang ideal bervariasi tergantung pada jenis jaringan yang sedang dibudidayakan.Faktor-faktor ini penting untuk merancang bioreaktor yang secara efektif mengelola aliran.

Jenis Bioreaktor dan Metode Pengendalian Aliran

Bioreaktor perfusi efisien dalam mendistribusikan nutrisi secara merata sambil menerapkan tekanan geser yang terkontrol. Dengan mengarahkan medium melalui scaffold, mereka mendukung pengembangan jaringan yang lebih tebal [2] .

Reaktor tempat tidur terisi, di sisi lain, dirancang untuk operasi volume tinggi tetapi menghadapi tantangan dengan porositas radial yang tidak merata. Ini dapat menyebabkan "channelling", di mana cairan melewati area tertentu, mengganggu distribusi yang seragam. Sebagai contoh, pada November 2017, peneliti menguji scaffold PCL komersial dari 3D Biotek (diameter 5 mm, tinggi 1,5 mm). Mereka menemukan bahwa laju aliran 120 μl/menit menghasilkan efisiensi penanaman sebesar 11% ± 0,61%. Namun, pada 600 μl/menit, efisiensi turun menjadi 6,5% ± 0.61% disebabkan oleh pembentukan vortex, yang menjebak sel dalam zona resirkulasi alih-alih membiarkan mereka menempel pada serat scaffold [3]. Ini menyoroti betapa pentingnya pengendalian aliran untuk mencapai penanaman sel yang konsisten.

Sistem yang berbeda menggunakan metode yang berbeda untuk mengelola aliran. Bioreaktor perfusi berfokus pada mengarahkan aliran melalui scaffold, sementara sistem serat berongga mengatur aliran masuk lumen dan tekanan balik keluaran untuk mensimulasikan pengiriman nutrisi mirip dengan kapiler [9]. Sistem canggih menggabungkan sensor dan monitor untuk menjaga kondisi yang stabil [8]. Selain itu, untuk menghindari gelembung udara - yang dapat merusak sel atau mengganggu aliran - menempatkan reservoir medium di atas ruang kultur memanfaatkan tekanan hidrostatik dengan baik [8].

Menggunakan Model Komputasi untuk Memprediksi Perilaku Aliran

Manfaat CFD dalam Desain Bioreaktor

Model dinamika fluida komputasi (CFD) adalah alat yang kuat untuk memprediksi bagaimana cairan bergerak melalui struktur scaffold. Dengan menyelesaikan persamaan Navier-Stokes, model ini memberikan wawasan tentang tegangan geser dan distribusi nutrisi - tanpa perlu prototipe fisik. Ini tidak hanya mengurangi biaya pengembangan tetapi juga menghilangkan risiko kontaminasi yang dapat terjadi selama uji coba eksperimen berulang [11][3][10].

Geometri scaffold dapat dirancang menggunakan CAD untuk bentuk standar atau pencitraan μCT untuk struktur yang lebih rumit [2][10]. Kembali pada bulan Maret 2005, para peneliti menggunakan metode Lattice-Boltzmann dengan pencitraan μCT pada resolusi voxel 34 μm untuk mensimulasikan bagaimana media mengalir melalui scaffold silinder. Model mereka menunjukkan bahwa rata-rata tegangan geser permukaan sebesar 5×10⁻⁵ Pa terkait dengan peningkatan proliferasi sel [2].

CFD juga membantu memprediksi bagaimana pola aliran berkembang saat sel tumbuh dan mengisi ruang kosong dalam scaffold. Sebagai contoh, pada bulan November 2021, sebuah studi memanfaatkan COMSOL Multiphysics untuk mensimulasikan aliran fluida melalui scaffold 3DP/TIPS hierarkis. Dengan memodelkan 38 saluran masuk dalam scaffold berdiameter 10 mm, para peneliti menyetel kecepatan pompa peristaltik untuk mencapai tegangan geser dinding sebesar 20 mPa, ideal untuk sel preosteoblastik murine [4]. Model-model ini bahkan dapat menggabungkan faktor kompleks seperti kinetika pertumbuhan sel dan tingkat konsumsi oksigen menggunakan persamaan Michaelis-Menten.Ini memungkinkan desainer untuk mengantisipasi bagaimana perkembangan jaringan akan mempengaruhi dinamika fluida seiring waktu [11][12].

