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5 Métodos para Pruebas de Viabilidad a Largo Plazo

5 Methods for Long-Term Viability Testing

David Bell |

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Las pruebas de viabilidad a largo plazo son críticas para la producción de carne cultivada, asegurando que las líneas celulares permanezcan estables, efectivas y seguras con el tiempo. Con más de 140 empresas invirtiendo más de £2.7 mil millones para 2025, los métodos de prueba confiables son esenciales para el éxito comercial. Este artículo explora cinco enfoques clave:

  • Ensayos de Viabilidad: Evalúan la salud celular a través de la integridad de la membrana, la actividad metabólica y la producción de energía.
  • Monitoreo de Actividad Metabólica: Miden la función mitocondrial y la producción de ATP para rastrear la dinámica energética en tiempo real.
  • Protocolos de Pruebas de Estrés: Simulan condiciones de producción como estrés oxidativo, privación de nutrientes y cambios de pH.
  • Pruebas de Estabilidad Cromosómica: Aseguran la consistencia genética detectando anomalías cromosómicas a través de secuenciación y cariotipado.
  • Ensayos de Rendimiento Funcional: Confirman que las células realizan tareas esenciales como la división, producción de proteínas y metabolismo sostenido.

Cada método ofrece perspectivas únicas sobre la salud y el rendimiento celular, convirtiéndolos en herramientas indispensables para el desarrollo de carne cultivada. A continuación, detallamos cómo funcionan estos métodos, sus usos y los desafíos que abordan.

Comparación de Diferentes Métodos para Medir la Viabilidad Celular

1. Ensayos de Viabilidad

Los ensayos de viabilidad se utilizan para evaluar la salud celular examinando la integridad de la membrana, la actividad metabólica y la producción de energía. Son esenciales tanto para los exámenes iniciales como para el monitoreo continuo de la viabilidad celular.

Tipo de Medición (Cuantitativa vs. Cualitativa)

Los ensayos cuantitativos proporcionan datos numéricos, permitiendo análisis estadísticos y comparaciones.Por ejemplo, los ensayos de luminiscencia de ATP, como los realizados con CellTiterGlo-3D, utilizan tecnología bioluminiscente para medir los niveles de energía [1]. De manera similar, los ensayos de ADN por fluorescencia, como PicoGreen, cuantifican el contenido total de ADN [1]. El ensayo MTT mide la absorbancia a 570nm usando un lector de microplacas, con la intensidad de la señal correlacionando directamente con el número de células vivas [5].

Métodos cualitativos se centran en la confirmación visual de la salud celular. Por ejemplo, Trypan Blue es excluido por células sanas debido a sus membranas intactas [5]. De manera similar, colorantes como Propidium iodide y 7-AAD son excluidos por células viables pero penetran aquellas con membranas comprometidas [7]. Estos métodos a menudo se analizan utilizando citometría de flujo o microscopía de inmunofluorescencia.

Resolución Temporal (Tiempo Real vs. Periódico)

La mayoría de los ensayos de viabilidad se realizan de manera periódica o en un punto final. Técnicas como la incorporación de BrdU o la tinción de Ki-67 requieren la fijación de células, capturando datos en puntos de tiempo específicos [8]. Al usar colorantes no fijables como el Ioduro de Propidio, el tiempo es crítico, ya que el número de células teñidas puede aumentar durante el proceso de tinción a medida que las células continúan muriendo [8].

"El tiempo es crítico al usar estos colorantes porque la fracción de células teñidas aumenta durante la tinción a medida que las células continúan muriendo." - Anna Quinlan, Bio-Radiations [8]

Otros métodos, como CFSE, permiten el seguimiento a largo plazo mediante el etiquetado covalente de proteínas intracelulares, que se transmiten a través de las divisiones celulares [8]. Ensayos de ATP luminiscentes y pruebas basadas en Resazurina, por otro lado, ofrecen resultados rápidos sin requerir períodos de incubación prolongados [8].

