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IA et Jumeaux Numériques dans l'Automatisation des Bioprocédés

AI and Digital Twins in Bioprocess Automation

David Bell |

La mise à l'échelle de la production de viande cultivée est coûteuse et chronophage. Passer de petits laboratoires à des bioréacteurs commerciaux échoue souvent en raison de résultats biologiques imprévisibles. Mais l'IA et les jumeaux numériques changent cela. Ces outils simulent et optimisent les processus virtuellement, réduisant les coûts et le temps de développement jusqu'à 50 %. Voici comment :

  • Les jumeaux numériques créent des répliques virtuelles de bioréacteurs, simulant des conditions telles que la dynamique des fluides et la distribution des nutriments. Ils prédisent les résultats sans risquer l'équipement physique.
  • Les capteurs alimentés par l'IA permettent une surveillance et des ajustements en temps réel, améliorant l'efficacité et réduisant le gaspillage.
  • Des entreprises comme Gourmey ont utilisé ces technologies pour réduire considérablement les coûts de production et les dépenses d'alimentation.

De l'optimisation de la croissance cellulaire à la prévention des pannes d'équipement, l'IA et les jumeaux numériques redéfinissent le chemin vers une production de viande cultivée évolutive et rentable. Continuez à lire pour découvrir comment ces outils sont mis en œuvre et leur impact sur l'industrie.

AI and Digital Twins Impact on Cultivated Meat Production Costs and Efficiency

Impact de l'IA et des Jumeaux Numériques sur les Coûts et l'Efficacité de la Production de Viande Cultivée

Application de l'IA et des Jumeaux Numériques pour le Biotraitement : Pièges et Solutions pour...

Avantages de l'IA et des Jumeaux Numériques pour la Production de Viande Cultivée

L'IA et les jumeaux numériques ont un impact majeur sur la production de viande cultivée en améliorant le contrôle des processus, en réduisant les coûts et en ouvrant la voie à des opérations commerciales à grande échelle.

Amélioration du contrôle et de la surveillance des bioréacteurs

Les jumeaux numériques permettent aux producteurs de simuler les conditions des bioréacteurs - telles que la géométrie, la dynamique des fluides et les paramètres physiques - rendant possible l'exécution de scénarios "et si". Ces simulations aident à affiner des paramètres critiques comme la température, les niveaux de pH et l'apport en nutriments sans avoir besoin d'ajustements physiques coûteux [1] [6] [4].

L'IA joue un rôle clé grâce à la "détection douce", qui permet la surveillance en temps réel de variables difficiles à mesurer directement. Les capteurs virtuels estiment des détails tels que les niveaux d'oxygène dissous et la concentration de glucose dans les zones où les capteurs physiques sont insuffisants. Les données des bioréacteurs sont constamment comparées aux modèles virtuels, aidant à repérer les écarts ou les signes précoces de problèmes d'équipement.Cela permet une maintenance prédictive, comme le souligne Octocells:

"En prédisant quand une machine est susceptible de tomber en panne ou de nécessiter un entretien, la maintenance sera programmée de manière proactive, réduisant ainsi les temps d'arrêt et prolongeant la durée de vie de l'équipement." [1]

De plus, l'IA causale aide les producteurs à comprendre les interactions moléculaires, en prédisant comment des molécules spécifiques influenceront le comportement cellulaire [4]. Ces capacités améliorent la fiabilité tout en réduisant les coûts, créant une base solide pour augmenter la production.

Réduction des coûts grâce à l'optimisation des processus

Un meilleur contrôle des bioréacteurs réduit directement les coûts opérationnels en minimisant le gaspillage et en optimisant l'utilisation des milieux de culture cellulaire - la plus grande dépense dans la production de viande cultivée.Les jumeaux numériques permettent des tests virtuels du comportement des cellules et des changements de milieu, réduisant ainsi considérablement le besoin d'expériences coûteuses en laboratoire humide.

