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Dynamique des flux dans les bioréacteurs à base d'échafaudages

Flow Dynamics in Scaffold-Based Bioreactors

David Bell |

La manière dont les fluides se déplacent dans les bioréacteurs à base d'échafaudages change la donne pour la production de viande cultivée. Un flux adéquat garantit que les cellules reçoivent suffisamment de nutriments et d'oxygène tout en éliminant les déchets, en particulier pour les structures tissulaires épaisses. Voici pourquoi c'est important :

  • Limites de diffusion : Les nutriments ne pénètrent que de 100 à 200 μm par diffusion, laissant les cellules internes affamées.
  • Bioréacteurs à perfusion : Ces systèmes poussent activement le milieu de culture à travers les échafaudages, améliorant la distribution des nutriments et l'élimination des déchets.
  • Compromis de contrainte de cisaillement : Un flux contrôlé stimule la croissance, mais un cisaillement excessif peut nuire aux cellules.

Les facteurs clés incluent les taux de perfusion, la conception de l'échafaudage (taille des pores, porosité) et les modèles informatiques pour prédire le comportement du flux. Les bioréacteurs et outils avancés, comme ceux disponibles via Cellbase, jouent un rôle vital dans l'augmentation de la production de viande cultivée avec une qualité constante.

Lisez pour des informations sur le contrôle de flux, la conception d'échafaudages et comment les outils informatiques façonnent ce domaine.

Modélisation de bioréacteur à perfusion utilisant ANSYS Fluent - Partie 1

ANSYS Fluent

Taux de perfusion et contrainte de cisaillement expliqués

Optimal Shear Stress Ranges and Flow Parameters for Scaffold-Based Bioreactors

Plages optimales de contrainte de cisaillement et paramètres de flux pour les bioréacteurs à base d'échafaudages

Comment les taux de perfusion affectent la croissance cellulaire

Les taux de perfusion sont cruciaux pour contrôler comment les nutriments sont délivrés et les déchets sont éliminés par le flux de milieu. Si le flux est trop faible, les cellules sont privées de nutriments essentiels. D'autre part, un flux excessif peut physiquement endommager les cellules. La clé est de trouver le bon équilibre pour maximiser l'échange de nutriments sans causer de dommages.

Des études montrent que les cultures en perfusion peuvent entraîner plus du double de la prolifération cellulaire par rapport aux cultures statiques sur deux semaines [4]. Dans certains cas, la différence est encore plus frappante. Par exemple, dans les échafaudages sphériques, le volume cellulaire a quadruplé par rapport aux échafaudages cubiques après trois semaines de perfusion [7]. Il ne s'agit pas seulement d'augmenter le débit - il s'agit de créer les bonnes conditions mécaniques pour la croissance.

"Le mélange et le stress de cisaillement induits par la perfusion amélioreront le développement en stimulant mécaniquement les cellules, leur permettant de se différencier en le type de cellule souhaité." – SN Applied Sciences [4]

Le stress de cisaillement joue également un rôle critique. De faibles niveaux (~0,05 mPa) encouragent la croissance cellulaire, tandis que des niveaux plus élevés (15 mPa–1.5 Pa) différencier et activer les gènes spécifiques aux tissus [2][8]. Cela signifie que les stratégies de perfusion doivent s'adapter à mesure que les cellules passent de la croissance initiale à la formation de tissus fonctionnels. La section suivante explore comment gérer efficacement le stress de cisaillement pour protéger la viabilité cellulaire.

Contrôler le stress de cisaillement pour maintenir la viabilité cellulaire

Le stress de cisaillement pariétal (WSS) est une arme à double tranchant. Pour l'ingénierie des tissus osseux, la plage idéale se situe entre 10 et 30 mPa, ce qui favorise la minéralisation. Cependant, dépasser 60 mPa peut nuire à la viabilité cellulaire [5]. À mesure que la densité cellulaire augmente, la porosité de l'échafaudage diminue, ce qui peut restreindre les chemins d'écoulement et entraîner des pics localisés de stress de cisaillement si les débits restent constants.