Uso Principal (Cribado vs. Validación)

Aplicaciones de cribado son adecuadas para formatos de alto rendimiento. Métodos como Resazurina, XTT, y ensayos de ATP están diseñados para su uso con lectores de microplacas, permitiendo a los investigadores probar múltiples condiciones simultáneamente [8]. XTT tiene la ventaja adicional de producir un tinte soluble en agua, eliminando la necesidad del paso de solubilización requerido por MTT. Resazurina es particularmente ventajosa debido a su estabilidad y naturaleza no tóxica en comparación con las sales de tetrazolio [8].

Propósitos de validación a menudo requieren pruebas ortogonales, donde se utilizan dos métodos diferentes para confirmar resultados.Esto es especialmente importante en entornos de andamiaje 3D, donde la difusión de reactivos puede ser más lenta, o los componentes del ensayo pueden interactuar con los materiales [1]. Por ejemplo, combinar ensayos de ATP (para evaluar la actividad metabólica) con ensayos de ADN (para medir la masa biológica total) proporciona perspectivas complementarias, mejorando la fiabilidad de la caracterización de líneas celulares [1].

2. Monitoreo de Actividad Metabólica

El monitoreo de la actividad metabólica se centra en evaluar la función mitocondrial y la producción de ATP bajo diferentes condiciones de cultivo [7]. Este método proporciona valiosas perspectivas sobre la salud celular, especialmente durante períodos prolongados de cultivo. Al ofrecer datos en tiempo real sobre la dinámica energética celular, complementa las pruebas de viabilidad tradicionales.

Tipo de Medición (Cuantitativa vs. Cualitativo)

Los métodos cuantitativos son la piedra angular del monitoreo metabólico, proporcionando datos numéricos precisos adecuados para el análisis estadístico. Técnicas como la luminiscencia de ATP y los métodos de análisis espectral, incluidos XTT y Resazurina, son ampliamente utilizados por su precisión [7][9]. Estos métodos son particularmente efectivos en sistemas de carne cultivada basados en andamios, ya que las pruebas de recuperación pueden ayudar a identificar cualquier posible interferencia en el ensayo [9].

Resolución Temporal (Tiempo real vs. Periódico)

Los ensayos tradicionales de XTT y MTT dependen del muestreo periódico, mientras que los sistemas de monitoreo en tiempo real utilizan reactivos no líticos para rastrear continuamente la misma población celular durante hasta 72 horas. Este enfoque en tiempo real es crucial para detectar el inicio de la toxicidad con mayor precisión [2]. Los métodos periódicos, por otro lado, están limitados por sus tiempos de incubación, lo que puede oscurecer las disminuciones en la viabilidad que ocurren durante este período [2].

"Una desventaja de todos los ensayos de reducción de tetrazolio o resazurina es que dependen de la acumulación de productos coloreados o fluorescentes con el tiempo. Dado que la señal aumenta gradualmente con el tiempo, no se puede detectar una disminución en la viabilidad celular durante esta larga incubación." - Promega [2]

Uso principal (Cribado vs. Validación)

Los ensayos luminiscentes basados en ATP son altamente sensibles y están bien adaptados para el cribado de alto rendimiento en formatos de múltiples pocillos [2]. Su procedimiento sencillo de "agregar-mezclar-medir" permite probar múltiples condiciones a la vez. Sin embargo, la validación en sistemas de andamios 3D requiere enfoques más detallados, ya que los materiales en estos entornos pueden ralentizar la difusión de reactivos o interferir con el ensayo [9]. Realizar múltiples pruebas independientes asegura resultados precisos sobre la salud celular [7], allanando el camino para protocolos de pruebas de estrés adicionales.

3. Protocolos de Pruebas de Estrés

Los protocolos de pruebas de estrés están diseñados para evaluar cómo responden las células a factores de estrés que imitan las condiciones de producción. Estos estresores pueden incluir estrés oxidativo (medido a través de especies reactivas de oxígeno), toxicidad química, privación de nutrientes y cambios en las condiciones ambientales como pH, temperatura y niveles de CO₂ [2][3][4]. En los sistemas de cultivo 3D, especialmente aquellos utilizados en la producción de carne cultivada, desafíos adicionales como el estrés mecánico y las limitaciones de difusión dentro de los andamios se vuelven críticos. Estos factores pueden influir tanto en la salud de las células como en la fiabilidad de los ensayos [9]. Al complementar los datos de viabilidad y metabólicos, las pruebas de estrés proporcionan información sobre cómo las líneas celulares enfrentan los desafíos relacionados con la producción.