Un excellent exemple vient de Gourmey, une start-up française qui s'est associée à la société de biotechnologie DeepLife en juin 2025. Ensemble, ils ont développé un jumeau numérique de cellules de volaille en analysant les données de séquençage de millions de cellules aviaires et en les intégrant avec des données de perturbation de milieu. Nicolas Morin-Forest, PDG de Gourmey, a expliqué :

"L'optimisation de ces paramètres augmente le rendement, réduit le gaspillage d'aliments, qui est un facteur de coût principal dans la viande cultivée, et réduit directement les coûts de production." [4]

Jonathan Baptista, PDG de DeepLife, a également noté :

"Le modèle est affiné en utilisant les données de Gourmey sur les perturbations de milieu, ce qui lui permet de prédire comment différentes molécules affecteront le comportement de chaque population cellulaire." [4]

Au-delà de l'optimisation des médias, les jumeaux numériques aident également à réduire les dépenses d'investissement. Les entreprises peuvent créer des répliques virtuelles d'usines pour tester les agencements, les emplacements des équipements et les flux de travail avant le début de la construction, garantissant une efficacité maximale [1]. Ces simulations offrent également un moyen sûr et rentable de former les opérateurs, accélérant la préparation et réduisant les coûts de formation.

Passage à la Production Commerciale

Les jumeaux numériques jouent un rôle crucial dans le passage des opérations du laboratoire à la production à grande échelle. Cette transition s'accompagne souvent de défis d'ingénierie, notamment pour assurer l'écoulement des fluides et la distribution des nutriments dans les grands bioréacteurs. Les jumeaux numériques, combinés à la dynamique des fluides numérique (CFD), aident à optimiser ces facteurs [7].

En simulant des conceptions et des processus, les producteurs peuvent combler le fossé entre les configurations expérimentales et la fabrication à grande échelle. Comme le souligne FUDZS:

"En identifiant la conception la plus efficace grâce à la simulation, les investisseurs s'assureront que chaque dollar ou euro dépensé pour la construction génère le retour sur investissement le plus élevé possible!" [1]

À une échelle commerciale, les jumeaux numériques continuent de surveiller la performance des équipements en temps réel, en la comparant à des références virtuelles pour détecter les premiers signes d'usure. Cette approche proactive minimise les temps d'arrêt, garantissant une production continue pour répondre à la demande du marché [1].

Les simulations pilotées par l'IA accélèrent également la recherche et le développement en réduisant la dépendance aux expériences traditionnelles en laboratoire humide. Cela permet aux producteurs de rapidement affiner les lignées cellulaires, les formules de milieux et les processus de production tout en respectant le budget et le calendrier.

Comment mettre en œuvre l'IA et les jumeaux numériques dans l'automatisation des bioprocédés

Intégrer l'IA et les jumeaux numériques dans la production de viande cultivée nécessite une solide base en gestion des données, des techniques de modélisation hybride et du matériel approprié. Le point de départ est de construire une couche de données qui diffuse les données critiques du bioréacteur - telles que le pH, l'oxygène dissous, le couple, la vitesse d'agitation et la masse d'alimentation - dans un historien de l'usine. Cette étape pose les bases d'une mise en œuvre efficace [5] .

La phase suivante consiste à créer un modèle hybride. Cette approche mélange des principes mécanistes, comme les bilans de masse et les taux de transfert d'oxygène, avec des algorithmes d'apprentissage automatique. Connu sous le nom de modèle "boîte grise", il va au-delà des méthodes traditionnelles basées sur la physique pour mieux prédire les comportements biologiques complexes.Comme le dit James Westley, directeur associé chez Cambridge Consultants :

"L'approche commence par compléter l'IA avec une 'intelligence réelle'... en combinant l'IA avec une expertise du domaine pour réduire le nombre d'expériences – de quelques milliers à quelques dizaines" [2].

En réduisant le nombre d'expériences nécessaires, cette méthode peut réduire considérablement les coûts tout en maintenant la précision. Une fois la base en place, l'accent est mis sur la formation du jumeau numérique et son intégration dans le contrôle des processus en temps réel.

Former des Jumeaux Numériques avec des Données Expérimentales

Pour qu'un jumeau numérique fonctionne efficacement, il a besoin de données de qualité provenant d'expériences physiques. Les modèles traditionnels nécessitent souvent des centaines voire des milliers de points de données.Cependant, la modélisation hybride simplifie cela en incorporant des relations physiques et chimiques connues, comme la façon dont l'augmentation de CO₂ affecte le pH, réduisant ainsi la charge de données [2] .