Une façon de résoudre ce problème est de réduire progressivement la vitesse d'écoulement à mesure que la densité tissulaire augmente. Par exemple, des conditions de flux constant réduisent le pourcentage de cellules exposées à un WSS optimal de 50 % à 18,6 % sur 21 jours. En revanche, réduire le débit au fil du temps maintient des conditions optimales pour plus de 40 % des cellules [5]. Durant la phase de semis, une calibration précise est essentielle ; un débit de 120 µl/min est idéal, tandis que des débits plus élevés comme 600 µl/min peuvent créer des vortex, empêchant une bonne fixation de l'échafaudage [3].

La géométrie de l'échafaudage a également un impact majeur. La manière dont le flux interagit avec la structure de l'échafaudage doit s'aligner avec son architecture pour maintenir la santé cellulaire et soutenir la croissance tissulaire. Par exemple, sous les mêmes conditions de flux, les éléments d'échafaudage sphériques produisent un WSS moyen de 20 mPa, comparé à 11 mPa dans les éléments cubiques [7]. Cela souligne à quel point le bon design de l'échafaudage, combiné à un contrôle précis du flux, est essentiel pour optimiser les résultats.

Conception de bioréacteur pour le contrôle du flux

Porosité de l'échafaudage et conception du canal de flux

La structure d'un échafaudage joue un rôle crucial dans la gestion du flux de fluide et la distribution des cellules. Des facteurs clés comme la taille des pores, le pourcentage de porosité et l'agencement des pores influencent directement la manière dont le fluide se déplace et les forces de cisaillement agissant sur les cellules [1]. Essentiellement, la taille et la disposition des pores déterminent la vitesse du flux et comment le stress de cisaillement est distribué à travers l'échafaudage.

"Dans les conditions de perfusion appliquées, le dépôt cellulaire est principalement déterminé par le stress de cisaillement local sur les parois, qui, à son tour, est fortement influencé par l'architecture du réseau de pores de l'échafaudage." – Biomaterials Journal [1]

Les conceptions d'échafaudage sont généralement soit isotropes, soit en gradient.Les échafaudages isotropes ont des tailles de pores uniformes - environ 412 μm avec une porosité de 62% - résultant en des taux de cisaillement constants allant de 15 à 24 s⁻¹. En revanche, les échafaudages en gradient présentent des tailles de pores variables (250–500 μm) et des niveaux de porosité (35%–85%), créant une gamme de cisaillement plus large de 12–38 s⁻¹ [1]. Ce design en gradient encourage les cellules à s'accumuler dans des zones spécifiques, tandis que les échafaudages isotropes assurent une distribution uniforme dans toute la structure.

À mesure que les cellules se développent et occupent les espaces vides de l'échafaudage, elles réduisent sa porosité, modifiant la dynamique des fluides. Les échafaudages plus denses nécessitent une pression plus élevée pour maintenir le flux, ce qui risque de générer un stress de cisaillement excessif. Pour une croissance tissulaire efficace, un rayon de pore d'environ 100 μm est crucial [2][6]. Cependant, la taille de pore idéale varie en fonction du type de tissu cultivé.Ces facteurs sont essentiels pour concevoir des bioréacteurs qui gèrent efficacement le flux.

Types de bioréacteurs et méthodes de contrôle du flux

Les bioréacteurs à perfusion sont efficaces pour distribuer uniformément les nutriments tout en appliquant un stress de cisaillement contrôlé. En dirigeant le milieu à travers le support, ils favorisent le développement de tissus plus épais [2].

Les réacteurs à lit fixe, en revanche, sont conçus pour des opérations à grand volume mais rencontrent des défis avec une porosité radiale inégale. Cela peut entraîner un "canalisation", où le fluide contourne certaines zones, perturbant la distribution uniforme. Par exemple, en novembre 2017, des chercheurs ont testé les échafaudages commerciaux en PCL de 3D Biotek (5 mm de diamètre, 1,5 mm de hauteur). Ils ont constaté qu'un débit de 120 μl/min entraînait une efficacité de semis de 11% ± 0,61%. Cependant, à 600 μl/min, l'efficacité a chuté à 6,5% ± 0.61% en raison de la formation de vortex, qui a piégé les cellules dans des zones de recirculation au lieu de leur permettre de s'attacher aux fibres de l'échafaudage [3]. Cela souligne à quel point le contrôle du flux est crucial pour obtenir un ensemencement cellulaire cohérent.