Tipo de Medición (Cuantitativa vs. Cualitativa)

Las pruebas de estrés modernas dependen en gran medida de técnicas cuantitativas, como la absorbancia, fluorescencia o luminiscencia, para determinar los valores de IC50 [4]. Los ensayos de luminiscencia de ATP destacan por su sensibilidad en comparación con los métodos más antiguos basados en tetrazolio [2]. Por ejemplo, los reactivos basados en resazurina como alamarBlue HS reducen significativamente la fluorescencia de fondo (en más del 50%) y mejoran la relación señal-fondo al doble en comparación con las versiones estándar [4]. Al trabajar con células en andamios, es crucial validar los hallazgos utilizando métodos complementarios, como comparar la luminiscencia de ATP con la fluorescencia de ADN, para asegurar que el material del andamio no interfiera con el rendimiento del ensayo [9].

Resolución Temporal (Tiempo real vs. Periódico)

Ha habido un cambio de las mediciones de punto final al monitoreo cinético en tiempo real. Este enfoque permite el seguimiento continuo de las respuestas al estrés durante períodos de hasta 72 horas [2]. Elimina la necesidad de placas adicionales, ahorrando tanto tiempo como recursos celulares.

Uso Principal (Cribado vs. Validación)

Para el cribado de alto rendimiento, las pruebas de estrés a menudo utilizan protocolos rápidos de "añadir-mezclar-medir". Estos métodos son eficientes, reduciendo la variabilidad y el trabajo al manejar miles de muestras [2]. Por otro lado, los protocolos de validación requieren un enfoque más riguroso. Combinan múltiples marcadores, como la actividad metabólica y la integridad de la membrana, para confirmar los mecanismos detrás de la muerte celular [10]. Además, normalizar los datos funcionales contra la viabilidad asegura que los efectos específicos del tratamiento no se confundan con toxicidad general [4].

"Los compuestos experimentales pueden no inducir la muerte celular, sino alterar el metabolismo celular o la proliferación celular, lo que puede interpretarse incorrectamente como una viabilidad reducida." - Cell Signalling Technology [10]

4.Estabilidad Cromosómica y Caracterización Genética

Las pruebas de estabilidad cromosómica son esenciales para garantizar que las líneas celulares mantengan su integridad genética durante el cultivo a largo plazo. En el contexto de la producción de carne cultivada, este proceso desempeña un papel clave en el mantenimiento de la consistencia y la seguridad. Con el tiempo, las líneas celulares pasan por numerosos pasajes, e incluso pequeños cambios cromosómicos - como aneuploidía (un conteo cromosómico anormal) - pueden alterar significativamente el comportamiento celular, la expresión génica y los resultados de la edición del genoma [11]. Al centrarse en la estabilidad cromosómica, los productores pueden asegurar que las líneas celulares sigan siendo fiables y seguras durante un uso prolongado.

Tipo de Medición (Cuantitativa vs. Cualitativa)

Las pruebas de estabilidad cromosómica a menudo combinan métodos tanto cuantitativos como cualitativos.Por ejemplo:

  • La secuenciación de próxima generación (NGS) de lectura corta analiza cuantitativamente la profundidad de lectura y las frecuencias alélicas, permitiendo la detección de variaciones en el número de copias a gran escala [11].
  • La citometría de flujo proporciona mediciones cuantitativas del contenido de ADN, identificando cambios en todo el genoma como la triploidización o la poliploidía [11][6].
  • El cariotipado y la hibridación in situ fluorescente (FISH) ofrecen una confirmación cualitativa y visual de anomalías cromosómicas específicas [11].
  • La secuenciación de lectura larga ofrece una vista cuantitativa más detallada de las variaciones estructurales pero requiere mayores recursos [11].

Esta combinación de enfoques asegura una comprensión integral de la estabilidad cromosómica, equilibrando precisión con practicidad.