L'utilisation de la conception d'expériences guidée par l'IA (DoE) avec optimisation bayésienne rationalise davantage le processus. Cette méthode priorise les expériences les plus informatives, évitant l'inefficacité des essais et erreurs. Par exemple, dans une étude, les chercheurs ont entraîné un modèle hybride en utilisant seulement 21 expériences et l'ont validé avec 6 tests supplémentaires. Le modèle a prédit avec précision la croissance de la biomasse et la consommation de glucose [8] .

Ces avantages ne sont pas seulement théoriques. En juin 2025, la start-up française Gourmey s'est associée à la société de biotechnologie DeepLife pour développer un jumeau numérique pour la production de volaille cultivée.En analysant les données de séquençage de millions de cellules aviaires et en les intégrant dans des modèles de langage de grande taille (LLMs), ils ont simulé des mécanismes intracellulaires. Cela leur a permis d'optimiser virtuellement les formulations d'aliments avant de mener des expériences physiques. Comme l'a expliqué Nicolas Morin-Forest, PDG de Gourmey :

"En combinant la plateforme de culture cellulaire propriétaire de Gourmey et des outils analytiques avancés avec la technologie de jumeau numérique de pointe de DeepLife, nous pouvons désormais simuler et optimiser chaque étape de la production" [4].

De telles méthodes non seulement réduisent les coûts mais améliorent également le contrôle du processus de production.

Intégration de l'IA pour des ajustements en temps réel

Une fois qu'un jumeau numérique est formé, il peut être utilisé pour le contrôle de processus en temps réel grâce à Model Predictive Control (MPC) ou Reinforcement Control (RC).Ces systèmes ajustent des paramètres tels que le pH, l'oxygène dissous et les taux d'alimentation en fonction des prédictions du jumeau [5] . Ce type de contrôle en boucle fermée repose sur la Technologie Analytique de Procédé (PAT), avec des capteurs avancés tels que la spectroscopie Raman ou FTIR mesurant les métabolites clés environ toutes les 60 secondes [5].

Avant d'automatiser complètement les processus, il est judicieux de tester le système en "mode ombre". Cela permet de comparer les recommandations de l'IA avec les décisions des opérateurs sans risque, renforçant la confiance dans les capacités du système [5]. Par exemple, Elise Biopharma a utilisé un jumeau numérique avec MPC dans un processus de culture en fed-batch de 1 000 litres. Cela a révélé des problèmes de transfert d'oxygène causés par la viscosité du bouillon. En rééquilibrant l'agitation et la contre-pression, le système a résolu le problème et amélioré le rendement [5].

Pour garantir le succès, l'équipement doit prendre en charge le flux de données continu et le flux d'informations bidirectionnel. Les "capteurs logiciels" alimentés par l'IA sont particulièrement précieux ici, car ils déduisent des variables difficiles à mesurer directement, offrant des perspectives au-delà de la portée des capteurs physiques [5].

Utilisation de Cellbase pour l'approvisionnement en équipement

Le passage de l'IA et des jumeaux numériques du laboratoire à la production commerciale nécessite du matériel spécialisé que les fournisseurs de laboratoires généralistes pourraient ne pas fournir. L'équipement essentiel comprend des bioréacteurs avec connectivité de données intégrée, des capteurs en ligne avancés comme les sondes Raman et FTIR, des spectromètres de masse pour gaz résiduaires, et des bioréacteurs parallèles multi-puits avec microfluidique. De plus, les milieux de culture doivent être soigneusement suivis, car les variations de composition peuvent avoir un impact significatif sur les réponses biologiques [2][5].

Cellbase simplifie ce processus en servant de marché centralisé adapté à l'industrie de la viande cultivée. Plutôt que de naviguer entre plusieurs fournisseurs, les équipes peuvent s'approvisionner en bioréacteurs vérifiés, milieux de culture et capteurs avancés à partir d'une seule plateforme. Les annonces incluent des spécifications détaillées, telles que la compatibilité avec les échafaudages ou la conformité GMP, aidant les équipes de production à minimiser les risques techniques.

