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Sélection de bioréacteur pour le transfert de R&D à la fabrication

Bioreactor Selection for R&D to Manufacturing Transfer

David Bell |

La production de viande cultivée à grande échelle nécessite le choix du bon bioréacteur pour équilibrer la viabilité cellulaire, l'efficacité des coûts, et le contrôle du processus. Chaque type de bioréacteur - à cuve agitée, à circulation d'air, à lit fixe et à perfusion - offre des avantages et des défis distincts selon le type de cellule et les objectifs de production.

  • Bioréacteurs à cuve agitée (STRs): Fiables pour les cellules en suspension et basées sur des microporteurs, avec des systèmes de contrôle et une évolutivité éprouvés. Cependant, ils peuvent causer un stress de cisaillement sur les cellules sensibles.
  • Bioréacteurs à circulation d'air (ALBs): Douceur pour les cellules sensibles au cisaillement et rentables, mais nécessitent une modélisation hydrodynamique précise pour l'évolutivité.
  • Bioréacteurs à lit fixe: Idéaux pour les cellules adhérentes utilisant des échafaudages mais rencontrent des défis en matière d'évolutivité et de récolte.
  • Bioreacteurs de Perfusion: Atteignez des densités cellulaires élevées avec un échange continu de milieu, mais impliquent des systèmes complexes et des coûts opérationnels plus élevés.

Point clé: Le choix du bon bioréacteur dépend de votre type de cellule spécifique, de vos besoins en montée en échelle et de vos objectifs de coût. Les STR sont polyvalents et largement utilisés, tandis que les systèmes ALB et de perfusion excellent dans la protection des cellules délicates et le soutien des cultures à haute densité. Les systèmes à lit fixe conviennent mieux aux produits structurés comme les morceaux entiers.

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Comparaison rapide:

Type de bioréacteur Évolutivité Compatibilité cellulaire Efficacité des coûts Défis
Cuve agitée (STR) Élevée Suspension, microporteur Modérée Stress de cisaillement sur les cellules
Airlift (ALB) Moyenne à élevée Cellules sensibles au cisaillement Élevée Échelle complexe
Lit fixe Basse à moyenne Cellules adhérentes sur échafaudages Basse Échelle et récolte
Perfusion Moyenne Cellules en suspension à haute densité Variable Opération complexe

Choisir la bonne option garantit une transition plus fluide de la recherche à la fabrication tout en atteignant les objectifs de production et économiques.

Bioreactor Types Comparison for Cultivated Meat Production

Comparaison des types de bioréacteurs pour la production de viande cultivée

Dr. Marianne Ellis : Conception de bioréacteurs et de bioprocédés à grande échelle pour la viande cultivée

1. Bioréacteurs à cuve agitée

Les bioréacteurs à cuve agitée (STR) sont le pilier du biotraitement industriel depuis plus d'un demi-siècle, soutenant environ 90 % de la production d'anticorps monoclonaux. Cette fiabilité de longue date en fait un choix naturel pour les entreprises de viande cultivée cherchant à augmenter la production. Ces cuves cylindriques, équipées d'agitateurs, assurent un mélange uniforme du milieu, ce qui aide à distribuer uniformément les nutriments et l'oxygène dans toute la cuve [2].

Évolutivité

L'une des caractéristiques remarquables des STRs est leur capacité à évoluer sans heurts, des petits volumes de R&D de 2 à 5 litres à des capacités de fabrication dépassant 2 000 litres [2][3]. Les recherches montrent que le maintien de taux de transfert d'oxygène constants et d'entrées de puissance par volume (typiquement 1–5 kW/m³) est essentiel pour assurer une viabilité cellulaire et une productivité élevées lors de la montée en échelle [2]. Cependant, y parvenir nécessite une attention particulière aux conditions de mélange, notamment pour protéger les cellules sensibles, comme discuté ci-dessous.