Resolución Temporal (En tiempo real vs. Periódica)

Las pruebas de estabilidad cromosómica se realizan de manera periódica, ya que requieren procesos como la fijación celular o la extracción de ADN/ARN, lo que impide el monitoreo en tiempo real [11][6]. La frecuencia de las pruebas depende del historial de la línea celular y del uso previsto.

Por ejemplo, un estudio de 2024 publicado en BMC Genomics examinó la línea celular porcina PK15 utilizando secuenciación Illumina. Los investigadores compararon una muestra de un laboratorio universitario (cobertura de 56X) con una muestra de ATCC (cobertura de 29X). La muestra que había sido pasada durante más de una década mostró una variación estructural y clonal significativamente mayor que una muestra pasada más recientemente.Esto destaca cómo la inestabilidad cromosómica puede acumularse con el tiempo, particularmente en líneas celulares inmortalizadas [11]. Por lo tanto, el monitoreo regular es crucial para identificar y abordar tales cambios.

Uso Principal (Cribado vs. Validación)

Los métodos de estabilidad cromosómica se dividen en herramientas de cribado y herramientas de validación:

  • Las herramientas de cribado como la secuenciación de lectura corta y la citometría de flujo se utilizan para el monitoreo rutinario.
  • Las herramientas de validación como FISH y el cariotipado confirman anomalías específicas [11].

El cribado es especialmente importante antes de la edición del genoma. Por ejemplo, un ensayo de edición del genoma con un 20% de eficiencia de reparación dirigida por homología en un sitio diploide podría caer a solo un 0.8% de eficiencia en un sitio trisómico [11].

"Sugerimos que se investigue la ploidía del genoma de las líneas celulares antes de iniciar cualquier tipo de ensayo de interrogación de edición genómica dirigida" - BMC Genomics [11]

5. Ensayos de Rendimiento Funcional

Los ensayos de rendimiento funcional están diseñados para determinar si las células están operando como deberían. Esto es especialmente importante en la producción de carne cultivada, donde una célula podría parecer viable - membrana intacta y todo - pero no dividirse, producir proteínas o mantener la actividad metabólica en los niveles necesarios para la producción a gran escala [6]. Estos ensayos se centran en la actividad biológica, como la producción de ATP, las tasas metabólicas y la síntesis de ADN, para asegurar que las líneas celulares conserven sus capacidades funcionales [1]. A diferencia de las pruebas básicas de viabilidad, estos métodos confirman que las células están realizando todas las tareas esenciales necesarias para la producción continua.

"Las células viables a menudo son necesarias para el mecanismo de acción previsto, mediante el cual las células vivas regeneran tejido o secretan factores para inducir la regeneración." - NIST [1]

Tipo de Medición (Cuantitativa vs. Cualitativa)

Los ensayos funcionales se basan en pruebas de viabilidad y metabólicas al medir el rendimiento real de las células. La mayoría de estos ensayos producen datos cuantitativos. Por ejemplo, los ensayos de luminiscencia de ATP proporcionan información numérica precisa sobre la actividad metabólica [1]. De manera similar, los ensayos de cuantificación de ADN sirven como una medida complementaria [1]. Los ensayos metabólicos como MTT y XTT dependen de enzimas mitocondriales que reducen sustratos colorimétricos, con lecturas de absorbancia a 450 nm que indican el número relativo de células viables [6]. Por otro lado, los métodos cualitativos, como el uso de colorantes nucleares para observar la condensación de la cromatina, ofrecen una confirmación visual de la actividad celular [6].

Resolución Temporal (Tiempo real vs. Periódico)

Muchos ensayos de rendimiento funcional dependen de mediciones de punto final, que se toman después de que las células son fijadas o lisadas [6]. Sin embargo, las técnicas no invasivas de vanguardia, incluyendo la imagen fotoacústica, la imagen de tiempo de vida de fluorescencia y la tomografía de coherencia óptica, permiten el monitoreo en tiempo real sin dañar la muestra [1]. Estos métodos son particularmente útiles en estructuras de tejido 3D, comunes en la producción de carne cultivada, donde el muestreo periódico corre el riesgo de interrumpir el andamiaje o comprometer el cultivo. Como resultado, estas técnicas apoyan tanto los exámenes rápidos como los procesos de validación más detallados.