Différents systèmes emploient des méthodes distinctes pour gérer le flux. Les bioréacteurs à perfusion se concentrent sur la direction du flux à travers l'échafaudage, tandis que les systèmes à fibres creuses régulent à la fois le flux d'entrée du lumen et la contre-pression de sortie pour simuler la distribution de nutriments semblable à celle des capillaires [9]. Les systèmes avancés intègrent des capteurs et des moniteurs pour maintenir des conditions stables [8]. De plus, pour éviter les bulles d'air - qui peuvent nuire aux cellules ou perturber le flux - placer le réservoir de milieu au-dessus de la chambre de culture utilise efficacement la pression hydrostatique [8].

Utilisation de modèles computationnels pour prédire le comportement des flux

Avantages de la CFD dans la conception de bioréacteurs

Les modèles de dynamique des fluides computationnelle (CFD) sont des outils puissants pour prédire comment les fluides se déplacent à travers les structures de l'échafaudage. En résolvant les équations de Navier-Stokes, ces modèles fournissent des informations sur le stress de cisaillement et la distribution des nutriments - sans avoir besoin de prototypes physiques. Cela réduit non seulement les coûts de développement, mais élimine également le risque de contamination qui peut survenir lors d'essais expérimentaux répétés [11][3][10].

Les géométries d'échafaudage peuvent être conçues à l'aide de la CAO pour des formes standard ou de l'imagerie μCT pour des structures plus complexes [2][10]. En mars 2005, des chercheurs ont utilisé la méthode de Lattice-Boltzmann avec l'imagerie μCT à une résolution de voxel de 34 μm pour simuler comment le milieu s'écoule à travers des échafaudages cylindriques. Leur modèle a montré qu'un stress de cisaillement moyen de surface de 5×10⁻⁵ Pa était lié à une amélioration de la prolifération cellulaire [2].

La CFD aide également à prédire comment les schémas d'écoulement évoluent à mesure que les cellules croissent et remplissent les espaces vides au sein des échafaudages. Par exemple, en novembre 2021, une étude a utilisé COMSOL Multiphysics pour simuler l'écoulement de fluide à travers des échafaudages hiérarchiques 3DP/TIPS. En modélisant 38 canaux d'entrée dans un échafaudage de 10 mm de diamètre, les chercheurs ont ajusté la vitesse de la pompe péristaltique pour atteindre un stress de cisaillement de paroi de 20 mPa, idéal pour les cellules préostéoblastiques murines [4] . Ces modèles peuvent même incorporer des facteurs complexes tels que la cinétique de croissance cellulaire et les taux de consommation d'oxygène en utilisant les équations de Michaelis-Menten.Cela permet aux concepteurs d'anticiper comment le développement des tissus influencera la dynamique des fluides au fil du temps [11][12].

"La CFD peut aider à réduire le coût, le temps et le risque de contamination inhérents aux expériences requises." – Future Foods Mini-Review [11]

Ces capacités prédictives ouvrent également la voie à l'intégration de la rétroaction des capteurs pour ajuster dynamiquement les conditions d'écoulement.

Surveillance en Temps Réel avec Capteurs

Associer des capteurs à des modèles computationnels fait progresser la conception des bioréacteurs en permettant des ajustements en temps réel pour maintenir des conditions optimales. Par exemple, en décembre 2025, des chercheurs ont testé le BioAxFlow bioréacteur en utilisant COMSOL Multiphysics 6.3 pour simuler la distribution de l'oxygène et la vitesse des fluides.Ils ont appliqué un taux de consommation d'oxygène normalisé par cellule de 2 nmol min⁻¹ 10⁻⁶ cellules pour les cellules SAOS-2 sur des échafaudages en PLA. Les résultats ont montré que la géométrie de la chambre soutenait une distribution uniforme des cellules sans avoir besoin d'agitateurs mécaniques [13] .

Les systèmes avancés peuvent désormais ajuster les débits en fonction des niveaux d'oxygène surveillés, garantissant que même le centre de l'échafaudage reste correctement oxygéné [13]. Cependant, un défi persiste : mesurer le stress de cisaillement local au sein des échafaudages. Comme le souligne X. Yan de l'Université de la Saskatchewan : "En raison du manque de capteurs adéquats, il est difficile, voire impossible, de mesurer la distribution du stress de cisaillement local au sein d'un échafaudage" [10]. Cette limitation souligne la valeur de la modélisation CFD, qui peut fournir des prédictions détaillées que les capteurs physiques ne peuvent actuellement pas atteindre.

