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AI y Gemelos Digitales en la Automatización de Bioprocesos

AI and Digital Twins in Bioprocess Automation

David Bell |

Escalar la producción de carne cultivada es costoso y requiere mucho tiempo. Pasar de configuraciones de laboratorio pequeñas a biorreactores comerciales a menudo falla debido a resultados biológicos impredecibles. Pero la IA y los gemelos digitales están cambiando esto. Estas herramientas simulan y optimizan procesos virtualmente, reduciendo costos y tiempo de desarrollo hasta en un 50%. Así es como:

  • Los gemelos digitales crean réplicas virtuales de biorreactores, simulando condiciones como la dinámica de fluidos y la distribución de nutrientes. Predicen resultados sin arriesgar el equipo físico.
  • Sensores impulsados por IA permiten el monitoreo y ajustes en tiempo real, mejorando la eficiencia y reduciendo el desperdicio.
  • Empresas como Gourmey han utilizado estas tecnologías para reducir los costos de producción a €7/kg (£6/kg) y disminuir los gastos de alimentación a €0.20/litro (£0.17/litro).

Desde la optimización del crecimiento celular hasta la prevención de fallos en el equipo, la IA y los gemelos digitales están transformando el camino hacia una producción de carne cultivada escalable y rentable. Sigue leyendo para aprender cómo se implementan estas herramientas y su impacto en la industria.

AI and Digital Twins Impact on Cultivated Meat Production Costs and Efficiency

Impacto de la IA y los Gemelos Digitales en los Costos y la Eficiencia de la Producción de Carne Cultivada

Aplicación de IA y Gemelos Digitales para el Bioprocesamiento: Trampas y Caminos de Solución para...

Beneficios de la IA y los Gemelos Digitales para la Producción de Carne Cultivada

La IA y los gemelos digitales están teniendo un gran impacto en la producción de carne cultivada al mejorar el control de procesos, reducir costos y allanar el camino para operaciones comerciales a gran escala.

Mejora en el Control y Monitoreo de Biorreactores

Los gemelos digitales permiten a los productores simular las condiciones del biorreactor, como la geometría, la dinámica de fluidos y los ajustes físicos, haciendo posible ejecutar escenarios de "qué pasaría si". Estas simulaciones ayudan a afinar parámetros críticos como la temperatura, los niveles de pH y el suministro de nutrientes sin la necesidad de ajustes físicos costosos [1] [6] [4].

La IA juega un papel clave a través de la "sensibilización suave", que permite el monitoreo en tiempo real de variables que son difíciles de medir directamente. Los sensores virtuales estiman detalles como los niveles de oxígeno disuelto y la concentración de glucosa en áreas donde los sensores físicos no son suficientes. Los datos de los biorreactores se comparan constantemente con modelos virtuales, ayudando a detectar discrepancias o signos tempranos de problemas en el equipo.Esto permite el mantenimiento predictivo, como lo destaca Octocells:

"Al predecir cuándo es probable que una máquina falle o requiera servicio, el mantenimiento se programará proactivamente, reduciendo el tiempo de inactividad y extendiendo la vida útil del equipo." [1]

Además, la IA causal ayuda a los productores a comprender las interacciones moleculares, prediciendo cómo influirán moléculas específicas en el comportamiento celular [4]. Estas capacidades mejoran la fiabilidad mientras reducen los costos, creando una base sólida para escalar la producción.

Reducción de Costos a Través de la Optimización de Procesos

Un mejor control sobre los biorreactores reduce directamente los costos operativos al minimizar el desperdicio y optimizar el uso de medios de cultivo celular, el mayor gasto en la producción de carne cultivada. Los gemelos digitales permiten pruebas virtuales del comportamiento celular y cambios en el medio, reduciendo significativamente la necesidad de experimentos de laboratorio húmedo costosos.