Compatibilité Cellulaire

Les cellules de viande cultivée sont particulièrement vulnérables aux dommages causés par les forces de cisaillement des turbines [5]. Pour y remédier, des conceptions de turbines à faible cisaillement, telles que les turbines marines ou hydrofoil, sont souvent utilisées.Ces conceptions trouvent un équilibre entre la protection des cellules délicates et le maintien d'un mélange efficace. Des options plus avancées, comme les hélices à pales inclinées segmentées, peuvent améliorer le transfert de masse jusqu'à 40 % tout en minimisant le cisaillement, créant un environnement propice à la prolifération des cellules souches. Les STR fonctionnant en modes de perfusion peuvent atteindre des densités cellulaires dépassant 100 millions de cellules/mL - comparables aux systèmes de perfusion spécialisés mais avec des processus de stérilisation en place (SIP) et de nettoyage en place (CIP) plus simples. Valider la compatibilité cellulaire à chaque étape, en commençant par des récipients en verre de 1 à 5 litres avant de passer à des systèmes en acier inoxydable, est une pratique courante pour garantir le succès.

Facilité de transfert de la R&D à la fabrication

Les STR excellent également dans le comblement du fossé entre la R&D et la fabrication. Leurs méthodologies éprouvées et leurs données étendues rendent la transition plus prévisible [3]. Contrairement aux systèmes alternatifs comme les bioréacteurs à lit fluidisé ou à lit fixe, les STR permettent l'échantillonnage en temps réel et l'intégration de capteurs avancés, qui sont essentiels pour la technologie analytique de procédé (PAT) et l'optimisation de la R&D. Les configurations modernes de STR incluent généralement des capteurs pour surveiller l'oxygène dissous, le pH, la température, les niveaux de nutriments et la densité cellulaire [2]. La modélisation par dynamique des fluides computationnelle (CFD) simplifie davantage le processus en prédisant les dynamiques de cisaillement et de mélange à plus grande échelle, réduisant potentiellement de moitié les itérations expérimentales.

L'adoption des STR à usage unique a fortement augmenté ces dernières années, avec une croissance de 25 % par an depuis 2020. Ces systèmes réduisent les risques de contamination et simplifient les transitions entre le développement et la production, ce qui en fait un choix de plus en plus populaire.Pour les entreprises de viande cultivée, cette combinaison de prévisibilité, de flexibilité et de facilité d'intégration souligne pourquoi les STR restent une pierre angulaire pour passer de la R&D à la fabrication à grande échelle.

Pour ceux qui recherchent des systèmes STR fiables, la place de marché B2B Cellbase offre une sélection soignée de fournisseurs vérifiés, des prix transparents et des informations sectorielles adaptées pour soutenir une transition efficace de la recherche à la production.

2. Bioréacteurs à circulation d'air

Les bioréacteurs à circulation d'air (ALBs) se distinguent comme une alternative plus douce aux bioréacteurs traditionnels à cuve agitée, en faisant une option excellente pour la production de viande cultivée. Au lieu de s'appuyer sur des agitateurs mécaniques pour le mélange, les ALBs utilisent une agitation pneumatique pour faire circuler le milieu.Cette approche crée un environnement plus uniforme tout en réduisant considérablement le stress de cisaillement, ce qui est crucial pour protéger les cellules délicates utilisées dans la production de viande cultivée [1]. Sans pièces mobiles comme des joints ou des moteurs, les ALB simplifient la conception mécanique et offrent un environnement plus sûr pour les cellules sensibles [8].

Évolutivité

L'une des forces des ALB est leur capacité à évoluer efficacement, grâce à leurs capacités de transfert d'oxygène et de mélange efficaces, qui sont essentielles pour les cultures cellulaires à haute densité. Cela les rend bien adaptés à la transition de la production de viande cultivée de la recherche en laboratoire à la fabrication industrielle [1]. Cependant, l'augmentation de l'échelle n'est pas sans défis. La livraison d'oxygène et l'élimination du dioxyde de carbone doivent s'aligner précisément avec les besoins métaboliques des cellules à des volumes plus importants [7]. Matt McNulty, chercheur associé au GFI, souligne le potentiel des réacteurs à levage pneumatique, en déclarant:

Les premières évaluations computationnelles des géométries alternatives de bioréacteurs pour la viande cultivée suggèrent qu'il pourrait être intéressant de poursuivre les recherches (e.g. , réacteur à levage pneumatique) [9].