Application des dynamiques de flux à la production de viande cultivée

Amélioration de la qualité des tissus grâce au contrôle du flux

L'utilisation de dynamiques de flux contrôlées peut améliorer considérablement la qualité de la viande cultivée en assurant une distribution uniforme des cellules à travers le support. L'un des principaux problèmes des cultures statiques est que la croissance cellulaire se concentre souvent autour des bords du support, laissant le centre sous-développé. Les dynamiques de flux résolvent ce problème en améliorant le transport de masse, permettant à l'oxygène et aux nutriments d'atteindre le cœur du support tout en éliminant efficacement les déchets. Cet équilibre est essentiel pour produire des produits de viande cultivée de haute qualité et structurellement solides.

Le stress de cisaillement joue un rôle critique ici. Par exemple, des études montrent qu'un stress de cisaillement moyen de surface de 5×10⁻⁵ Pa encourage la prolifération cellulaire dans les constructions 3D. En comparaison, les supports conçus pour le tissu osseux visent souvent environ 20 mPa (0.02 Pa) au début de la culture pour fournir une stimulation mécanique [2][4]. Cependant, à mesure que les cellules remplissent les pores de l'échafaudage, les canaux d'écoulement se rétrécissent, augmentant naturellement le stress de cisaillement même si la vitesse de la pompe reste constante [4].

"L'hétérogénéité observée dans la synthèse de la matrice est considérée comme le résultat d'une distribution inadéquate des nutriments et de l'élimination des déchets au sein des constructions." – Robert Guldberg [2]

L'efficacité de l'ensemencement initial des cellules souligne également comment la dynamique de l'écoulement influence les résultats tissulaires. Des recherches utilisant des échafaudages en PCL ont montré qu'un débit de 120 μl/min était idéal pour l'ensemencement, tandis que des débits plus élevés, comme 600 μl/min, réduisaient l'efficacité en raison de la formation de vortex, qui piégeaient les cellules dans des zones de recirculation [3]. Réaliser une distribution initiale uniforme des cellules est crucial pour garantir la qualité du produit final. Ces résultats soulignent l'importance d'utiliser des équipements capables de répondre à des exigences de flux précises.

Approvisionnement en Équipement via Cellbase

Atteindre un contrôle précis du flux et optimiser la qualité des tissus nécessitent l'accès à des équipements spécialisés. C'est là que Cellbase intervient en tant que place de marché B2B dédiée, connectant les chercheurs et les équipes de production avec des fournisseurs qui comprennent les besoins techniques de la production de viande cultivée.

Grâce à Cellbase, les équipes peuvent se procurer des échafaudages avec des architectures sur mesure, telles que celles combinant l'impression 3D pour les macrocanaux avec la séparation de phase induite thermiquement (TIPS) pour les micropores. Ces conceptions améliorent la diffusion des nutriments et la migration cellulaire [4]. Le marché propose également une gamme d'équipements, y compris des pompes à seringue pour la perfusion à faible volume (12–600 μl/min) et des pompes péristaltiques pour les opérations à plus grande échelle [3][4].

Pour ceux qui augmentent la production, Cellbase offre des options de bioréacteurs adaptées à différentes caractéristiques de flux. Celles-ci incluent des bioréacteurs à cuve agitée pour l'expansion cellulaire à haute densité, des bioréacteurs à onde/basculement conçus pour les cellules souches sensibles au cisaillement (capables de maintenir une contrainte de cisaillement aussi basse que 0,01 Pa), et des bioréacteurs à fibres creuses avec des rayons internes entre 300 et 400 μm, optimisés pour la croissance cellulaire dense [11]. En simplifiant l'approvisionnement et en assurant la compatibilité, Cellbase aide les équipes de production à rester en avance dans un marché où la consommation mondiale de viande devrait croître de 14 % d'ici 2030 [11].

Conclusion

La gestion des dynamiques de flux dans les bioréacteurs à base d'échafaudages est essentielle pour produire de la viande cultivée de haute qualité. Le succès dépend du contrôle efficace des taux de perfusion et du stress de cisaillement tout au long du processus de culture. Les cultures statiques ne parviennent pas à soutenir les structures tissulaires épaisses et uniformes nécessaires à la production à l'échelle commerciale. Les cellules situées à plus de 100–200 μm de la surface ne reçoivent souvent pas suffisamment de nutriments et d'oxygène, soulignant l'importance d'une gestion avancée des flux dans la conception des bioréacteurs [4].