Un gran ejemplo proviene de Gourmey, una start-up francesa que se asoció con la firma biotecnológica DeepLife en junio de 2025. Juntos, desarrollaron un gemelo digital de células aviares analizando datos de secuenciación de millones de células aviares e integrándolos con datos de perturbación del medio. Nicolas Morin-Forest, CEO de Gourmey, explicó:

"Optimizar estos parámetros aumenta el rendimiento, reduce el desperdicio de alimento, que es un factor de costo principal en la carne cultivada, y reduce directamente los costos de producción." [4]

Jonathan Baptista, CEO de DeepLife, señaló además:

"El modelo se ajusta utilizando datos de Gourmey sobre perturbaciones del medio, lo que le permite predecir cómo diferentes moléculas afectarán el comportamiento de cada población celular." [4]

Más allá de la optimización de medios, los gemelos digitales también ayudan a reducir el gasto de capital. Las empresas pueden crear réplicas virtuales de fábricas para probar diseños, ubicaciones de equipos y flujos de trabajo antes de que comience la construcción, asegurando la máxima eficiencia [1]. Estas simulaciones también proporcionan una forma segura y rentable de capacitar a los operadores, acelerando la preparación y reduciendo los gastos de capacitación.

Escalando a Producción Comercial

Los gemelos digitales juegan un papel crucial en la ampliación de operaciones desde el laboratorio hasta la producción a gran escala. Esta transición a menudo viene con desafíos de ingeniería, particularmente en asegurar el flujo de fluidos y la distribución de nutrientes en grandes biorreactores. Los gemelos digitales, combinados con la dinámica de fluidos computacional (CFD), ayudan a optimizar estos factores [7].

Al simular diseños y procesos, los productores pueden cerrar la brecha entre configuraciones experimentales y la fabricación a gran escala. Como señala FUDZS:

"Al identificar el diseño más eficiente a través de la simulación, los inversores asegurarán que cada dólar o euro gastado en construcción genere el mayor retorno de inversión posible!" [1]

A escala comercial, los gemelos digitales continúan monitoreando el rendimiento del equipo en tiempo real, comparándolo con puntos de referencia virtuales para detectar signos tempranos de desgaste. Este enfoque proactivo minimiza el tiempo de inactividad, asegurando una producción continua para satisfacer la demanda del mercado [1].

Las simulaciones impulsadas por IA también aceleran la investigación y el desarrollo al reducir la dependencia de experimentos tradicionales en laboratorio húmedo. Esto permite a los productores refinar rápidamente líneas celulares, fórmulas de medios y procesos de producción mientras se mantienen dentro del presupuesto y el cronograma.

Cómo Implementar IA y Gemelos Digitales en la Automatización de Bioprocesos

Incorporar IA y gemelos digitales en la producción de carne cultivada requiere una sólida base en gestión de datos, técnicas de modelado híbrido y hardware adecuado. El punto de partida es construir una capa de datos que transmita datos críticos del biorreactor - como pH, oxígeno disuelto, torque, velocidad de agitación y masa de alimentación - a un historiador de planta. Este paso sienta las bases para una implementación efectiva [5] .

La siguiente fase implica crear un modelo híbrido. Este enfoque combina principios mecanicistas, como balances de masa y tasas de transferencia de oxígeno, con algoritmos de aprendizaje automático. Conocido como un modelo de "caja gris", va más allá de los métodos tradicionales basados en la física para predecir mejor comportamientos biológicos complejos.Como dice James Westley, Director Asociado en Cambridge Consultants:

"El enfoque comienza complementando la IA con 'inteligencia real'... combinando la IA con experiencia en el dominio para reducir el número de experimentos, de los miles bajos a las decenas altas" [2].

Al reducir el número de experimentos necesarios, este método puede disminuir significativamente los costos mientras se mantiene la precisión. Una vez que la base está establecida, el enfoque se desplaza hacia el entrenamiento del gemelo digital e integrarlo en el control de procesos en tiempo real.

Entrenamiento de Gemelos Digitales con Datos Experimentales

Para que un gemelo digital funcione eficazmente, necesita datos de calidad de experimentos físicos. Los modelos tradicionales a menudo requieren cientos o incluso miles de puntos de datos.Sin embargo, la modelización híbrida simplifica esto al incorporar relaciones físicas y químicas conocidas, como cómo el aumento de CO₂ afecta el pH, reduciendo la carga de datos [2] .