Pour les entreprises scalant les processus de viande cultivée de la recherche à la production commerciale, Cellbase les connecte avec des fournisseurs qui comprennent les défis uniques de la viande cultivée. Cela inclut des équipements conçus pour des modèles de "réduction d'échelle", comme des modules de découverte de 2 litres, qui reproduisent la physique de systèmes plus grands jusqu'à 3 000 litres. Ces outils aident à prévenir la dérive du modèle lors de la mise à l'échelle et assurent un processus de transfert de technologie plus fluide.

Étude de cas : Jumeaux numériques et IA dans la production de viande cultivée

DeepLife-Gourmey Jumeau numérique aviaire

DeepLife

Cette étude de cas explore comment l'IA et la technologie des jumeaux numériques transforment l'industrie de la viande cultivée, en se concentrant sur une collaboration entre la société française de viande cultivée Gourmey et la firme de biotechnologie DeepLife.

En juin 2025, Gourmey et DeepLife ont dévoilé le premier jumeau numérique aviaire - un modèle virtuel de cellules de volaille visant à optimiser les conditions de croissance. Le projet s'est concentré sur les cellules souches embryonnaires de canard, recueillant des données multi-omiques sur sept jours. Ces données ont été analysées à l'aide de modèles de langage de grande taille, qui ont identifié des mécanismes intracellulaires et prédit comment diverses molécules influencent le comportement cellulaire [4] [9].

Le jumeau numérique utilise l'IA causale pour cartographier les relations de cause à effet au sein des cellules. Un cadre Target-Action-Metabolite (TAM) relie les résultats cellulaires, tels que l'amélioration de la viabilité cellulaire ou l'amélioration de la synthèse des graisses, à des métabolites spécifiques et à des paramètres de processus [9]. Cela permet des milliers d'expériences virtuelles, réduisant ainsi les essais en laboratoire humides coûteux et chronophages. Les informations obtenues ont conduit à des avancées de production mesurables.

Une découverte remarquable a été le rôle de l'acide oléoyl-lysophosphatidique (LPA). L'IA a suggéré que le LPA pourrait activer le gène régulateur d'énergie SIRT6, améliorant la viabilité cellulaire et équilibrant les niveaux de lipides. Cela a permis l'optimisation des milieux sans nécessiter de modifications génétiques [9]. Nicolas Morin-Forest, PDG de Gourmey, a souligné l'impact de cette technologie :

"L'intégration de la technologie de jumeau numérique de DeepLife dans notre plateforme nous permet de modéliser comment les cellules aviaires réagissent à différentes conditions de culture avant d'entrer en laboratoire. Cela accélère nos cycles de R&D, réduit la dépendance aux essais et erreurs coûteux, et améliore finalement notre capacité à optimiser l'économie de production à grande échelle" [10].

Les résultats sont impressionnants. Gourmey rapporte avoir atteint un coût de production remarquablement bas à une échelle commerciale de 5 000 litres, selon une évaluation technico-économique indépendante [10]. De plus, l'entreprise affirme avoir considérablement réduit le coût de son aliment sûr pour la consommation [10]. Avec plus de 65 millions d'euros de financement, l'équipe de 60 personnes de Gourmey à Paris continue d'affiner le jumeau numérique, l'utilisant pour améliorer les aspects sensoriels tels que l'intensité de l'umami et la structure des graisses. Cette collaboration démontre comment l'IA et les jumeaux numériques peuvent offrir des avancées évolutives et percutantes dans la production de viande cultivée [10].

Défis d'adoption et exigences en matière de données

Créer un jumeau numérique pour la production de viande cultivée n'est pas une mince affaire. Développer un modèle d'IA à usage général pour le biotraitement nécessite des ensembles de données étendus - des centaines à des milliers de points de données. Ce processus n'est pas seulement chronophage ; il peut également coûter des millions et prendre des années à compléter [2]. Le défi réside dans la biologie elle-même, où au moins dix variables de processus interagissent de manière hautement complexe et non linéaire [2].