"CFD dapat membantu mengurangi biaya, waktu, dan risiko kontaminasi yang melekat pada eksperimen yang diperlukan." – Future Foods Mini-Review [11]

Kemampuan prediktif ini juga membuka jalan untuk mengintegrasikan umpan balik sensor untuk menyesuaikan kondisi aliran secara dinamis.

Monitoring Real-Time dengan Sensor

Menggabungkan sensor dengan model komputasi membawa desain bioreaktor selangkah lebih maju dengan memungkinkan penyesuaian real-time untuk mempertahankan kondisi optimal. Misalnya, pada bulan Desember 2025, peneliti menguji BioAxFlow bioreaktor menggunakan COMSOL Multiphysics 6.3 untuk mensimulasikan distribusi oksigen dan kecepatan fluida.Mereka menerapkan tingkat konsumsi oksigen yang dinormalisasi sel sebesar 2 nmol min⁻¹ 10⁻⁶ sel untuk sel SAOS-2 pada scaffold PLA. Hasilnya menunjukkan bahwa geometri ruang mendukung distribusi sel yang merata tanpa memerlukan pengaduk mekanis [13].

Sistem canggih sekarang dapat menyesuaikan laju aliran berdasarkan tingkat oksigen yang dipantau, memastikan bahwa bahkan bagian tengah scaffold tetap teroksigenasi dengan baik [13]. Namun, satu tantangan tetap ada: mengukur tegangan geser lokal di dalam scaffold. Seperti yang disoroti oleh X. Yan dari University of Saskatchewan: "Karena kurangnya sensor yang memadai, sulit, bahkan tidak mungkin, untuk mengukur distribusi tegangan geser lokal di dalam scaffold" [10]. Keterbatasan ini menekankan nilai pemodelan CFD, yang dapat memberikan prediksi terperinci yang saat ini tidak dapat dicapai oleh sensor fisik.

Menerapkan Dinamika Aliran pada Produksi Daging Budidaya

Meningkatkan Kualitas Jaringan Melalui Kontrol Aliran

Menggunakan dinamika aliran yang terkontrol dapat secara signifikan meningkatkan kualitas daging budidaya dengan memastikan distribusi sel yang seragam di seluruh kerangka. Salah satu masalah utama dengan kultur statis adalah pertumbuhan sel sering terkonsentrasi di sekitar tepi kerangka, meninggalkan bagian tengah yang kurang berkembang. Dinamika aliran menyelesaikan ini dengan meningkatkan transportasi massa, memungkinkan oksigen dan nutrisi mencapai inti kerangka sambil secara efisien menghilangkan limbah. Keseimbangan ini penting untuk menghasilkan produk daging budidaya berkualitas tinggi dan berstruktur baik.

Tegangan geser memainkan peran penting di sini. Sebagai contoh, studi menunjukkan bahwa tegangan geser permukaan rata-rata sebesar 5×10⁻⁵ Pa mendorong proliferasi sel dalam konstruksi 3D. Sebagai perbandingan, kerangka yang dirancang untuk jaringan tulang sering kali bertujuan sekitar 20 mPa (0.02 Pa) pada awal budidaya untuk memberikan stimulasi mekanis [2][4]. Namun, saat sel mengisi pori-pori scaffold, saluran aliran menyempit, secara alami meningkatkan tegangan geser meskipun kecepatan pompa tetap konstan [4].