El uso de Diseño de Experimentos (DoE) guiado por IA con optimización bayesiana agiliza aún más el proceso. Este método prioriza los experimentos más informativos, evitando la ineficiencia del ensayo y error. Por ejemplo, en un estudio, los investigadores entrenaron un modelo híbrido utilizando solo 21 experimentos y lo validaron con 6 pruebas adicionales. El modelo predijo con precisión el crecimiento de biomasa y el consumo de glucosa [8] .

Estas ventajas no son solo teóricas. En junio de 2025, la start-up francesa Gourmey se asoció con la firma biotecnológica DeepLife para desarrollar un gemelo digital para la producción de aves de corral cultivadas.Al analizar datos de secuenciación de millones de células aviares e integrarlos en Modelos de Lenguaje de Gran Escala (LLMs), simularon mecanismos intracelulares. Esto les permitió optimizar formulaciones de alimento virtualmente antes de realizar experimentos físicos. Como explicó Nicolas Morin-Forest, CEO de Gourmey:

"Al combinar la plataforma de cultivo celular patentada de Gourmey y herramientas analíticas avanzadas con la tecnología de gemelo digital líder de DeepLife, ahora podemos simular y optimizar cada etapa de la producción" [4].

Estos métodos no solo reducen costos, sino que también mejoran el control sobre el proceso de producción.

Integración de IA para Ajustes en Tiempo Real

Una vez que un gemelo digital está entrenado, se puede usar para el control de procesos en tiempo real a través de Control Predictivo de Modelos (MPC) o Control de Refuerzo (RC).Estos sistemas ajustan parámetros como el pH, el oxígeno disuelto y las tasas de alimentación basándose en las predicciones del gemelo [5] . Este tipo de control en bucle cerrado se basa en Tecnología Analítica de Procesos (PAT), con sensores avanzados como la espectroscopía Raman o FTIR que miden metabolitos clave aproximadamente cada 60 segundos [5].

Antes de automatizar completamente los procesos, es prudente probar el sistema en "modo sombra". Esto permite que las recomendaciones de IA se comparen con las decisiones del operador sin riesgo, generando confianza en las capacidades del sistema [5]. Por ejemplo, Elise Biopharma utilizó un gemelo digital con MPC en un proceso de alimentación por lotes de 1,000 litros. Esto reveló problemas de transferencia de oxígeno causados por la viscosidad del caldo. Al reequilibrar la agitación y la contrapresión, el sistema resolvió el problema y mejoró el rendimiento [5].

Para garantizar el éxito, el equipo debe admitir la transmisión continua de datos y el flujo de información bidireccional. Los "sensores suaves" impulsados por IA son particularmente valiosos aquí, ya que infieren variables que son difíciles de medir directamente, ofreciendo perspectivas más allá del alcance de los sensores físicos [5].

Uso de Cellbase para la Adquisición de Equipos

Escalar la IA y los gemelos digitales del laboratorio a la producción comercial requiere hardware especializado que los proveedores generales de laboratorio podrían no proporcionar. El equipo esencial incluye biorreactores con conectividad de datos integrada, sensores avanzados en línea como sondas Raman y FTIR, espectrómetros de masas de gases de escape y biorreactores paralelos de múltiples pozos con microfluidos. Además, los medios de cultivo deben ser cuidadosamente monitoreados, ya que las variaciones en la composición pueden impactar significativamente las respuestas biológicas [2][5].

Cellbase simplifica este proceso al servir como un mercado centralizado adaptado a la industria de la carne cultivada. En lugar de navegar por múltiples proveedores, los equipos pueden obtener biorreactores verificados, medios de crecimiento y sensores avanzados desde una sola plataforma. Los listados incluyen especificaciones detalladas, como la compatibilidad con andamios o el cumplimiento de GMP, ayudando a los equipos de producción a minimizar los riesgos técnicos.