Uso Principal (Examen vs. Validación)

Para fines de examen, los ensayos metabólicos de alto rendimiento como MTT y XTT son altamente efectivos. La validación, sin embargo, requiere métodos de prueba adicionales para abordar desafíos como la interferencia del andamiaje [6]. Una combinación de ensayos de luminiscencia de ATP y ADN ha demostrado ser efectiva para medir la viabilidad celular en andamios, superando problemas como la difusión ralentizada de reactivos causada por los materiales del andamiaje. Este trabajo contribuyó al desarrollo del método de prueba estándar ASTM WK62115, que proporciona pautas para evaluar la viabilidad celular en tejidos manufacturados [1].

Tabla de Comparación

Comparison of 5 Long-Term Viability Testing Methods for Cultivated Meat Production

Comparación de 5 Métodos de Prueba de Viabilidad a Largo Plazo para la Producción de Carne Cultivada

La tabla a continuación describe las características principales de cinco métodos utilizados para pruebas de viabilidad a largo plazo, destacando sus tipos de medición, resolución temporal y aplicaciones típicas.

Método Tipo de Medición Resolución Temporal Uso Principal
Ensayos de Viabilidad Integridad de la membrana (exclusión/absorción de colorante) Punto final Verificaciones rutinarias de cultivo; trabajo en banco a pequeña escala
Monitoreo de Actividad Metabólica Actividad enzimática / niveles de ATP Punto final o en tiempo real (cinético hasta 72 horas) Optimización de medios; cribado de alto rendimiento
Protocolos de Pruebas de Estrés Marcadores de citotoxicidad (liberación de LDH, activación de caspasas) En tiempo real / cinético Determinación de IC50 de factores de crecimiento o inhibidores
Estabilidad Cromosómica y Caracterización GenéticaSíntesis de ADN, progresión del ciclo celular Punto final Control de calidad para la estabilidad a largo plazo de la línea celular
Ensayos de rendimiento funcional Actividad biológica (marcadores de proliferación, funciones específicas) Variable (alta con imágenes) Validación de la diferenciación y el rendimiento celular

Esta comparación destaca las ventajas y limitaciones únicas de cada método, particularmente en términos de tipo de medición y tiempo.La resolución temporal juega un papel clave en el seguimiento de cambios a largo plazo, con ensayos no líticos que permiten un monitoreo continuo de hasta 72 horas [2].

En modelos de cultivo 3D - comúnmente utilizados en la producción de carne cultivada - los ensayos colorimétricos tradicionales a menudo enfrentan desafíos con la penetración de reactivos. Se necesitan reactivos especializados diseñados para sistemas 3D, con detergentes más fuertes, para asegurar un rendimiento efectivo del ensayo. Los métodos que rastrean marcadores liberados en el medio, como LDH en pruebas de estrés, son particularmente útiles para alcanzar el núcleo de los microtejidos [2] . Combinar ensayos de viabilidad con pruebas de citotoxicidad proporciona una distinción más clara entre efectos citostáticos (inhibidores del crecimiento) y citotóxicos (destructores de células) [2][6]. Este resumen conciso ayuda a guiar la selección de métodos para adaptarse a una variedad de necesidades de prueba.

Conclusión

Para garantizar resultados precisos y confiables en las pruebas de viabilidad de líneas celulares, es esencial un enfoque multifacético. Las pruebas de viabilidad a largo plazo en la producción de carne cultivada requieren el uso de múltiples ensayos, ya que cada uno evalúa diferentes marcadores celulares. Confiar en un solo parámetro puede llevar a resultados engañosos: una célula podría parecer viable pero podría estar metabólicamente inactiva o incluso senescente [2].