"Heterogenitas yang diamati dalam sintesis matriks diyakini sebagai hasil dari distribusi nutrisi yang tidak memadai dan penghilangan produk limbah dalam konstruksi." – Robert Guldberg [2]

Efektivitas penanaman sel awal juga menyoroti bagaimana dinamika aliran mempengaruhi hasil jaringan. Penelitian menggunakan scaffold PCL menemukan bahwa laju aliran 120 μl/menit adalah ideal untuk penanaman, sementara laju yang lebih tinggi, seperti 600 μl/menit, mengurangi efisiensi karena pembentukan pusaran, yang menjebak sel dalam zona resirkulasi [3]. Mencapai distribusi sel awal yang merata sangat penting untuk memastikan kualitas produk akhir. Temuan ini menekankan pentingnya menggunakan peralatan yang mampu memenuhi persyaratan aliran yang tepat.

Mendapatkan Peralatan Melalui Cellbase

Mencapai kontrol aliran yang tepat dan mengoptimalkan kualitas jaringan memerlukan akses ke peralatan khusus. Di sinilah Cellbase berperan sebagai pasar B2B yang berdedikasi, menghubungkan peneliti dan tim produksi dengan pemasok yang memahami kebutuhan teknis produksi daging budidaya.

Melalui Cellbase, tim dapat mendapatkan scaffold dengan arsitektur yang disesuaikan, seperti yang menggabungkan 3D-plotting untuk makrosaluran dengan pemisahan fase yang diinduksi secara termal (TIPS) untuk mikropori. Desain ini meningkatkan difusi nutrisi dan migrasi sel [4]. Pasar ini juga menampilkan berbagai peralatan, termasuk pompa suntik untuk perfusi volume rendah (12–600 μl/min) dan pompa peristaltik untuk operasi skala lebih besar [3][4].

Bagi mereka yang meningkatkan produksi, Cellbase menawarkan opsi bioreaktor yang sesuai dengan karakteristik aliran yang berbeda. Ini termasuk bioreaktor tangki berpengaduk untuk ekspansi sel dengan kepadatan tinggi, bioreaktor gelombang/rocking yang dirancang untuk sel punca yang sensitif terhadap gesekan (mampu mempertahankan tegangan geser serendah 0,01 Pa), dan bioreaktor serat berongga dengan jari-jari dalam antara 300 dan 400 μm, dioptimalkan untuk pertumbuhan sel yang padat [11]. Dengan menyederhanakan pengadaan dan memastikan kompatibilitas, Cellbase membantu tim produksi tetap unggul di pasar di mana konsumsi daging global diproyeksikan tumbuh sebesar 14% pada tahun 2030 [11].

Kesimpulan

Mengelola dinamika aliran dalam bioreaktor berbasis scaffold sangat penting untuk memproduksi daging budidaya berkualitas tinggi. Keberhasilan bergantung pada pengendalian laju perfusi dan tegangan geser secara efektif selama proses budidaya. Kultur statis tidak mampu mendukung struktur jaringan tebal dan seragam yang dibutuhkan untuk produksi skala komersial. Sel yang terletak lebih dari 100–200 μm dari permukaan sering kali gagal menerima nutrisi dan oksigen yang cukup, menyoroti pentingnya manajemen aliran yang canggih dalam desain bioreaktor [4].

Ketika parameter aliran dioptimalkan, bioreaktor perfusi dapat lebih dari dua kali lipat proliferasi sel dibandingkan dengan kultur statis [4]. Menyesuaikan perfusi dan tegangan geser sangat penting untuk mencapai pertumbuhan jaringan yang konsisten.Sebagai contoh, penelitian yang dilakukan di University of Sheffield pada April 2020 menemukan bahwa secara bertahap mengurangi aliran cairan seiring waktu, alih-alih mempertahankan laju yang konstan, secara signifikan meningkatkan hasil. Setelah 21 hari, 40,9% dari permukaan sel tetap berada dalam rentang tegangan geser optimal, dibandingkan dengan hanya 18,6% dalam kondisi aliran konstan [5]. Perubahan tunggal ini dapat sangat meningkatkan kualitas jaringan dan efisiensi produksi.