À plus grande échelle, les changements dans le transfert de masse gaz-liquide et l'émergence de gradients localisés peuvent compliquer le processus. Cela signifie que simplement reproduire la conception matérielle ne garantit pas que les résultats biologiques resteront cohérents [7]. Les ALB, cependant, offrent un cadre prometteur pour créer un environnement favorable aux cellules à grande échelle.

Compatibilité Cellulaire

La circulation entraînée par le gaz dans les ALB résulte en un environnement plus doux, les rendant particulièrement adaptés aux types de cellules qui sont très sensibles au stress de cisaillement [8]. Pour la production de viande cultivée, maintenir le stress de cisaillement en dessous des niveaux nocifs est crucial, nécessitant souvent l'ajout d'agents protecteurs de cisaillement comme l'alcool polyvinylique (PVA) ou les poloxamères [7]. Lors de la montée en échelle, il devient essentiel d'évaluer les capacités de transfert d'oxygène par rapport au taux maximal de consommation d'oxygène (OUR) de la culture, plutôt que de se fier uniquement au coefficient de transfert de masse volumétrique d'oxygène (kLa) [7]. Il est tout aussi important de surveiller l'efficacité de l'élimination du dioxyde de carbone, car une accumulation excessive de CO₂ peut entraver la croissance cellulaire à plus grande échelle [7].

Considérations de Coût

Le biotraitement en amont est un facteur de coût majeur dans la production de viande cultivée, avec des conceptions traditionnelles entraînant souvent des inefficacités [9]. Les ALB offrent une solution potentielle en réduisant à la fois les coûts d'investissement (CAPEX) et les coûts d'exploitation (OPEX).Cela est réalisé en réduisant les besoins en matériaux, comme l'utilisation de moins d'acier inoxydable et de moins de capteurs par unité [9]. L'adoption croissante des systèmes à usage unique simplifie davantage les opérations en simplifiant les processus de nettoyage et de stérilisation, bien que des préoccupations concernant les déchets plastiques subsistent [1]. Ces avantages en termes de coûts rendent les ALB un choix attrayant pour augmenter la production.

Facilité de transfert de la R&D à la fabrication

Les ALB sont équipés de systèmes avancés d'instrumentation et de contrôle, ce qui aide à relever les défis technologiques du biotraitement à grande échelle. Cela facilite la transition de la recherche et du développement à la fabrication à grande échelle [1]. Pour les cellules dépendantes de l'ancrage utilisées dans la viande cultivée, l'inclusion de microporteurs ou de structures facilite l'adhésion et la croissance des cellules [1]. D'ici la fin de 2024, les bioréacteurs à colonne à bulles et à levage pneumatique ont rejoint les réacteurs à cuve agitée parmi les systèmes les plus couramment utilisés dans la production de viande cultivée [1].

Pour ceux qui naviguent dans la transition de la R&D à la fabrication industrielle, des plateformes comme Cellbase offrent des listes sélectionnées de systèmes de bioréacteurs spécifiquement conçus pour répondre aux besoins uniques de la production de viande cultivée.

3. Bioréacteurs à lit fixe

Les bioréacteurs à lit fixe sont spécifiquement conçus pour soutenir la production de viande cultivée, en particulier pour les produits structurés comme les tissus entiers, par opposition aux options non structurées comme la viande hachée. Leur conception repose sur des échafaudages qui facilitent l'attachement des cellules, leur croissance et leur différenciation en tissu prêt à être consommé [12][13]. Cette concentration sur les échafaudages joue un rôle crucial dans la détermination à la fois de l'évolutivité et de la compatibilité de ces réacteurs dans la production à grande échelle.

Évolutivité

Faire passer les bioréacteurs à lit fixe des configurations de R&D à petite échelle à une production commerciale à grande échelle n'est pas une mince affaire. L'industrie travaille maintenant avec des bioréacteurs pouvant contenir jusqu'à 50 000 litres, la plupart des installations commerciales opérant dans la gamme de 10 000 à 50 000 litres [11][12]. À ces échelles, des échafaudages 3D spécialisés doivent fonctionner de manière cohérente et efficace, même à des volumes massifs [11]. Contrairement aux opérations à court terme typiques en R&D, la production commerciale exige que ces systèmes fonctionnent sans interruption pendant des mois.David Bell, fondateur de Cultigen Group, souligne ce défi:

Les fournisseurs qui comprennent que votre bioréacteur doit fonctionner en continu pendant des mois, pas des jours [11].