Para las empresas que escalan procesos de carne cultivada desde la investigación hasta la producción comercial, Cellbase las conecta con proveedores que entienden los desafíos únicos de la carne cultivada. Esto incluye equipos diseñados para modelos de "reducción de escala", como cápsulas de descubrimiento de 2 litros, que replican la física de sistemas más grandes de hasta 3,000 litros. Estas herramientas ayudan a prevenir la deriva del modelo durante la escalada y aseguran un proceso de transferencia de tecnología más fluido.

Estudio de Caso: Gemelos Digitales e IA en la Producción de Carne Cultivada

DeepLife-Gourmey Gemelo Digital Avícola

DeepLife

Este estudio de caso profundiza en cómo la tecnología de gemelos digitales y la IA están transformando la industria de la carne cultivada, centrándose en una colaboración entre la empresa francesa de carne cultivada Gourmey y la firma biotecnológica DeepLife.

En junio de 2025, Gourmey y DeepLife presentaron el primer gemelo digital avícola: un modelo virtual de células avícolas destinado a optimizar las condiciones de crecimiento. El proyecto se concentró en células madre embrionarias de pato, recopilando datos multi-ómicos durante siete días. Estos datos fueron analizados utilizando Modelos de Lenguaje de Gran Escala, que identificaron mecanismos intracelulares y predijeron cómo diversas moléculas influyen en el comportamiento celular [4] [9].

El gemelo digital utiliza IA causal para mapear las relaciones de causa y efecto dentro de las células. Un marco de Metabolito-Acción-Objetivo (TAM) vincula los resultados celulares, como la mejora de la viabilidad celular o la síntesis de grasa mejorada, a metabolitos específicos y parámetros de proceso [9]. Esto permite miles de experimentos virtuales, reduciendo los costosos y prolongados ensayos de laboratorio húmedo. Los conocimientos obtenidos han llevado a avances medibles en la producción.

Un descubrimiento destacado fue el papel del ácido oleoil-lisofosfatídico (LPA). La IA sugirió que el LPA podría activar el gen regulador de energía SIRT6, mejorando la viabilidad celular y equilibrando los niveles de lípidos. Esto permitió la optimización de medios sin necesidad de modificaciones genéticas [9]. Nicolas Morin-Forest, CEO de Gourmey, destacó el impacto de esta tecnología:

"Integrar la tecnología de gemelos digitales de DeepLife en nuestra plataforma nos permite modelar cómo las células aviares responden a diferentes condiciones de cultivo antes de entrar al laboratorio. Esto acelera nuestros ciclos de I&D, reduce la dependencia de costosos ensayos y errores, y en última instancia agudiza nuestra capacidad para optimizar la economía de producción a escala" [10].

Los resultados son impresionantes. Gourmey ha logrado un costo de producción de €7/kg (alrededor de £6/kg) a una escala comercial de 5,000 litros - la cifra más baja registrada en una evaluación tecnoeconómica independiente hasta ahora [10]. Además, la empresa redujo el precio de su alimento seguro para el consumo a aproximadamente €0.20 por litro (alrededor de £0.17 por litro) [10]. Con más de €65 millones en financiación, el equipo de 60 personas de Gourmey en París continúa refinando el gemelo digital, utilizándolo para mejorar aspectos sensoriales como la intensidad del umami y la estructura de la grasa. Esta colaboración demuestra cómo la IA y los gemelos digitales pueden ofrecer avances escalables e impactantes en la producción de carne cultivada [10].

Desafíos de Adopción y Requisitos de Datos

Crear un gemelo digital para la producción de carne cultivada no es una tarea fácil. Desarrollar un modelo de IA de propósito general para el bioprocesamiento requiere conjuntos de datos extensos: cientos a miles de puntos de datos. Este proceso no solo consume tiempo; también puede costar millones y llevar años completarse [2]. El desafío radica en la biología misma, donde al menos diez variables de proceso interactúan de maneras altamente complejas y no lineales [2].