Lorsque les paramètres de flux sont optimisés, les bioréacteurs à perfusion peuvent plus que doubler la prolifération cellulaire par rapport aux cultures statiques [4]. Ajuster la perfusion et le stress de cisaillement est particulièrement important pour obtenir une croissance tissulaire cohérente.Par exemple, une recherche menée à l'Université de Sheffield en avril 2020 a révélé que réduire progressivement le débit de fluide au fil du temps, au lieu de maintenir un débit constant, améliorait considérablement les résultats. Après 21 jours, 40,9 % de la surface cellulaire restait dans la plage optimale de contrainte de cisaillement, contre seulement 18,6 % dans des conditions de débit constant [5]. Ce changement unique peut grandement améliorer à la fois la qualité des tissus et l'efficacité de la production.

"Pour obtenir un tissu plus minéralisé, la méthode conventionnelle de chargement des bioréacteurs de perfusion (i.e. débit/ vitesse constant) devrait être modifiée pour un débit décroissant au fil du temps." – F. Zhao et al. [5]

Atteindre le bon équilibre entre le transport de masse et la stimulation mécanique est crucial.Un flux insuffisant prive les cellules internes, tandis qu'un flux excessif risque de les déloger [10][3]. La modélisation par dynamique des fluides computationnelle (CFD) joue un rôle clé dans la prédiction des conditions de flux locales et l'optimisation des performances des bioréacteurs [2][10].

Le passage à la production à grande échelle présente également des défis en matière d'équipement. Des échafaudages avec des structures hiérarchiques aux bioréacteurs avec un contrôle précis du flux, il est essentiel de trouver les bons outils. Cellbase aide les entreprises de viande cultivée à surmonter cet obstacle en les connectant avec des fournisseurs vérifiés, garantissant que la recherche de pointe sur la dynamique des flux se traduit par un succès commercial.

FAQ

Comment choisir un débit de perfusion sûr pour mon échafaudage ?

Équilibrer le débit de perfusion est essentiel pour assurer une bonne fixation des cellules et des performances optimales de l'échafaudage tout en évitant les dommages potentiels. Commencer avec des débits modérés est souvent une approche judicieuse. À partir de là, surveillez de près la viabilité cellulaire et l'intégrité de l'échafaudage à mesure que vous effectuez des ajustements progressifs. L'utilisation de modèles computationnels ou de données expérimentales adaptées à la conception spécifique de votre échafaudage peut fournir des informations précieuses. Cela aide à affiner le débit de perfusion pour soutenir une croissance cellulaire optimale et un transport efficace des nutriments, tout en minimisant le risque de dommages dus au stress de cisaillement.

Comment éviter les dommages dus au stress de cisaillement à mesure que le tissu s'épaissit ?

Pour réduire le risque de dommages dus au stress de cisaillement à mesure que le tissu s'épaissit, il est important de diminuer progressivement le débit de perfusion pendant la culture.Cet ajustement aide à maintenir la contrainte de cisaillement pariétal (WSS) dans la plage idéale de 10–30 mPa, ce qui protège les cellules d'une contrainte excessive tout en favorisant la minéralisation. Des études computationnelles soutiennent cette méthode, montrant qu'elle peut réduire considérablement la quantité de tissu exposé à un cisaillement élevé, aidant à protéger le tissu en développement des dommages.

Que doit inclure la modélisation CFD pour des prédictions de flux réalistes?

La modélisation CFD doit incorporer la microstructure de l'échafaudage, assurer une simulation précise du flux de fluide et fournir une analyse détaillée de la contrainte de cisaillement. De plus, la validation des données expérimentales est cruciale pour garantir que les prédictions s'alignent avec les conditions réelles. Ensemble, ces facteurs contribuent à une compréhension plus approfondie des dynamiques de flux au sein des bioréacteurs basés sur des échafaudages.

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Author David Bell

About the Author

David Bell is the founder of Cultigen Group (parent of Cellbase) and contributing author on all the latest news. With over 25 years in business, founding & exiting several technology startups, he started Cultigen Group in anticipation of the coming regulatory approvals needed for this industry to blossom.

David has been a vegan since 2012 and so finds the space fascinating and fitting to be involved in... "It's exciting to envisage a future in which anyone can eat meat, whilst maintaining the morals around animal cruelty which first shifted my focus all those years ago"