"Untuk mencapai jaringan yang lebih termineralisasi, cara konvensional memuat bioreaktor perfusi (i.e. laju/kecepatan aliran konstan) harus diubah menjadi aliran yang menurun seiring waktu." – F. Zhao et al. [5]

Menemukan keseimbangan yang tepat antara transportasi massa dan stimulasi mekanis sangat penting.Aliran yang tidak mencukupi membuat sel-sel dalam kekurangan, sementara aliran yang berlebihan berisiko melepaskan mereka [10][3]. Modeling Computational Fluid Dynamics (CFD) memainkan peran kunci dalam memprediksi kondisi aliran lokal dan mengoptimalkan kinerja bioreaktor [2][10].

Memperbesar produksi juga menghadirkan tantangan peralatan. Dari scaffold dengan struktur hierarkis hingga bioreaktor dengan kontrol aliran yang presisi, mendapatkan alat yang tepat sangat penting. Cellbase membantu perusahaan daging budidaya mengatasi hambatan ini dengan menghubungkan mereka dengan pemasok terverifikasi, memastikan bahwa penelitian dinamika aliran mutakhir diterjemahkan menjadi kesuksesan komersial.

FAQ

Bagaimana cara memilih laju perfusi yang aman untuk scaffold saya?

Menyeimbangkan laju perfusi adalah kunci untuk memastikan keterikatan sel yang sukses dan kinerja scaffold sambil menghindari potensi kerusakan. Memulai dengan laju aliran sedang sering kali merupakan pendekatan yang bijaksana. Dari sana, pantau viabilitas sel dan integritas scaffold dengan cermat saat Anda melakukan penyesuaian bertahap. Menggunakan model komputasi atau data eksperimental yang disesuaikan dengan desain scaffold spesifik Anda dapat memberikan wawasan berharga. Ini membantu menyempurnakan laju perfusi untuk mendukung pertumbuhan sel dan transportasi nutrisi yang optimal, sambil meminimalkan risiko kerusakan akibat tekanan geser.

Bagaimana cara menghindari kerusakan akibat tekanan geser saat jaringan menebal?

Untuk mengurangi risiko kerusakan akibat tekanan geser saat jaringan menebal, penting untuk secara bertahap menurunkan laju aliran perfusi selama kultivasi.Penyesuaian ini membantu menjaga tegangan geser dinding (WSS) dalam rentang ideal 10–30 mPa, yang melindungi sel dari tekanan berlebihan sambil tetap mendorong mineralisasi. Studi komputasi mendukung metode ini, menunjukkan bahwa metode ini dapat secara signifikan meminimalkan jumlah jaringan yang terpapar tegangan geser tinggi, membantu melindungi jaringan yang berkembang dari kerusakan.

Apa yang harus dimasukkan dalam pemodelan CFD untuk prediksi aliran yang realistis?

Pemodelan CFD perlu memasukkan mikrostruktur scaffold, memastikan simulasi aliran fluida yang tepat, dan memberikan analisis terperinci tentang tegangan geser. Selain itu, validasi data eksperimental sangat penting untuk memastikan prediksi sesuai dengan kondisi dunia nyata. Bersama-sama, faktor-faktor ini berkontribusi pada pemahaman yang lebih dalam tentang dinamika aliran dalam bioreaktor berbasis scaffold.

Artikel Blog Terkait

Author David Bell

About the Author

David Bell is the founder of Cultigen Group (parent of Cellbase) and contributing author on all the latest news. With over 25 years in business, founding & exiting several technology startups, he started Cultigen Group in anticipation of the coming regulatory approvals needed for this industry to blossom.

David has been a vegan since 2012 and so finds the space fascinating and fitting to be involved in... "It's exciting to envisage a future in which anyone can eat meat, whilst maintaining the morals around animal cruelty which first shifted my focus all those years ago"