La infraestructura necesaria para apoyar este esfuerzo es igualmente exigente. Las empresas requieren automatización de laboratorio de alto rendimiento para la preparación de medios, biorreactores equipados con sensores de monitoreo en tiempo real (que rastrean pH, temperatura, oxígeno disuelto y nutrientes), y sistemas de computación de alto rendimiento para manejar simulaciones de IA [11] . Además, el costo de los materiales sigue siendo un obstáculo: el suero bovino fetal, por ejemplo, tiene un precio de £70 por 50 ml , mientras que los microportadores para un tanque de biorreactor de 2,000 litros cuestan alrededor de £13,000 [11] . Otro obstáculo significativo es la falta de conjuntos de datos específicos de aves, lo que limita la capacidad de los modelos de IA para generalizar entre diferentes especies avícolas [12].

Para superar estos obstáculos, las empresas están adoptando modelos híbridos - un método que combina la IA con la experiencia en el dominio y la física de primeros principios. Al integrar relaciones conocidas, como la correlación inversa entre los niveles de CO₂ y el pH, estos modelos pueden reducir significativamente el número de experimentos físicos necesarios [2][13] . Abordar estos desafíos es crucial para aprovechar al máximo la automatización impulsada por IA en el sector de la carne cultivada. A pesar de las dificultades, las tendencias emergentes están allanando el camino para cambios transformadores en la automatización de bioprocesos.

La industria está respondiendo a estos desafíos con innovaciones de vanguardia. Se prevé que el mercado global de IA en carne cultivada crezca de £70 millones en 2025 a un impresionante £2,500 millones para 2035, con una tasa de crecimiento anual del 42.7% [11]. Varios tendencias clave están impulsando esta expansión. Por ejemplo, la bioimpresión 3D integrada con IA está optimizando las formulaciones de materiales y los parámetros de impresión para crear estructuras de andamiaje que replican la textura de la carne natural [11]. De manera similar, los sistemas de mantenimiento predictivo se están implementando para monitorear las condiciones de los biorreactores, ayudando a anticipar y prevenir problemas como fallos de lote o contaminación [11][12] .

En enero de 2025, China dio un paso audaz al lanzar la 'Base de Innovación en Ciencia y Tecnología de Nuevos Alimentos Proteicos' en Beijing, respaldada por una inversión de £9 millones. Esta instalación integra tecnologías de IA y blockchain para permitir el monitoreo y la trazabilidad en tiempo real a lo largo del proceso de producción de carne cultivada, desde la investigación hasta el comercio minorista [11]. Casi al mismo tiempo, la start-up israelí Aleph Farms aseguró £24 millones en financiamiento para mejorar su instalación piloto impulsada por IA y trabajar hacia la comercialización de filetes cultivados enteros rentables [11].

Mirando hacia el futuro, se espera que los gemelos digitales evolucionen más allá de solo mejorar el rendimiento. Apuntan a mejorar los atributos sensoriales - modelando compuestos volátiles, proteínas y lípidos para refinar el sabor y la textura de la carne cultivada [3]. El auge de centros de IA de código abierto, como el AI4CM Hub, también está fomentando la colaboración y la innovación en este campo [11]. A medida que estas tecnologías avanzan, las empresas que invierten en sensores automáticos en línea, biorreactores paralelos miniaturizados y modelos híbridos de IA estarán mejor equipadas para escalar la producción de manera eficiente mientras navegan por los paisajes regulatorios. Lograr una cultivación escalable y rentable será clave para el éxito comercial en esta industria en rápido avance.

Conclusión

La IA y los gemelos digitales están transformando la automatización de bioprocesos en la producción de carne cultivada.Al refinar las formulaciones de alimentos, acelerar la investigación con simulaciones virtuales y mejorar la predictibilidad durante la ampliación, estas tecnologías reducen significativamente los costos y hacen que la industria sea más atractiva para los inversores [2][4]. Como señala James Westley, Director Asociado en Cambridge Consultants, estas herramientas mejoran la escalabilidad, lo cual es crítico para atraer inversiones. Este cambio digital está impulsando un proceso de producción más eficiente y basado en datos.