L'infrastructure nécessaire pour soutenir cet effort est tout aussi exigeante. Les entreprises nécessitent une automatisation de laboratoire à haut débit pour la préparation des milieux, des bioréacteurs équipés de capteurs de surveillance en temps réel (suivi du pH, de la température, de l'oxygène dissous et des nutriments), et des systèmes informatiques haute performance pour gérer les simulations d'IA [11] . De plus, le coût des matériaux reste un obstacle - le sérum fœtal bovin et les microporteurs pour les grands réservoirs de bioréacteurs peuvent être particulièrement coûteux [11]. Un autre obstacle important est le manque de jeux de données spécifiques aux oiseaux, ce qui limite la capacité des modèles d'IA à se généraliser à différentes espèces de volaille [12].

Pour surmonter ces obstacles, les entreprises adoptent la modélisation hybride - une méthode qui combine l'IA avec l'expertise du domaine et la physique des premiers principes. En intégrant des relations connues, telles que la corrélation inverse entre les niveaux de CO₂ et le pH, ces modèles peuvent réduire considérablement le nombre d'expériences physiques nécessaires [2][13] . Relever ces défis est crucial pour exploiter pleinement l'automatisation pilotée par l'IA dans le secteur de la viande cultivée. Malgré les difficultés, les tendances émergentes ouvrent la voie à des changements transformateurs dans l'automatisation des bioprocédés.

L'industrie répond à ces défis avec des innovations de pointe.Le marché mondial de l'IA dans la viande cultivée devrait passer de 70 millions de livres sterling en 2025 à un impressionnant 2 500 millions de livres sterling d'ici 2035, avec un taux de croissance annuel de 42,7% [11]. Plusieurs tendances clés stimulent cette expansion. Par exemple, l'impression 3D intégrée à l'IA optimise les formulations de matériaux et les paramètres d'impression pour créer des structures de support qui reproduisent la texture de la viande naturelle [11]. De même, les systèmes de maintenance prédictive sont déployés pour surveiller les conditions des bioréacteurs, aidant à anticiper et à prévenir des problèmes tels que les échecs de lots ou la contamination [11][12] .

En janvier 2025, la Chine a fait un pas audacieux en lançant la 'Base d'Innovation en Science et Technologie des Nouveaux Aliments Protéinés' à Pékin, soutenue par un investissement majeur.Cette installation intègre des technologies d'IA et de blockchain pour permettre une surveillance et une traçabilité en temps réel tout au long du processus de production de viande cultivée, de la recherche à la vente au détail [11]. À peu près à la même époque, la start-up israélienne Aleph Farms a obtenu des financements supplémentaires pour améliorer son installation pilote pilotée par l'IA et travailler à la commercialisation de steaks cultivés entiers et rentables [11].

En regardant vers l'avenir, les jumeaux numériques devraient évoluer au-delà de l'amélioration du rendement. Ils visent à améliorer les attributs sensoriels - modélisant les composés volatils, les protéines et les lipides pour affiner le goût et la texture de la viande cultivée [3]. La montée des hubs d'IA open-source , comme le AI4CM Hub, favorise également la collaboration et l'innovation dans ce domaine [11]. Alors que ces technologies progressent, les entreprises investissant dans des capteurs en ligne automatisés, des bioréacteurs parallèles miniaturisés et des modèles d'IA hybrides seront mieux équipées pour augmenter la production efficacement tout en naviguant dans les paysages réglementaires. Réaliser une culture évolutive et rentable sera la clé du succès commercial dans cette industrie en rapide évolution.

Conclusion

L'IA et les jumeaux numériques transforment l'automatisation des bioprocédés dans la production de viande cultivée. En affinant les formulations d'alimentation, en accélérant la recherche grâce à des simulations virtuelles et en améliorant la prévisibilité lors de la montée en échelle, ces technologies réduisent considérablement les coûts et rendent l'industrie plus attrayante pour les investisseurs [2][4]. Comme le souligne James Westley, directeur associé chez Cambridge Consultants, ces outils améliorent l'évolutivité, ce qui est essentiel pour attirer les investissements. Ce changement numérique entraîne un processus de production plus axé sur les données et plus efficace.