Como explican Johanna Lee y Mariel Mohns de Promega Corporation:

"Elegir un método de ensayo de salud celular que se adapte a sus necesidades requiere comprender qué mide cada ensayo como marcador, cómo la medición se correlaciona con la viabilidad celular y cuáles son las limitaciones." [2]

Esto es especialmente importante cuando se trabaja con andamios 3D, donde la combinación de métodos ortogonales se vuelve crítica [2]. La multiplexación de ensayos dentro de un solo pozo no solo mejora la fiabilidad estadística, sino que también ayuda a conservar tipos de células valiosas [2]. Al utilizar este enfoque, los investigadores pueden diferenciar entre células "vivas", "muertas" y "moribundas o dañadas", asegurando una validación más completa de los resultados experimentales [3]. Además, los compuestos experimentales a veces pueden alterar el metabolismo celular o la proliferación sin causar la muerte celular. Combinar ensayos de viabilidad con pruebas de toxicidad ayuda a evitar la mala interpretación de tales cambios metabólicos [6].

Para las empresas en el sector de la carne cultivada, el desarrollo de protocolos de prueba robustos también depende del acceso a equipos especializados.Herramientas como lectores de microplacas multimodo y contadores de células automatizados mejoran la flexibilidad de los ensayos y minimizan los errores [4][5]. Plataformas como Cellbase simplifican este proceso al conectar a los equipos de I&D y a los gerentes de producción con proveedores verificados. Estos proveedores ofrecen herramientas avanzadas, incluidos lectores de microplacas con controles de temperatura y CO₂ para monitoreo en tiempo real [4] y reactivos diseñados específicamente para sistemas de cultivo 3D. Adoptar estos métodos integrados fortalece la base para un rendimiento escalable y confiable de líneas celulares en la producción de carne cultivada.

Preguntas Frecuentes

¿Con qué frecuencia se debe realizar la prueba de viabilidad a largo plazo durante el pasaje?

La frecuencia de las pruebas de viabilidad a largo plazo durante el pasaje celular varía según el protocolo y la línea celular específica que se esté utilizando.Los ensayos de viabilidad se realizan generalmente en intervalos que se alinean con las condiciones de cultivo; esto podría significar pruebas antes de cada pasaje o en puntos de tiempo predeterminados. Para las líneas celulares de carne cultivada, las pruebas regulares de viabilidad son cruciales para asegurar que las células permanezcan saludables y funcionales durante períodos prolongados de cultivo.

¿Qué ensayos son más efectivos para andamios 3D con difusión limitada de reactivos?

Al trabajar con andamios 3D donde la difusión de reactivos es limitada, el ensayo de fosfatasa ácida (APH) resulta ser una opción confiable. Este ensayo funciona eficazmente con esferoides de hasta 650 µm e incluso 900 µm de tamaño, sin requerir disociación.

Además, los ensayos de viabilidad celular diseñados específicamente para construcciones 3D son altamente compatibles con estas condiciones.Estos ensayos son lo suficientemente sensibles como para tener en cuenta los desafíos de difusión inherentes a los andamios 3D, lo que los hace particularmente adecuados para evaluar la viabilidad celular a largo plazo. Esto los convierte en una herramienta excellxcelente para la investigación en carne cultivada, donde mantener la salud celular a lo largo del tiempo es crucial.

¿Cuál es el conjunto mínimo de pruebas ortogonales para confirmar que una línea celular es segura y estable?

Para confirmar la seguridad y estabilidad de una línea celular, se requieren algunas pruebas esenciales. Estas incluyen evaluaciones de estabilidad genética como el cariotipado, matrices de SNP o secuenciación de próxima generación. Estos métodos ayudan a identificar mutaciones o anomalías cromosómicas que podrían comprometer la línea celular.

Además, las pruebas de contaminación y la autenticación celular juegan un papel crucial. Estas pruebas aseguran la identidad y pureza de la línea celular, reduciendo el riesgo de contaminación cruzada o identificación errónea.Cuando se combinan, estos procedimientos protegen tanto la integridad genética como la seguridad general de las líneas celulares utilizadas en la producción de carne cultivada.

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Author David Bell

About the Author

David Bell is the founder of Cultigen Group (parent of Cellbase) and contributing author on all the latest news. With over 25 years in business, founding & exiting several technology startups, he started Cultigen Group in anticipation of the coming regulatory approvals needed for this industry to blossom.

David has been a vegan since 2012 and so finds the space fascinating and fitting to be involved in... "It's exciting to envisage a future in which anyone can eat meat, whilst maintaining the morals around animal cruelty which first shifted my focus all those years ago"