El movimiento hacia la Industria 4.0, marcado por sistemas autónomos, se está convirtiendo en una necesidad para las empresas que buscan prosperar en este espacio [13]. El modelado híbrido, que combina la física mecanicista con el aprendizaje automático, está haciendo que los gemelos digitales predictivos sean más accesibles, incluso para las empresas más pequeñas [2]. El monitoreo en tiempo real mejora aún más la eficiencia al permitir ajustes rápidos y reducir la probabilidad de fallos en los lotes [2].

La clave de esta transformación es la adopción de herramientas avanzadas como sensores en línea automatizados, biorreactores paralelos miniaturizados, computación de alto rendimiento y herramientas PAT. Las plataformas como Cellbase juegan un papel fundamental aquí. Como el primer mercado B2B dedicado al sector de la carne cultivada, Cellbase conecta a investigadores y fabricantes con proveedores de confianza que ofrecen los sensores especializados, biorreactores y herramientas analíticas necesarias para la automatización de bioprocesos impulsada por IA.

El futuro de la producción de carne cultivada es indudablemente digital. Las empresas que adopten la IA y aprovechen plataformas como Cellbase pueden pasar de la producción a escala de laboratorio a la producción comercial más rápidamente y con un menor riesgo financiero.

Preguntas Frecuentes

¿Qué datos necesito para construir un gemelo digital útil para carne cultivada?

Para construir un gemelo digital confiable para la producción de carne cultivada, es crucial recopilar datos precisos tanto de parámetros biológicos como de proceso. Los factores clave a monitorear incluyen mediciones en tiempo real de pH, temperatura, oxígeno disuelto, niveles de glucosa y crecimiento celular. Junto a esto, la información sobre condiciones del biorreactor, dinámica de fluidos y transferencia de masa juega un papel vital. La recolección de datos precisa y de alta frecuencia asegura que el gemelo digital refleje de cerca el entorno del biorreactor, permitiendo que la IA optimice los procesos de manera efectiva.

¿Cómo reducen los modelos híbridos (caja gris) el número de experimentos en laboratorio húmedo?

Los modelos híbridos, o de caja gris, combinan modelos mecanicistas con aprendizaje automático para crear simulaciones virtuales precisas de procesos.Estos modelos permiten realizar pruebas de escenarios de manera efectiva y reducen la necesidad de experimentos físicos extensos. Al confiar en predicciones computacionales, ayudan a ahorrar tanto tiempo como recursos mientras ofrecen valiosos conocimientos.

¿Qué sensores y equipos son esenciales para el control de IA en tiempo real en biorreactores?

Para mantener condiciones óptimas en biorreactores, varios sensores juegan un papel crítico en el monitoreo y control en tiempo real. Estos incluyen:

  • Sensores de temperatura (RTDs): Esenciales para mantener el biorreactor a la temperatura precisa requerida para el crecimiento celular.
  • Sensores de pH: Disponibles en tipos de vidrio o ISFET, aseguran que los niveles de acidez o alcalinidad sean los adecuados para el proceso.
  • Sensores de oxígeno disuelto (ópticos): Cruciales para rastrear los niveles de oxígeno, que impactan directamente en el metabolismo celular.
  • Sensores de metabolitos: Utilizados para monitorear compuestos clave como la glucosa y el ácido láctico, ayudando a mantener el equilibrio necesario para una producción eficiente.

Estos sensores trabajan juntos para proporcionar los datos detallados necesarios para que los sistemas de IA ajusten las condiciones del bioproceso, asegurando el éxito de la producción de carne cultivada.

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Author David Bell

About the Author

David Bell is the founder of Cultigen Group (parent of Cellbase) and contributing author on all the latest news. With over 25 years in business, founding & exiting several technology startups, he started Cultigen Group in anticipation of the coming regulatory approvals needed for this industry to blossom.

David has been a vegan since 2012 and so finds the space fascinating and fitting to be involved in... "It's exciting to envisage a future in which anyone can eat meat, whilst maintaining the morals around animal cruelty which first shifted my focus all those years ago"