Compatibilité cellulaire

L'une des forces des bioréacteurs à lit fixe est leur capacité à soutenir les cellules dépendantes de l'ancrage. Ces réacteurs fonctionnent en mode perfusion, assurant un approvisionnement constant en nutriments tout en éliminant les déchets. Cette configuration favorise à la fois une densité cellulaire élevée et une différenciation efficace, s'alignant avec le concept d'"intensification de processus" [9][10]. Essentiellement, le réacteur sert à la fois de plateforme pour la culture et la différenciation, optimisant l'ensemble du processus [9].

Facilité de transfert de la R&D à la fabrication

Passer de la R&D à la fabrication à grande échelle introduit un nouvel ensemble d'exigences pour les bioréacteurs à lit fixe. Ils doivent passer des normes de qualité pharmaceutique à des systèmes de qualité alimentaire pour répondre aux besoins spécifiques de la production de viande cultivée [11]. Contrairement au développement de médicaments, la production de viande cultivée implique des exigences réglementaires et opérationnelles différentes. L'Union européenne, par exemple, devrait contribuer à hauteur de 68 milliards de livres sterling au secteur de la viande cultivée d'ici 2050, soulignant la nécessité de systèmes capables de fonctionner en continu sur le long terme [11]. Des plateformes comme Cellbase aident à combler cet écart en connectant les entreprises avec des fournisseurs de scaffolds et de bioréacteurs de qualité alimentaire validés.

4.Bioreacteurs de Perfusion

Les bioreacteurs de perfusion diffèrent des systèmes batch traditionnels en introduisant continuellement un milieu frais tout en éliminant simultanément le milieu usé. Cette méthode permet la culture de densités cellulaires élevées sur de longues périodes. Une telle opération continue est particulièrement cruciale pour la production de viande cultivée, où atteindre des densités cellulaires de plus de 100 millions de cellules par millilitre est nécessaire pour la viabilité économique [2] [3].

Évolutivité

Les systèmes de perfusion offrent un avantage clair lors du passage de la recherche à l'échelle de fabrication. En maintenant une similarité géométrique, le passage de 5 litres à 500 litres est réalisable, avec des rendements allant de 1 à 5 grammes par litre par jour et moins de 20% de variance de rendement dans les cultures de cellules musculaires [2][3][5]. Par exemple, Upside Foods a réussi à faire évoluer leur processus de perfusion de 1,5 litre en R&D à 120 litres en utilisant la perfusion par flux tangentiel alterné (ATF). Cet ajustement a quadruplé les rendements à 12 grammes par litre par jour pour les cellules de poulet [3][6]. De même, Mosa Meat a rapporté avoir atteint des densités cellulaires de 300 millions de cellules par millilitre dans leurs systèmes pilotes de 500 litres [3][6]. Cette évolutivité fiable assure un environnement contrôlé, ce qui est crucial pour maintenir la compatibilité cellulaire.

Compatibilité Cellulaire

Une fois l'évolutivité établie, maintenir la viabilité cellulaire devient une priorité. Les bioréacteurs à perfusion sont particulièrement efficaces pour les cellules indépendantes de l'ancrage - couramment utilisées dans la production de viande cultivée - telles que les lignées cellulaires bovines immortalisées et les myoblastes.Ces systèmes peuvent supporter des densités cellulaires dépassant 100 millions de cellules par millilitre en utilisant des microporteurs [4] [14]. L'apport continu de nutriments et l'élimination des déchets réduisent le stress cellulaire. Par exemple, la perfusion ATF a montré qu'elle réduit les taux d'apoptose de 50 % par rapport aux cultures en suspension [4][14]. Cependant, les cellules sensibles au cisaillement, comme les myocytes primaires, nécessitent une manipulation soigneuse, y compris l'utilisation de conceptions d'hélices à faible cisaillement, pour préserver leur viabilité.