La transition vers l'Industrie 4.0, marquée par des systèmes autonomes, devient une nécessité pour les entreprises souhaitant prospérer dans cet espace [13]. La modélisation hybride, qui mélange la physique mécaniste avec l'apprentissage automatique, rend les jumeaux numériques prédictifs plus accessibles - même pour les petites entreprises [2]. La surveillance en temps réel améliore encore l'efficacité en permettant des ajustements rapides et en réduisant la probabilité d'échecs de lots [2].

Clé de cette transformation est l'adoption d'outils avancés tels que capteurs en ligne automatisés, bioréacteurs parallèles miniaturisés, calcul haute performance, et outils PAT. Des plateformes comme Cellbase jouent un rôle central ici.En tant que premier marché B2B dédié au secteur de la viande cultivée, Cellbase connecte les chercheurs et les fabricants avec des fournisseurs de confiance offrant les capteurs spécialisés, les bioréacteurs et les outils analytiques nécessaires pour l'automatisation des bioprocédés pilotée par l'IA.

L'avenir de la production de viande cultivée est indéniablement numérique. Les entreprises qui adoptent l'IA et exploitent des plateformes comme Cellbase peuvent passer de la production à l'échelle de laboratoire à la production commerciale plus rapidement et avec un risque financier réduit.

FAQ

Quelles données sont nécessaires pour construire un jumeau numérique utile pour la viande cultivée ?

Pour construire un jumeau numérique fiable pour la production de viande cultivée, il est crucial de recueillir des données précises sur les paramètres biologiques et de processus. Les facteurs clés à surveiller incluent les mesures en temps réel du pH, de la température, de l'oxygène dissous, des niveaux de glucose et de la croissance cellulaire. Parallèlement à cela, les informations sur les conditions du bioréacteur, la dynamique des fluides et le transfert de masse jouent un rôle vital. La collecte de données précises et à haute fréquence garantit que le jumeau numérique reflète de près l'environnement du bioréacteur, permettant à l'IA d'optimiser les processus efficacement.

Comment les modèles hybrides (boîte grise) réduisent-ils le nombre d'expériences en laboratoire humide ?

Les modèles hybrides, ou boîte grise, combinent des modèles mécanistes avec l'apprentissage automatique pour créer des simulations virtuelles précises des processus. Ces modèles permettent des tests de scénarios efficaces et réduisent le besoin d'expériences physiques étendues. En se basant sur des prédictions computationnelles, ils aident à économiser à la fois du temps et des ressources tout en offrant des informations précieuses.

Quels capteurs et équipements sont essentiels pour le contrôle en temps réel par l'IA dans les bioréacteurs ?

Pour maintenir des conditions optimales dans les bioréacteurs, plusieurs capteurs jouent un rôle critique dans la surveillance et le contrôle en temps réel.Ces éléments incluent :

  • Capteurs de température (RTDs): Essentiels pour maintenir le bioréacteur à la température précise requise pour la croissance cellulaire.
  • Capteurs de pH: Disponibles en types verre ou ISFET, ceux-ci garantissent que les niveaux d'acidité ou d'alcalinité sont adaptés au processus.
  • Capteurs d'oxygène dissous (optiques): Cruciaux pour suivre les niveaux d'oxygène, qui impactent directement le métabolisme cellulaire.
  • Capteurs de métabolites: Utilisés pour surveiller les composés clés comme le glucose et l'acide lactique, aidant à maintenir l'équilibre nécessaire pour une production efficace.

Ces capteurs travaillent ensemble pour fournir les données détaillées nécessaires aux systèmes d'IA pour affiner les conditions de bioprocédés, assurant le succès de la production de viande cultivée.

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Author David Bell

About the Author

David Bell is the founder of Cultigen Group (parent of Cellbase) and contributing author on all the latest news. With over 25 years in business, founding & exiting several technology startups, he started Cultigen Group in anticipation of the coming regulatory approvals needed for this industry to blossom.

David has been a vegan since 2012 and so finds the space fascinating and fitting to be involved in... "It's exciting to envisage a future in which anyone can eat meat, whilst maintaining the morals around animal cruelty which first shifted my focus all those years ago"