Facilité de transfert de la R&D à la fabrication

Les bioréacteurs à perfusion non seulement soutiennent des densités cellulaires élevées mais simplifient également la transition de la R&D à la fabrication.L'augmentation d'échelle est simple, car les paramètres de processus tels que les débits et les dispositifs de rétention cellulaire s'échelonnent de manière prévisible en utilisant des nombres sans dimension comme l'indice de taux de perfusion [2][5]. Un défi majeur réside dans la validation des dispositifs de rétention cellulaire - par exemple, atteindre 99,9 % de rétention dans les modules à fibres creuses - et garantir la conformité aux normes réglementaires pour les BPF [2][5]. Les experts de l'Institut Good Food recommandent d'incorporer la technologie analytique de processus (PAT), comme les capteurs de biomasse en ligne, pour maintenir une cohérence des paramètres de plus de 95 % lors de l'augmentation d'échelle [5][15]. Des plateformes comme Cellbase simplifient davantage le processus en connectant les équipes d'approvisionnement avec les fournisseurs de systèmes de perfusion compatibles avec la PAT, simplifiant ainsi la validation et le transfert de fabrication.

Avantages et Inconvénients

Lors de l'extension de la production de viande cultivée de la recherche à la fabrication, chaque type de bioréacteur présente ses propres forces et défis. Les bioréacteurs à cuve agitée sont largement considérés comme la norme de l'industrie pour une mise à l'échelle rapide, grâce à leurs systèmes de contrôle fiables. Cependant, leur agitation mécanique entraîne une consommation d'énergie plus élevée à mesure que les volumes augmentent [1]. Le tableau suivant fournit une comparaison claire des principaux types de bioréacteurs.

Les bioréacteurs à circulation d'air, en revanche, offrent des avantages économiques grâce à l'agitation pneumatique, qui élimine les pièces mobiles et réduit la consommation d'énergie. Ils sont particulièrement adaptés aux cellules de viande cultivée sensibles au cisaillement. Le compromis ? La mise à l'échelle de ces systèmes nécessite une modélisation hydrodynamique précise, ajoutant une couche de complexité [1].

Les bioréacteurs à lit fixe sont particulièrement efficaces pour les cellules adhérentes qui se développent sur des échafaudages. Cependant, ils rencontrent des obstacles significatifs lorsqu'il s'agit d'augmenter la production [1].

Voici une répartition de la performance de ces systèmes selon des paramètres clés :

Type de Bioréacteur Évolutivité Compatibilité Cellulaire Rentabilité Difficulté de Transfert
Cuve Agitée (STR) Élevée; largement utilisée pour la production à grande échelle Adaptée aux cellules en suspension et aux cellules adhérentes sur microporteurs Modérée; les besoins énergétiques augmentent avec l'échelle Faible : Bien documentée et facile à contrôler
Airlift Moyenne à Élevée Idéal pour les cellules sensibles au cisaillement grâce à l'agitation pneumatique Élevée; économe en énergie sans pièces mobiles Modérée : Nécessite une modélisation hydrodynamique avancée
Lit FixeFaible à Moyen Idéal pour les cellules adhérentes sur échafaudages Faible; difficile à échelonner et à récolter Élevé : Défis dans les processus d'échelonnement et de récolte
Perfusion Moyen (haute densité réalisable dans des volumes plus petits) Soutient les cultures en suspension à haute densité Variable; les rendements sont élevés, mais les coûts des médias et d'exploitation peuvent être significatifs Élevé : Systèmes complexes de rétention cellulaire requis

Une autre tendance notable est l'adoption de la technologie à usage unique, qui simplifie les processus de fabrication.Ces systèmes minimisent le besoin de validation extensive et réduisent les coûts en capital associés à l'infrastructure de nettoyage [1].

Conclusion

Les bioréacteurs à cuve agitée sont un choix solide pour les cellules en suspension ou les systèmes à microporteurs, grâce à leurs capacités d'augmentation d'échelle bien établies et à leurs systèmes de contrôle fiables [1].

Pour les cellules adhérentes, les systèmes à cuve agitée modifiés équipés de microporteurs ou de réacteurs à lit fixe fournissent l'environnement adéquat pour une attache et une croissance efficaces [1].

Lorsqu'on travaille avec des cellules sensibles au cisaillement, les bioréacteurs à circulation d'air se démarquent. Ils utilisent une agitation pneumatique pour réduire le stress mécanique tout en assurant un transfert d'oxygène efficace, ce qui les rend plus adaptés à ces types de cellules délicates [1]. Cette gamme de conceptions de réacteurs met en évidence les exigences diverses des différents types de cellules et des objectifs de production.

Les bioréacteurs à perfusion sont conçus pour atteindre des densités cellulaires élevées dans des volumes plus petits grâce à un échange continu de milieu. Cela dit, ils présentent une complexité accrue, nécessitant des systèmes avancés de rétention cellulaire et une opération méticuleuse [1].

Les bioréacteurs à usage unique, en revanche, éliminent le besoin de nettoyage et de stérilisation laborieux, accélérant les processus et simplifiant les flux de travail [1]. Chaque type de bioréacteur joue un rôle essentiel dans la création d'une transition fluide de la recherche à la fabrication.

FAQs

Comment choisir un bioréacteur pour mon type spécifique de cellules de viande cultivée?

Lors de la sélection d'un bioréacteur pour votre production de viande cultivée, il est essentiel d'aligner sa conception avec les besoins spécifiques de votre type de cellules. Par exemple, les bioréacteurs à cuve agitée fonctionnent bien pour les cellules musculaires bovines car ils offrent des forces de cisaillement contrôlées et sont adaptés à l'augmentation de la production.

Pour garantir la viabilité cellulaire, il est crucial de comprendre à quel point vos cellules sont sensibles au stress de cisaillement. Des outils comme la dynamique des fluides computationnelle (CFD) peuvent être inestimables dans ce processus, vous aidant à prédire et à gérer les effets de l'augmentation de l'échelle. Concentrez-vous sur l'adéquation des caractéristiques de conception du bioréacteur - telles que sa méthode de mélange, ses mécanismes de protection contre le cisaillement et sa capacité à maintenir des conditions environnementales optimales - aux exigences de vos objectifs de production.

Que dois-je mesurer lors de l'augmentation de l'échelle pour maintenir la viabilité et la productivité des cellules?

Pour maintenir une viabilité et une productivité cellulaires optimales lors de l'augmentation de l'échelle, il est essentiel de surveiller de près plusieurs paramètres clés.Ces éléments incluent la stérilité, car toute contamination peut faire dérailler l'ensemble du processus, et les conditions environnementales comme la température, le pH et les niveaux d'oxygène, qui affectent directement la croissance cellulaire.

De plus, gérer le stress de cisaillement est crucial pour éviter les dommages cellulaires, tout en assurant une distribution efficace des nutriments et une élimination des déchets qui maintiennent les cellules en bonne santé et prospères. Enfin, l'efficacité du mélange joue un rôle significatif dans le maintien de conditions uniformes dans tout le système. Ensemble, ces facteurs sont essentiels pour obtenir des résultats cohérents dans la production de viande cultivée.

Quand l'utilisation unique est-elle préférable à l'acier inoxydable pour le transfert de fabrication?

Les bioréacteurs à usage unique fonctionnent bien pour les opérations à plus petite échelle, les premières étapes de développement, ou les situations où la flexibilité et le délai d'exécution rapide sont les plus importants.Ils offrent des avantages tels que des coûts initiaux plus bas, des temps de configuration plus rapides et aucun besoin de nettoyage intensif, ce qui en fait un choix pratique pour les projets pilotes ou les séries de production limitées.

D'un autre côté, les systèmes en acier inoxydable brillent dans la fabrication à grande échelle. Avec des capacités dépassant 20 000 litres, ils offrent une plus grande durabilité et des coûts réduits au fil du temps. Cependant, ils nécessitent un investissement initial plus élevé et peuvent être plus complexes à entretenir.

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Author David Bell

About the Author

David Bell is the founder of Cultigen Group (parent of Cellbase) and contributing author on all the latest news. With over 25 years in business, founding & exiting several technology startups, he started Cultigen Group in anticipation of the coming regulatory approvals needed for this industry to blossom.

David has been a vegan since 2012 and so finds the space fascinating and fitting to be involved in... "It's exciting to envisage a future in which anyone can eat meat, whilst maintaining the morals around animal cruelty which first shifted my focus all those years ago"